More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_4082 on replicon NC_010515
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010515  Bcenmc03_4082  porin  100 
 
 
362 aa  728    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0820071  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3435  porin  97.51 
 
 
362 aa  714    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2734  outer membrane protein (porin)  91.71 
 
 
362 aa  682    Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00626959  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3381  porin  90.61 
 
 
362 aa  683    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.573075  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6067  porin  87.02 
 
 
362 aa  654    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0168259  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5219  porin  90.06 
 
 
362 aa  677    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10924  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3140  outer membrane protein (porin)  62.54 
 
 
363 aa  461  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.448151  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4499  outer membrane protein (porin)  62.05 
 
 
363 aa  462  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5135  outer membrane protein (porin)  62.05 
 
 
363 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.007051  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5724  outer membrane protein (porin)  62.05 
 
 
363 aa  461  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3150  outer membrane protein (porin)  63.29 
 
 
363 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4999  outer membrane protein (porin)  61.97 
 
 
363 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362759  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0049  putative porin  49.86 
 
 
366 aa  306  4.0000000000000004e-82  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30645  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2671  outer membrane porin, putative  49.57 
 
 
366 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3283  putative outer membrane porin  49.57 
 
 
366 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0261  outer membrane porin precursor  49.57 
 
 
366 aa  305  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2708  putative outer membrane porin  49.57 
 
 
366 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.959736  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1844  putative outer membrane porin  49.57 
 
 
366 aa  305  6e-82  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0049  putative porin  49.57 
 
 
366 aa  305  6e-82  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0043  outer membrane porin OpcP  48.99 
 
 
366 aa  304  1.0000000000000001e-81  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4373  outer membrane protein (porin)-like  41.5 
 
 
351 aa  238  2e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  37.6 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  37.6 
 
 
379 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  36.97 
 
 
384 aa  183  4.0000000000000006e-45  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  36.81 
 
 
379 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  36.07 
 
 
383 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  36.81 
 
 
379 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  36.81 
 
 
379 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  35.61 
 
 
380 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  36.81 
 
 
379 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  36.03 
 
 
379 aa  176  7e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  35.68 
 
 
380 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  35.68 
 
 
383 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  35.68 
 
 
380 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  35.68 
 
 
383 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  35.68 
 
 
383 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  35.68 
 
 
383 aa  176  8e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  35.68 
 
 
383 aa  176  8e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  36.05 
 
 
386 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  37.9 
 
 
384 aa  173  5e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  35.51 
 
 
481 aa  173  5e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  35.84 
 
 
382 aa  170  4e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  36.1 
 
 
382 aa  169  7e-41  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  34.92 
 
 
381 aa  169  7e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  35.08 
 
 
388 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5769  putative outer membrane porin protein  32.91 
 
 
396 aa  167  2e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  34.89 
 
 
386 aa  166  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  36.05 
 
 
382 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  36.05 
 
 
382 aa  166  5e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  35.39 
 
 
366 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  36.25 
 
 
387 aa  164  3e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  35.39 
 
 
366 aa  164  3e-39  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  35.54 
 
 
357 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  33.42 
 
 
381 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  34.59 
 
 
375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  34.59 
 
 
375 aa  163  5.0000000000000005e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  35.33 
 
 
369 aa  162  6e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  34.59 
 
 
375 aa  162  9e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  36.24 
 
 
387 aa  162  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  34.02 
 
 
371 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  33.25 
 
 
379 aa  160  4e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  33.67 
 
 
375 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4271  porin  34.81 
 
 
370 aa  159  9e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  35.6 
 
 
380 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  32.92 
 
 
381 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  34.37 
 
 
385 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  34.37 
 
 
385 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3019  outer membrane protein (porin)  34.5 
 
 
366 aa  157  3e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  33.5 
 
 
385 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  35.16 
 
 
380 aa  157  4e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  33.5 
 
 
385 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  34.37 
 
 
385 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1231  outer membrane porin  34.32 
 
 
432 aa  156  6e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0322  putative outer membrane porin  34.32 
 
 
383 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.12048  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0598  putative outer membrane porin  34.32 
 
 
383 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.00212421  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1339  putative outer membrane porin OpcP  34.32 
 
 
362 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.542311  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2491  outer membrane porin protein  34.32 
 
 
362 aa  155  8e-37  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  35.09 
 
 
422 aa  155  8e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0969  putative outer membrane porin  34.32 
 
 
397 aa  155  8e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  35.12 
 
 
385 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1504  outer membrane porin OpcP  34.05 
 
 
496 aa  155  1e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  33.59 
 
 
383 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  34.9 
 
 
380 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  33.83 
 
 
381 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  34.9 
 
 
380 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  35.2 
 
 
384 aa  153  5e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  34.64 
 
 
379 aa  152  7e-36  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  34.11 
 
 
382 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  34.64 
 
 
380 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  34.11 
 
 
382 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  32.83 
 
 
383 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  34.62 
 
 
383 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  34.62 
 
 
383 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  34.85 
 
 
374 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  34.11 
 
 
424 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0072  porin Gram-negative type  34.73 
 
 
385 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  37.12 
 
 
387 aa  151  2e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  32.44 
 
 
389 aa  150  3e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0730  OmpC family outer membrane porin  35.61 
 
 
369 aa  150  4e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0127031  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  32.89 
 
 
379 aa  149  5e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>