More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen2424_0155 on replicon NC_008542
Organism: Burkholderia cenocepacia HI2424



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008542  Bcen2424_0155  porin  100 
 
 		 370 aa  739    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  51.51 
 
 		 376 aa  292  5e-78  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3623  porin  52.52 
 
 		 372 aa  291  1e-77  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3897  porin  52.68 
 
 		 372 aa  290  2e-77  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.239452 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2492  outer membrane protein (porin)  51.78 
 
 		 372 aa  286  5.999999999999999e-76  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0333  outer membrane porin, putative  48.99 
 
 		 365 aa  283  4.0000000000000003e-75  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277065  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3529  porin  51.81 
 
 		 376 aa  277  2e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327335 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5070  porin  51.78 
 
 		 372 aa  258  2e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.189644 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  36.99 
 
 		 359 aa  204  3e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  35.33 
 
 		 357 aa  151  2e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  34.26 
 
 		 356 aa  142  7e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  33.8 
 
 		 356 aa  142  8e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  34.07 
 
 		 356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  34.07 
 
 		 356 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6666  outer membrane protein (porin)  32.45 
 
 		 373 aa  133  6e-30  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16051  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  35.59 
 
 		 354 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  35.59 
 
 		 354 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  32.25 
 
 		 364 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  32.67 
 
 		 327 aa  127  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  34.4 
 
 		 357 aa  125  1e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4019  porin Gram-negative type  33.33 
 
 		 379 aa  124  3e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000808591  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  31.34 
 
 		 363 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  33.33 
 
 		 358 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  33.15 
 
 		 353 aa  121  1.9999999999999998e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3435  porin  32.66 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4082  porin  33.33 
 
 		 362 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0820071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  33.33 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  30.19 
 
 		 377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  31.74 
 
 		 363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  31.74 
 
 		 363 aa  120  4.9999999999999996e-26  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  32.28 
 
 		 449 aa  119  7e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  31.4 
 
 		 363 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  32.78 
 
 		 338 aa  119  9.999999999999999e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3218  porin  32.58 
 
 		 373 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.819696  normal  0.0778047 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  32.34 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  31.58 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  30.19 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  31.29 
 
 		 392 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  32.13 
 
 		 436 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  32.34 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6157  porin  33.05 
 
 		 355 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0964625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  32.34 
 
 		 363 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  32.37 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  32.37 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  32.37 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  33.33 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  32.37 
 
 		 436 aa  117  3e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  32.37 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  32.37 
 
 		 386 aa  117  3e-25  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  33.33 
 
 		 356 aa  117  3e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  33.25 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0054  outer membrane protein (porin)  31.35 
 
 		 382 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.914863  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  33.25 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  28.95 
 
 		 355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  28.95 
 
 		 355 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  32.37 
 
 		 386 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4491  porin  30.73 
 
 		 358 aa  116  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.450812  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1352  porin  31.53 
 
 		 377 aa  116  6e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.198854 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  30.81 
 
 		 351 aa  116  7.999999999999999e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  31.19 
 
 		 379 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  31.19 
 
 		 379 aa  115  8.999999999999998e-25  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5460  porin  30.85 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.376591 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5890  porin  30.67 
 
 		 355 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  33.04 
 
 		 356 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2720  OmpC family outer membrane porin  29.38 
 
 		 387 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4912  porin  30.85 
 
 		 382 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.203081  normal  0.725846 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  31.17 
 
 		 361 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  30.27 
 
 		 400 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3381  porin  32.26 
 
 		 362 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.573075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  32.99 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3117  porin  30.65 
 
 		 375 aa  115  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0494554  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  33.42 
 
 		 383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3704  outer membrane porin  31.69 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.0181941 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  34.2 
 
 		 384 aa  114  3e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  27.81 
 
 		 373 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  33.43 
 
 		 383 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6067  porin  31.86 
 
 		 362 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0168259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  30.7 
 
 		 363 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  27.87 
 
 		 355 aa  114  4.0000000000000004e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  40.5 
 
 		 395 aa  113  6e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1084  porin transmembrane protein  32.49 
 
 		 364 aa  113  7.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00229533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  29.78 
 
 		 400 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  30.62 
 
 		 386 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  33.24 
 
 		 353 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  31.13 
 
 		 363 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  40.5 
 
 		 395 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  31.68 
 
 		 389 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  31.11 
 
 		 354 aa  112  9e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  31.39 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5227  porin  32.37 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0143813  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4597  porin  32.37 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000189593 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  32.56 
 
 		 389 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7056  porin Gram-negative type  31.85 
 
 		 357 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.38539 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  31.39 
 
 		 363 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  28.65 
 
 		 355 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  31.25 
 
 		 354 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5632  porin  32.37 
 
 		 382 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0304788  decreased coverage  0.00129343 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  39.5 
 
 		 395 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2734  outer membrane protein (porin)  31.85 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00626959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5219  porin  31.75 
 
 		 362 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10924  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>