More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BMASAVP1_A3283 on replicon NC_008785
Organism: Burkholderia mallei SAVP1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_006348  BMA2671  outer membrane porin, putative  100 
 
 		 366 aa  734    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1844  putative outer membrane porin  100 
 
 		 366 aa  734    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0261  outer membrane porin precursor  100 
 
 		 366 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3283  putative outer membrane porin  100 
 
 		 366 aa  734    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0049  putative porin  100 
 
 		 366 aa  734    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0043  outer membrane porin OpcP  97.54 
 
 		 366 aa  696    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2708  putative outer membrane porin  100 
 
 		 366 aa  734    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.959736  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0049  putative porin  99.45 
 
 		 366 aa  731    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30645  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3140  outer membrane protein (porin)  50.68 
 
 		 363 aa  325  8.000000000000001e-88  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.448151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5219  porin  50.83 
 
 		 362 aa  323  4e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6067  porin  51.37 
 
 		 362 aa  322  8e-87  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0168259  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2734  outer membrane protein (porin)  51.79 
 
 		 362 aa  320  1.9999999999999998e-86  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00626959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4999  outer membrane protein (porin)  50.68 
 
 		 363 aa  320  3e-86  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362759  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3381  porin  50.28 
 
 		 362 aa  319  3.9999999999999996e-86  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.573075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4499  outer membrane protein (porin)  50.13 
 
 		 363 aa  314  1.9999999999999998e-84  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5135  outer membrane protein (porin)  50.13 
 
 		 363 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.007051  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5724  outer membrane protein (porin)  50.13 
 
 		 363 aa  313  3.9999999999999997e-84  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3150  outer membrane protein (porin)  51.71 
 
 		 363 aa  312  5.999999999999999e-84  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3435  porin  49.58 
 
 		 362 aa  308  1.0000000000000001e-82  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4082  porin  49.32 
 
 		 362 aa  298  8e-80  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0820071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4373  outer membrane protein (porin)-like  43.09 
 
 		 351 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  39.36 
 
 		 384 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  38.63 
 
 		 388 aa  193  3e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  37.47 
 
 		 387 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  36.5 
 
 		 379 aa  177  2e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5769  putative outer membrane porin protein  34.68 
 
 		 396 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  39.02 
 
 		 387 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  35.21 
 
 		 383 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  36.63 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  35.48 
 
 		 381 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  35.64 
 
 		 381 aa  169  7e-41  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  35.14 
 
 		 388 aa  168  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  36.3 
 
 		 384 aa  168  1e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  35.54 
 
 		 381 aa  168  2e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  35.5 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  35.5 
 
 		 375 aa  167  2e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  36.8 
 
 		 381 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  34.56 
 
 		 369 aa  166  4e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  35.57 
 
 		 379 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  35.32 
 
 		 379 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  35.32 
 
 		 379 aa  165  9e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  35.6 
 
 		 385 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  35.6 
 
 		 385 aa  165  9e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  36.63 
 
 		 387 aa  165  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  35.32 
 
 		 379 aa  165  9e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  35.32 
 
 		 379 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  34.32 
 
 		 386 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  35.34 
 
 		 385 aa  163  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  35.61 
 
 		 377 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  34.07 
 
 		 386 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  35.88 
 
 		 422 aa  163  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  34.75 
 
 		 375 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  34.99 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  35.73 
 
 		 383 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  36.07 
 
 		 379 aa  161  2e-38  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  34.99 
 
 		 382 aa  161  2e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  35.62 
 
 		 424 aa  160  3e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  35.06 
 
 		 387 aa  160  3e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  35.16 
 
 		 375 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  35.54 
 
 		 379 aa  159  7e-38  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  36.98 
 
 		 380 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  36.03 
 
 		 380 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  34.34 
 
 		 381 aa  156  5.0000000000000005e-37  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  35.59 
 
 		 392 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  34.74 
 
 		 385 aa  156  7e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  33.74 
 
 		 381 aa  155  7e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  34.65 
 
 		 384 aa  155  1e-36  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  34.74 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  34.74 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  34.1 
 
 		 376 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0730  OmpC family outer membrane porin  34.84 
 
 		 369 aa  154  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0127031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  34.31 
 
 		 383 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  34.95 
 
 		 387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  34.06 
 
 		 383 aa  153  5e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  34.15 
 
 		 380 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  34.74 
 
 		 379 aa  152  8e-36  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  34.8 
 
 		 383 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  34.8 
 
 		 383 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  33.66 
 
 		 380 aa  151  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  33.66 
 
 		 380 aa  151  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  33.66 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  33.66 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  33.66 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6482  porin  34.19 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0226396  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6717  porin  34.19 
 
 		 382 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.653963  normal  0.435902 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  33.85 
 
 		 379 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  34.39 
 
 		 380 aa  150  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  33.66 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  34.17 
 
 		 389 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  34.09 
 
 		 374 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  33.66 
 
 		 383 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  33.59 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  33.59 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  33.59 
 
 		 379 aa  150  3e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  36.99 
 
 		 362 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  36.99 
 
 		 362 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  36.99 
 
 		 362 aa  149  6e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  33.73 
 
 		 391 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  33.66 
 
 		 481 aa  149  8e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2206  outer membrane porin  33.94 
 
 		 387 aa  149  9e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0690503  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>