More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bmul_6067 on replicon NC_010087
Organism: Burkholderia multivorans ATCC 17616



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008543  Bcen2424_3435  porin  85.91 
 
 
362 aa  647    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6067  porin  100 
 
 
362 aa  729    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0168259  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5219  porin  90.33 
 
 
362 aa  669    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10924  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3381  porin  91.16 
 
 
362 aa  673    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.573075  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4082  porin  87.02 
 
 
362 aa  636    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0820071  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2734  outer membrane protein (porin)  83.43 
 
 
362 aa  629  1e-179  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00626959  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3140  outer membrane protein (porin)  63.94 
 
 
363 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.448151  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4499  outer membrane protein (porin)  62.88 
 
 
363 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5135  outer membrane protein (porin)  62.88 
 
 
363 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.007051  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5724  outer membrane protein (porin)  62.88 
 
 
363 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4999  outer membrane protein (porin)  63.94 
 
 
363 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362759  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3150  outer membrane protein (porin)  65.03 
 
 
363 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0043  outer membrane porin OpcP  51.73 
 
 
366 aa  315  6e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0049  putative porin  51.73 
 
 
366 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2671  outer membrane porin, putative  51.73 
 
 
366 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0261  outer membrane porin precursor  51.73 
 
 
366 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3283  putative outer membrane porin  51.73 
 
 
366 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1844  putative outer membrane porin  51.73 
 
 
366 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2708  putative outer membrane porin  51.73 
 
 
366 aa  315  9.999999999999999e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.959736  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0049  putative porin  51.45 
 
 
366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30645  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4373  outer membrane protein (porin)-like  41.18 
 
 
351 aa  236  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  35.68 
 
 
380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  35.68 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  35.68 
 
 
380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  35.68 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  35.68 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  35.68 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  35.68 
 
 
383 aa  173  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  35.07 
 
 
383 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  36.23 
 
 
384 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  34.85 
 
 
481 aa  171  2e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  35.94 
 
 
379 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  35.94 
 
 
379 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  35.16 
 
 
379 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  35.16 
 
 
379 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  35.16 
 
 
379 aa  166  4e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  34.34 
 
 
380 aa  166  4e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  35.94 
 
 
379 aa  166  5e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  35.52 
 
 
384 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  35.83 
 
 
366 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  35.83 
 
 
366 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5769  putative outer membrane porin protein  32.56 
 
 
396 aa  164  2.0000000000000002e-39  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  35.35 
 
 
382 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  35.16 
 
 
379 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  35.14 
 
 
369 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  35.35 
 
 
382 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  34.39 
 
 
371 aa  162  9e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4271  porin  34.59 
 
 
370 aa  162  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  34.16 
 
 
386 aa  162  1e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  35.42 
 
 
385 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  35.42 
 
 
385 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  34.98 
 
 
385 aa  160  3e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  35.42 
 
 
385 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3019  outer membrane protein (porin)  35.31 
 
 
366 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  34.98 
 
 
385 aa  160  4e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  35.95 
 
 
380 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  34.07 
 
 
388 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  34.46 
 
 
382 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  32.83 
 
 
375 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  32.83 
 
 
375 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  34.46 
 
 
382 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  36.01 
 
 
380 aa  157  2e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  32.58 
 
 
375 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4499  porin Gram-negative type  35.29 
 
 
366 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0190258  normal  0.402207 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4631  porin Gram-negative type  35.29 
 
 
366 aa  156  4e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0562233  normal  0.0152866 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  36.01 
 
 
380 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  33.42 
 
 
381 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0730  OmpC family outer membrane porin  34.7 
 
 
369 aa  155  8e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0127031  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  35.75 
 
 
380 aa  155  9e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  34.44 
 
 
389 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  34.69 
 
 
381 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  35.13 
 
 
380 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  32.41 
 
 
375 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  35.23 
 
 
387 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  33.77 
 
 
379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  33.25 
 
 
386 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  35.73 
 
 
387 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  34.68 
 
 
380 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  33.42 
 
 
381 aa  152  8e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  33.68 
 
 
385 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  35.75 
 
 
379 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  33.58 
 
 
383 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  33.41 
 
 
389 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  34.39 
 
 
357 aa  149  5e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  34.66 
 
 
422 aa  149  6e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  32.65 
 
 
383 aa  149  7e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  33.85 
 
 
389 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0272  OmpC family outer membrane porin  34.28 
 
 
388 aa  149  7e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000181178  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  33.09 
 
 
391 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  34.73 
 
 
382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  35.19 
 
 
424 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  34.73 
 
 
382 aa  149  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  33.82 
 
 
436 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  33.82 
 
 
386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  33.33 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  33.82 
 
 
386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  33.33 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  33.82 
 
 
386 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  33.82 
 
 
386 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  33.33 
 
 
383 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>