More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Reut_B5769 on replicon NC_007348
Organism: Ralstonia eutropha JMP134



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007348  Reut_B5769  putative outer membrane porin protein  100 
 
 		 396 aa  796    Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0049  putative porin  35.11 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30645  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0043  outer membrane porin OpcP  35.37 
 
 		 366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2671  outer membrane porin, putative  35.11 
 
 		 366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0261  outer membrane porin precursor  35.11 
 
 		 366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0049  putative porin  35.11 
 
 		 366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2708  putative outer membrane porin  35.11 
 
 		 366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.959736  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1844  putative outer membrane porin  35.11 
 
 		 366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3283  putative outer membrane porin  35.11 
 
 		 366 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4999  outer membrane protein (porin)  32.3 
 
 		 363 aa  170  4e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5219  porin  32.31 
 
 		 362 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3140  outer membrane protein (porin)  31.46 
 
 		 363 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.448151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3381  porin  32.05 
 
 		 362 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.573075  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5135  outer membrane protein (porin)  31.66 
 
 		 363 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.007051  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5724  outer membrane protein (porin)  31.66 
 
 		 363 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4082  porin  33.24 
 
 		 362 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0820071  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6067  porin  32.56 
 
 		 362 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0168259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4499  outer membrane protein (porin)  31.78 
 
 		 363 aa  165  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3435  porin  32.38 
 
 		 362 aa  164  4.0000000000000004e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2734  outer membrane protein (porin)  32.74 
 
 		 362 aa  162  7e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00626959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3150  outer membrane protein (porin)  31.12 
 
 		 363 aa  158  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4373  outer membrane protein (porin)-like  29.5 
 
 		 351 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  31.7 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  31.7 
 
 		 382 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  32.1 
 
 		 377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0849  OmpC family outer membrane porin  30.17 
 
 		 384 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0153062  normal  0.0195066 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0730  OmpC family outer membrane porin  27.38 
 
 		 369 aa  117  3e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0127031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  30.69 
 
 		 379 aa  116  6e-25  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1012  OmpC family outer membrane porin  27.85 
 
 		 375 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000562807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  27.42 
 
 		 382 aa  114  3e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  26.73 
 
 		 382 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  29.55 
 
 		 383 aa  112  9e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  31.6 
 
 		 377 aa  112  9e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  29.81 
 
 		 411 aa  111  2.0000000000000002e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  29.86 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  27.79 
 
 		 380 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  27.95 
 
 		 375 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  28.05 
 
 		 436 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  28.16 
 
 		 383 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  28.05 
 
 		 386 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  28.05 
 
 		 386 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  28.05 
 
 		 386 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  28.05 
 
 		 386 aa  110  6e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  28.05 
 
 		 386 aa  110  6e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  31.15 
 
 		 384 aa  110  6e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  29.59 
 
 		 383 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  29.12 
 
 		 385 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  31.98 
 
 		 363 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  29.12 
 
 		 385 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  28.05 
 
 		 386 aa  109  1e-22  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  27.74 
 
 		 379 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  27.83 
 
 		 436 aa  108  2e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  29.24 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  27.6 
 
 		 395 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  28.31 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  29.61 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  29.61 
 
 		 383 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  29.02 
 
 		 379 aa  106  6e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4499  porin Gram-negative type  29.2 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0190258  normal  0.402207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  27.86 
 
 		 394 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4631  porin Gram-negative type  29.2 
 
 		 366 aa  105  2e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0562233  normal  0.0152866 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  29.71 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  28.92 
 
 		 379 aa  105  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  27.36 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  28.85 
 
 		 380 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  29.23 
 
 		 386 aa  104  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  27.36 
 
 		 375 aa  104  3e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  28.64 
 
 		 379 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  28.64 
 
 		 379 aa  104  4e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  28.64 
 
 		 379 aa  103  4e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  28.64 
 
 		 379 aa  104  4e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1014  porin Gram-negative type  28.41 
 
 		 402 aa  103  5e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.303268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  27.92 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  27.92 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  28.43 
 
 		 381 aa  103  6e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  29.71 
 
 		 380 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  29.45 
 
 		 386 aa  103  7e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  26.76 
 
 		 379 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  28.05 
 
 		 395 aa  102  9e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  26.76 
 
 		 379 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  26.76 
 
 		 379 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  28.4 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  30.85 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  26.76 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  30.53 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  27.59 
 
 		 389 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  26.76 
 
 		 379 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  26.77 
 
 		 389 aa  100  3e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  28.71 
 
 		 386 aa  101  3e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  28.78 
 
 		 379 aa  100  3e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  30.27 
 
 		 380 aa  100  3e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  27.32 
 
 		 384 aa  100  4e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  26.41 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  27.73 
 
 		 381 aa  100  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  27.06 
 
 		 481 aa  100  7e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  26.59 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  26.59 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  26.59 
 
 		 383 aa  99  1e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  27.88 
 
 		 380 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  26.33 
 
 		 375 aa  99  1e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>