More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_B0545 on replicon NC_007952
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007952  Bxe_B0545  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 352 aa  706    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4118  porin Gram-negative type  83.14 
 
 		 342 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  40.35 
 
 		 356 aa  206  7e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  40.35 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  40.35 
 
 		 356 aa  204  2e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  38.82 
 
 		 356 aa  199  7.999999999999999e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  39.44 
 
 		 327 aa  196  5.000000000000001e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1214  hypothetical protein  57.89 
 
 		 221 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  31.07 
 
 		 349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  40.78 
 
 		 364 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  38.64 
 
 		 335 aa  103  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  31.23 
 
 		 350 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  31.23 
 
 		 350 aa  102  8e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1819  OmpC family outer membrane porin  43.33 
 
 		 364 aa  102  1e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223264  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  31.23 
 
 		 350 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0333  outer membrane porin, putative  29.15 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277065  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  30.1 
 
 		 376 aa  100  5e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  33.12 
 
 		 380 aa  99.8  7e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  28.43 
 
 		 338 aa  99.8  7e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  31.12 
 
 		 350 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  29.91 
 
 		 383 aa  98.6  2e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  28.84 
 
 		 359 aa  96.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5110  porin Gram-negative type  32.14 
 
 		 371 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6809  porin gram-negative type  37.04 
 
 		 359 aa  95.5  1e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357402  hitchhiker  0.0000584942 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  37.36 
 
 		 411 aa  94.7  2e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0155  porin  37.89 
 
 		 370 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3623  porin  30.05 
 
 		 372 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  41.38 
 
 		 396 aa  95.1  2e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  39.63 
 
 		 385 aa  94.4  3e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  35.45 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  33.99 
 
 		 380 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  39.63 
 
 		 389 aa  93.6  4e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6666  outer membrane protein (porin)  35.85 
 
 		 373 aa  93.6  4e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16051  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  39.02 
 
 		 385 aa  94  4e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3897  porin  29.89 
 
 		 372 aa  93.2  6e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.239452 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  43.94 
 
 		 398 aa  93.2  6e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  34.36 
 
 		 395 aa  92.8  7e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  37.1 
 
 		 391 aa  92.4  9e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  34.57 
 
 		 380 aa  92.8  9e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4878  porin  39.02 
 
 		 382 aa  92.4  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311549  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  33.83 
 
 		 379 aa  92  1e-17  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3529  porin  29.16 
 
 		 376 aa  91.7  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327335 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3786  putative outer membrane porin  43.08 
 
 		 391 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  38.62 
 
 		 471 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  36.46 
 
 		 380 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  37.8 
 
 		 383 aa  90.9  3e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1352  porin  38.33 
 
 		 377 aa  90.5  4e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  36.46 
 
 		 380 aa  89.7  6e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  38.41 
 
 		 386 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  38.41 
 
 		 386 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  45.28 
 
 		 389 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  38.41 
 
 		 386 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  38.41 
 
 		 386 aa  89.7  7e-17  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  38.41 
 
 		 386 aa  89.7  7e-17  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  38.89 
 
 		 376 aa  89.4  8e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  39.66 
 
 		 403 aa  89.4  8e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  38.41 
 
 		 436 aa  89.4  9e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  38.41 
 
 		 436 aa  89.4  9e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  37.8 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5070  porin  29.34 
 
 		 372 aa  88.6  1e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.189644 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  37.5 
 
 		 383 aa  89  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  41.18 
 
 		 391 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  37.87 
 
 		 394 aa  88.6  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  42.31 
 
 		 393 aa  88.2  2e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  34.36 
 
 		 395 aa  87.8  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2492  outer membrane protein (porin)  29.11 
 
 		 372 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  35.45 
 
 		 383 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6095  porin  34.95 
 
 		 405 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0168383  normal  0.319683 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  45.28 
 
 		 389 aa  88.2  2e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6404  porin Gram-negative type  32.21 
 
 		 359 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  42.75 
 
 		 387 aa  87.8  3e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  38.82 
 
 		 385 aa  87.4  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  36.26 
 
 		 395 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0008  OmpC family outer membrane porin  36.17 
 
 		 365 aa  87.4  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3848  porin  48.28 
 
 		 418 aa  87.4  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5613  porin  38.36 
 
 		 363 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000212183  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  29.84 
 
 		 368 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  34.07 
 
 		 390 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4019  porin Gram-negative type  33.86 
 
 		 379 aa  87  4e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000808591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5977  porin  38.36 
 
 		 363 aa  87  4e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297374  decreased coverage  0.000158153 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  39.53 
 
 		 384 aa  87.4  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  30.68 
 
 		 355 aa  87  4e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  38.41 
 
 		 385 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4307  porin  46.9 
 
 		 418 aa  87  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0314487  normal  0.78321 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0633  putative outer membrane porin  33.99 
 
 		 379 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  33.99 
 
 		 379 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  41.6 
 
 		 383 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  33.99 
 
 		 379 aa  87  5e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  41.6 
 
 		 383 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1796  putative outer membrane porin  33.99 
 
 		 379 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0933184  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5288  outer membrane porin  45.45 
 
 		 386 aa  86.7  5e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  38.41 
 
 		 385 aa  86.7  5e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0832  putative outer membrane porin  33.99 
 
 		 379 aa  87  5e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  38.41 
 
 		 385 aa  86.7  6e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  38.46 
 
 		 383 aa  86.3  7e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  37.42 
 
 		 430 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2131  OmpC family outer membrane porin  36.78 
 
 		 386 aa  86.3  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.283812  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  37.78 
 
 		 375 aa  86.3  7e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  37.42 
 
 		 430 aa  86.3  7e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  35.71 
 
 		 383 aa  86.3  8e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>