More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BTH_II0333 on replicon NC_007650
Organism: Burkholderia thailandensis E264



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007650  BTH_II0333  outer membrane porin, putative  100 
 
 		 365 aa  725    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277065  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  75.49 
 
 		 376 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3623  porin  76.15 
 
 		 372 aa  517  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3897  porin  75.57 
 
 		 372 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.239452 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2492  outer membrane protein (porin)  75.29 
 
 		 372 aa  513  1e-144  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3529  porin  74.93 
 
 		 376 aa  509  1e-143  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327335 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5070  porin  75.58 
 
 		 372 aa  478  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.189644 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0155  porin  49.29 
 
 		 370 aa  282  6.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  39.94 
 
 		 359 aa  208  1e-52  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  32.41 
 
 		 357 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  33.62 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  32.4 
 
 		 356 aa  125  9e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  31.84 
 
 		 392 aa  124  3e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  31.23 
 
 		 356 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  31.23 
 
 		 356 aa  122  8e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  32.3 
 
 		 364 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  31.69 
 
 		 335 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  30.68 
 
 		 356 aa  119  7e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  32.05 
 
 		 363 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  32.34 
 
 		 449 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  32.05 
 
 		 363 aa  119  9e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  32.24 
 
 		 363 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  33.02 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  33.02 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  33.02 
 
 		 363 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  31.58 
 
 		 361 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  32.52 
 
 		 358 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  31.25 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  31.01 
 
 		 363 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  31.9 
 
 		 379 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  31.9 
 
 		 379 aa  116  6e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  30.51 
 
 		 363 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  33.53 
 
 		 389 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  31.56 
 
 		 351 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  31.75 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  30.92 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  31.75 
 
 		 363 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  32.46 
 
 		 386 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  31.06 
 
 		 358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6101  porin Gram-negative type  39.11 
 
 		 406 aa  114  3e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.353681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  33.81 
 
 		 384 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  29.69 
 
 		 358 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  29.46 
 
 		 367 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  29.38 
 
 		 358 aa  113  6e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  32.85 
 
 		 384 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  33.62 
 
 		 383 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  31.62 
 
 		 353 aa  112  8.000000000000001e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  30.38 
 
 		 358 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  30.38 
 
 		 387 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  32.76 
 
 		 386 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0881  putative outer membrane porin  37.39 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  31.2 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1016  outer membrane porin  37.39 
 
 		 358 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0587  putative outer membrane porin  37.39 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  31.2 
 
 		 354 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2322  outer membrane porin protein  37.39 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  33.43 
 
 		 385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1848  putative outer membrane porin  37.39 
 
 		 365 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0156948  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0374  OmpC family outer membrane porin  34.02 
 
 		 382 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.299269  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  32.94 
 
 		 389 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4118  porin Gram-negative type  30.81 
 
 		 342 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  31.23 
 
 		 393 aa  110  3e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  33.14 
 
 		 385 aa  110  3e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  31.16 
 
 		 376 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3809  porin  31.64 
 
 		 392 aa  110  4.0000000000000004e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.261808  normal  0.302186 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  31.86 
 
 		 338 aa  110  4.0000000000000004e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  32.53 
 
 		 353 aa  110  5e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  29.6 
 
 		 358 aa  110  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  32.01 
 
 		 390 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  30.06 
 
 		 358 aa  109  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  30.65 
 
 		 394 aa  110  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  31.62 
 
 		 383 aa  109  6e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4956  porin  29.49 
 
 		 347 aa  109  7.000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4912  porin  31.59 
 
 		 382 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203081  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  31.82 
 
 		 392 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  31.82 
 
 		 392 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1102  outer membrane porin  36.94 
 
 		 358 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5754  porin  31.09 
 
 		 368 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4550  porin  31.09 
 
 		 368 aa  109  1e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.537681 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  31 
 
 		 358 aa  108  1e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  38.66 
 
 		 381 aa  108  1e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5460  porin  31.32 
 
 		 382 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.376591 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  29.08 
 
 		 354 aa  107  2e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  37.56 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  32.02 
 
 		 394 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  29.34 
 
 		 358 aa  107  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6078  porin  30.57 
 
 		 390 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  38.71 
 
 		 371 aa  107  2e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  39.9 
 
 		 523 aa  107  3e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0545  OmpC family outer membrane porin  29.64 
 
 		 352 aa  107  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  29.33 
 
 		 354 aa  107  3e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  30.61 
 
 		 387 aa  107  4e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0054  outer membrane protein (porin)  32.96 
 
 		 382 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.914863  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1352  porin  30.53 
 
 		 377 aa  107  4e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  30.61 
 
 		 390 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  32.48 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6531  porin Gram-negative type  35.78 
 
 		 395 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.158369  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  28.48 
 
 		 358 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  28.48 
 
 		 358 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  28.48 
 
 		 358 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>