More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcen_5135 on replicon NC_008061
Organism: Burkholderia cenocepacia AU 1054



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010552  BamMC406_3140  outer membrane protein (porin)  88.71 
 
 
363 aa  664    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.448151  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3150  outer membrane protein (porin)  93.11 
 
 
363 aa  668    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5724  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
363 aa  733    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5135  outer membrane protein (porin)  100 
 
 
363 aa  733    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.007051  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4999  outer membrane protein (porin)  89.81 
 
 
363 aa  667    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362759  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4499  outer membrane protein (porin)  97.8 
 
 
363 aa  719    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3381  porin  64.27 
 
 
362 aa  471  1e-132  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.573075  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5219  porin  63.71 
 
 
362 aa  468  1.0000000000000001e-131  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10924  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2734  outer membrane protein (porin)  62.88 
 
 
362 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00626959  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6067  porin  62.88 
 
 
362 aa  463  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0168259  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3435  porin  62.82 
 
 
362 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4082  porin  62.05 
 
 
362 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0820071  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0043  outer membrane porin OpcP  51.43 
 
 
366 aa  313  2.9999999999999996e-84  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0049  putative porin  51.43 
 
 
366 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30645  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2708  putative outer membrane porin  51.43 
 
 
366 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.959736  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2671  outer membrane porin, putative  51.43 
 
 
366 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0261  outer membrane porin precursor  51.43 
 
 
366 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0049  putative porin  51.43 
 
 
366 aa  311  1e-83  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3283  putative outer membrane porin  51.43 
 
 
366 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1844  putative outer membrane porin  51.43 
 
 
366 aa  311  1e-83  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4373  outer membrane protein (porin)-like  42.62 
 
 
351 aa  233  3e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  36.94 
 
 
384 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  37.03 
 
 
383 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  37.03 
 
 
383 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  37.03 
 
 
383 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  37.03 
 
 
383 aa  177  2e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  37.03 
 
 
383 aa  177  2e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  37.57 
 
 
380 aa  177  3e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  37.57 
 
 
380 aa  177  3e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  37.03 
 
 
481 aa  175  9e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  35.12 
 
 
379 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  35.12 
 
 
379 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  36.27 
 
 
375 aa  172  6.999999999999999e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  37.33 
 
 
369 aa  172  7.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  36.56 
 
 
382 aa  170  3e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  36.27 
 
 
375 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  36.27 
 
 
375 aa  170  4e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  36.57 
 
 
383 aa  169  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  34.32 
 
 
379 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  34.32 
 
 
379 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  34.32 
 
 
379 aa  168  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  34.91 
 
 
381 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  35.56 
 
 
388 aa  168  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  36.81 
 
 
387 aa  169  1e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  36.66 
 
 
379 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  36.16 
 
 
379 aa  167  4e-40  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  36.41 
 
 
379 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  36.41 
 
 
379 aa  166  5e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  36.41 
 
 
379 aa  166  5e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5769  putative outer membrane porin protein  31.66 
 
 
396 aa  166  5.9999999999999996e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  34.32 
 
 
380 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  34.51 
 
 
379 aa  165  9e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  36.16 
 
 
379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  36.02 
 
 
375 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  34.32 
 
 
379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  35.89 
 
 
384 aa  164  3e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  36.3 
 
 
383 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4631  porin Gram-negative type  35.95 
 
 
366 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0562233  normal  0.0152866 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4499  porin Gram-negative type  35.95 
 
 
366 aa  163  4.0000000000000004e-39  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0190258  normal  0.402207 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  34.89 
 
 
387 aa  162  6e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  35.14 
 
 
382 aa  162  7e-39  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  36.05 
 
 
383 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  36.14 
 
 
384 aa  161  1e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4271  porin  35.81 
 
 
370 aa  160  2e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  34.84 
 
 
385 aa  161  2e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  35.09 
 
 
380 aa  161  2e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  36.39 
 
 
374 aa  160  3e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  35.48 
 
 
383 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0482  outer membrane protein (porin)  35.01 
 
 
357 aa  159  6e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1016  outer membrane porin  36.89 
 
 
358 aa  159  8e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.308629  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  35.64 
 
 
381 aa  159  1e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  32.6 
 
 
389 aa  158  1e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  34.73 
 
 
386 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  35.75 
 
 
383 aa  157  2e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  35.25 
 
 
380 aa  157  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  32.83 
 
 
381 aa  155  8e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  33.07 
 
 
396 aa  155  9e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  33.17 
 
 
386 aa  155  1e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  34.22 
 
 
379 aa  154  2e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  33.25 
 
 
389 aa  154  2e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  35.37 
 
 
379 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  34.91 
 
 
385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  33.08 
 
 
381 aa  153  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  34.91 
 
 
385 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  34.91 
 
 
385 aa  153  4e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3019  outer membrane protein (porin)  34.77 
 
 
366 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  34.31 
 
 
383 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  33.66 
 
 
389 aa  152  1e-35  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  35.22 
 
 
384 aa  152  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  34.56 
 
 
383 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  34.56 
 
 
383 aa  152  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0730  OmpC family outer membrane porin  33.52 
 
 
369 aa  151  1e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0127031  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  33.51 
 
 
367 aa  150  3e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0587  putative outer membrane porin  35.38 
 
 
365 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2322  outer membrane porin protein  35.38 
 
 
365 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1848  putative outer membrane porin  35.38 
 
 
365 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0156948  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  34.56 
 
 
397 aa  150  4e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  34.99 
 
 
388 aa  150  4e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0881  putative outer membrane porin  35.38 
 
 
365 aa  150  4e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1471  OmpC family outer membrane porin  32.81 
 
 
371 aa  149  5e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.620688  normal  0.0669938 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>