More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_4999 on replicon NC_008391
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008391  Bamb_4999  outer membrane protein (porin)  100 
 
 		 363 aa  733    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.362759  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3150  outer membrane protein (porin)  90.36 
 
 		 363 aa  640    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.343468  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5724  outer membrane protein (porin)  89.81 
 
 		 363 aa  667    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4499  outer membrane protein (porin)  90.63 
 
 		 363 aa  671    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3140  outer membrane protein (porin)  96.69 
 
 		 363 aa  712    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.448151  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5135  outer membrane protein (porin)  89.81 
 
 		 363 aa  667    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.007051  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3381  porin  64.04 
 
 		 362 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.573075  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2734  outer membrane protein (porin)  63.48 
 
 		 362 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.00626959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5219  porin  64.04 
 
 		 362 aa  464  1e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10924  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6067  porin  63.94 
 
 		 362 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0168259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3435  porin  61.5 
 
 		 362 aa  454  1.0000000000000001e-126  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4082  porin  61.97 
 
 		 362 aa  441  9.999999999999999e-123  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0820071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0043  outer membrane porin OpcP  52.31 
 
 		 366 aa  318  1e-85  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0049  putative porin  52.02 
 
 		 366 aa  317  1e-85  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.30645  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2671  outer membrane porin, putative  52.02 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0261  outer membrane porin precursor  52.02 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2708  putative outer membrane porin  52.02 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.959736  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1844  putative outer membrane porin  52.02 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0049  putative porin  52.02 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3283  putative outer membrane porin  52.02 
 
 		 366 aa  317  2e-85  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4373  outer membrane protein (porin)-like  42.34 
 
 		 351 aa  235  9e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0705727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  37.91 
 
 		 384 aa  182  8.000000000000001e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  36 
 
 		 383 aa  176  5e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2192  OmpC family outer membrane porin  37.91 
 
 		 387 aa  176  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.711966 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  36.57 
 
 		 384 aa  174  1.9999999999999998e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  35.77 
 
 		 375 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  36.36 
 
 		 388 aa  174  2.9999999999999996e-42  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6299  porin Gram-negative type  36.57 
 
 		 369 aa  172  5.999999999999999e-42  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  37.57 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  37.57 
 
 		 380 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  37.57 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  37.57 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  37.57 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  37.57 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  37.57 
 
 		 383 aa  171  2e-41  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5769  putative outer membrane porin protein  32.3 
 
 		 396 aa  170  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  35.52 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  35.52 
 
 		 375 aa  170  3e-41  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  35.29 
 
 		 379 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  35.29 
 
 		 379 aa  169  5e-41  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  35.96 
 
 		 381 aa  169  6e-41  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4631  porin Gram-negative type  36.24 
 
 		 366 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0562233  normal  0.0152866 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  37.03 
 
 		 481 aa  169  8e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4499  porin Gram-negative type  36.24 
 
 		 366 aa  169  8e-41  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0190258  normal  0.402207 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  34.78 
 
 		 379 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  35.25 
 
 		 380 aa  169  1e-40  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  35.59 
 
 		 375 aa  169  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  34.78 
 
 		 379 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  34.78 
 
 		 379 aa  169  1e-40  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  36.3 
 
 		 383 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  35.75 
 
 		 382 aa  167  2e-40  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  34.48 
 
 		 386 aa  167  4e-40  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  34.9 
 
 		 386 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  36.32 
 
 		 383 aa  165  9e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  36.66 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  35.32 
 
 		 380 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2803  outer membrane protein (porin)  35.96 
 
 		 387 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0760601  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  34.62 
 
 		 379 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0404  outer membrane protein (porin)  34.44 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5024  porin  34.2 
 
 		 397 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5248  porin  34.44 
 
 		 421 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3119  porin  34.44 
 
 		 421 aa  164  3e-39  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  34.62 
 
 		 391 aa  162  7e-39  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4842  porin  35.57 
 
 		 385 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5427  porin  35.57 
 
 		 385 aa  162  8.000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.914056  normal  0.467276 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  34.81 
 
 		 379 aa  162  1e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  35.57 
 
 		 385 aa  162  1e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  36.96 
 
 		 384 aa  161  1e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  34.8 
 
 		 383 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  34.8 
 
 		 383 aa  160  2e-38  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  34.89 
 
 		 389 aa  161  2e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  33.99 
 
 		 381 aa  159  5e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  34.4 
 
 		 389 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  32.66 
 
 		 389 aa  159  6e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  34.31 
 
 		 383 aa  158  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  34.06 
 
 		 382 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3463  porin  33.73 
 
 		 445 aa  158  1e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  34.66 
 
 		 380 aa  159  1e-37  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  34.58 
 
 		 385 aa  158  2e-37  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5137  porin  34.83 
 
 		 397 aa  158  2e-37  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.918884  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  35.15 
 
 		 384 aa  157  2e-37  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  35.17 
 
 		 379 aa  157  4e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4608  porin  34.56 
 
 		 397 aa  157  4e-37  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4637  porin Gram-negative type  33.73 
 
 		 397 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.546229 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  35.96 
 
 		 379 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  36.01 
 
 		 383 aa  156  5.0000000000000005e-37  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4271  porin  35.08 
 
 		 370 aa  156  6e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  35.29 
 
 		 379 aa  156  6e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  35.71 
 
 		 379 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  35.71 
 
 		 379 aa  155  7e-37  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  35.71 
 
 		 379 aa  155  7e-37  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  33.33 
 
 		 389 aa  155  8e-37  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  35.77 
 
 		 383 aa  155  1e-36  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0730  OmpC family outer membrane porin  33.71 
 
 		 369 aa  155  1e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0127031  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  33.91 
 
 		 385 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  36.39 
 
 		 380 aa  155  1e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  36.39 
 
 		 380 aa  154  2e-36  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  35.47 
 
 		 379 aa  154  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  33.67 
 
 		 383 aa  154  2e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  33.66 
 
 		 385 aa  155  2e-36  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>