More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BamMC406_3381 on replicon NC_010552
Organism: Burkholderia ambifaria MC40-6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010087  Bmul_6067  porin  91.16 
 
 		 362 aa  673    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0168259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3435  porin  90.33 
 
 		 362 aa  680    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4082  porin  90.61 
 
 		 362 aa  664    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0820071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2734  outer membrane protein (porin)  87.85 
 
 		 362 aa  665    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00626959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5219  porin  98.34 
 
 		 362 aa  720    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3381  porin  100 
 
 		 362 aa  729    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.573075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3140  outer membrane protein (porin)  64.33 
 
 		 363 aa  472  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.448151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5135  outer membrane protein (porin)  64.27 
 
 		 363 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.007051  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5724  outer membrane protein (porin)  64.27 
 
 		 363 aa  471  1e-132  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4499  outer membrane protein (porin)  64.27 
 
 		 363 aa  473  1e-132  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4999  outer membrane protein (porin)  64.04 
 
 		 363 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3150  outer membrane protein (porin)  63.87 
 
 		 363 aa  455  1e-127  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0049  putative porin  50.87 
 
 		 366 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30645  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2671  outer membrane porin, putative  50.58 
 
 		 366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0261  outer membrane porin precursor  50.58 
 
 		 366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0049  putative porin  50.58 
 
 		 366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3283  putative outer membrane porin  50.58 
 
 		 366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1844  putative outer membrane porin  50.58 
 
 		 366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2708  putative outer membrane porin  50.58 
 
 		 366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.959736  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0043  outer membrane porin OpcP  50 
 
 		 366 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4373  outer membrane protein (porin)-like  40.45 
 
 		 351 aa  236  6e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  38.28 
 
 		 379 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  38.28 
 
 		 379 aa  186  4e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  37.5 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  37.5 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  37.5 
 
 		 379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  36.27 
 
 		 380 aa  183  3e-45  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  38.02 
 
 		 379 aa  183  3e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  36.68 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  37.6 
 
 		 384 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  36.68 
 
 		 380 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  36.07 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  36.68 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  36.68 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  36.68 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  36.68 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  36.68 
 
 		 383 aa  181  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  37.5 
 
 		 379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  36.23 
 
 		 384 aa  179  5.999999999999999e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  35.7 
 
 		 481 aa  177  2e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  36.46 
 
 		 382 aa  176  7e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  36.46 
 
 		 382 aa  175  9e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  35.77 
 
 		 382 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  35.77 
 
 		 382 aa  173  5e-42  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  35.31 
 
 		 386 aa  171  2e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  35.49 
 
 		 381 aa  170  3e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  34.66 
 
 		 375 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  34.66 
 
 		 375 aa  169  7e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  34.64 
 
 		 388 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  36.7 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  34.41 
 
 		 375 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5769  putative outer membrane porin protein  32.05 
 
 		 396 aa  166  5e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  34.26 
 
 		 375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  35.29 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  35.87 
 
 		 369 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  34.92 
 
 		 371 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  35.29 
 
 		 366 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  33.92 
 
 		 381 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  33.9 
 
 		 386 aa  164  3e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  36.24 
 
 		 387 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  34.92 
 
 		 385 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  35.75 
 
 		 380 aa  160  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  35.86 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  35.86 
 
 		 385 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  35.44 
 
 		 380 aa  160  4e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  35.86 
 
 		 385 aa  160  4e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  35 
 
 		 385 aa  159  5e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  35 
 
 		 385 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  33.92 
 
 		 381 aa  159  8e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4271  porin  34.11 
 
 		 370 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3019  outer membrane protein (porin)  34.77 
 
 		 366 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  33.25 
 
 		 379 aa  157  3e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  35.82 
 
 		 384 aa  156  4e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  35.28 
 
 		 357 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0730  OmpC family outer membrane porin  34.49 
 
 		 369 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0127031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  35.42 
 
 		 380 aa  155  7e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  35.16 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0072  porin Gram-negative type  35.62 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  34.41 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  35.4 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  35.4 
 
 		 382 aa  155  1e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  33.42 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  35.4 
 
 		 424 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4499  porin Gram-negative type  34.27 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0190258  normal  0.402207 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  34.97 
 
 		 422 aa  154  2e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4631  porin Gram-negative type  34.27 
 
 		 366 aa  154  2e-36  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0562233  normal  0.0152866 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  35.16 
 
 		 380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  35.07 
 
 		 384 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  35.07 
 
 		 384 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  35.07 
 
 		 384 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  35.07 
 
 		 384 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  35.07 
 
 		 384 aa  152  8e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  34.45 
 
 		 388 aa  152  8e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  34.96 
 
 		 379 aa  152  8e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  33.66 
 
 		 389 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  35.16 
 
 		 375 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  33.17 
 
 		 391 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  32.58 
 
 		 386 aa  152  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  34.18 
 
 		 380 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  34.12 
 
 		 381 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>