More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bxe_C0730 on replicon NC_007953
Organism: Burkholderia xenovorans LB400



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007953  Bxe_C0730  OmpC family outer membrane porin  100 
 
 		 369 aa  745    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0127031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  37.56 
 
 		 384 aa  183  5.0000000000000004e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  36.86 
 
 		 387 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  36.13 
 
 		 388 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  35.12 
 
 		 384 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  32.59 
 
 		 381 aa  160  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2734  outer membrane protein (porin)  35.75 
 
 		 362 aa  159  5e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00626959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5219  porin  35.52 
 
 		 362 aa  159  6e-38  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  32.27 
 
 		 381 aa  158  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  33.59 
 
 		 375 aa  157  3e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3381  porin  34.49 
 
 		 362 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.573075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3140  outer membrane protein (porin)  34 
 
 		 363 aa  156  7e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.448151  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6067  porin  34.7 
 
 		 362 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0168259  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  31.5 
 
 		 396 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  34.56 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4999  outer membrane protein (porin)  33.71 
 
 		 363 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362759  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  33.07 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  33.07 
 
 		 375 aa  154  2e-36  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  31.63 
 
 		 394 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  33.98 
 
 		 386 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  32.41 
 
 		 383 aa  153  4e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  32.57 
 
 		 375 aa  153  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  31.57 
 
 		 381 aa  152  7e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  33.08 
 
 		 383 aa  152  8.999999999999999e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2671  outer membrane porin, putative  35.38 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0261  outer membrane porin precursor  35.38 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0049  putative porin  35.38 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3283  putative outer membrane porin  35.38 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3150  outer membrane protein (porin)  32.95 
 
 		 363 aa  151  1e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2708  putative outer membrane porin  35.38 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.959736  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5135  outer membrane protein (porin)  33.52 
 
 		 363 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.007051  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0043  outer membrane porin OpcP  35.1 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1844  putative outer membrane porin  35.38 
 
 		 366 aa  152  1e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5724  outer membrane protein (porin)  33.52 
 
 		 363 aa  151  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1698  putative outer membrane porin  33.16 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0049  putative porin  35.38 
 
 		 366 aa  151  2e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30645  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4373  outer membrane protein (porin)-like  33.52 
 
 		 351 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  32.26 
 
 		 387 aa  151  2e-35  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  33.16 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1674  putative outer membrane porin  33.16 
 
 		 411 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.264148  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3435  porin  34.77 
 
 		 362 aa  151  2e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  31.39 
 
 		 394 aa  151  2e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0554  putative outer membrane porin  33.16 
 
 		 384 aa  151  2e-35  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.830781  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  33.16 
 
 		 430 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  33.16 
 
 		 430 aa  150  4e-35  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4499  outer membrane protein (porin)  33.24 
 
 		 363 aa  149  5e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2277  outer membrane porin  33.16 
 
 		 384 aa  150  5e-35  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  33.08 
 
 		 383 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  33.08 
 
 		 383 aa  150  5e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  34.12 
 
 		 376 aa  149  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  32.28 
 
 		 379 aa  147  3e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  33.83 
 
 		 384 aa  147  3e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2135  porin  34.91 
 
 		 422 aa  147  3e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  32.16 
 
 		 390 aa  147  3e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  32.36 
 
 		 386 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  33.42 
 
 		 523 aa  147  4.0000000000000006e-34  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  32.2 
 
 		 380 aa  146  5e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  33.15 
 
 		 362 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  33.15 
 
 		 362 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  33.15 
 
 		 362 aa  146  6e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1801  putative porin-related protein  35.36 
 
 		 424 aa  146  7.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0370  outer membrane porin  35.36 
 
 		 382 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  33.33 
 
 		 394 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0466  outer membrane porin  35.36 
 
 		 382 aa  145  8.000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.965464  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  32.51 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4082  porin  36.62 
 
 		 362 aa  145  1e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0820071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  32.51 
 
 		 386 aa  145  1e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  33.33 
 
 		 395 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  32.16 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  32.26 
 
 		 385 aa  144  2e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  34.2 
 
 		 388 aa  144  2e-33  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  32.16 
 
 		 390 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  33.07 
 
 		 383 aa  144  2e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  32.2 
 
 		 386 aa  144  2e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  32.2 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  32.2 
 
 		 386 aa  144  3e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  32.01 
 
 		 385 aa  144  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  32.93 
 
 		 386 aa  143  4e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  33.07 
 
 		 395 aa  144  4e-33  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  32.44 
 
 		 390 aa  143  4e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  33.86 
 
 		 377 aa  142  6e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  30.75 
 
 		 380 aa  142  7e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  32.72 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  32.72 
 
 		 379 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  32.72 
 
 		 386 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  32.57 
 
 		 380 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  32.46 
 
 		 379 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  32.2 
 
 		 390 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  30.96 
 
 		 389 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7819  porin  32.78 
 
 		 386 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2370  outer membrane porin OpcP  29.5 
 
 		 419 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  30.79 
 
 		 382 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  32.57 
 
 		 380 aa  140  3e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  30.71 
 
 		 382 aa  140  3e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  31.94 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  31.94 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  31.94 
 
 		 385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  31.94 
 
 		 379 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  32.58 
 
 		 387 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  31.94 
 
 		 385 aa  140  3.9999999999999997e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>