More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_4271 on replicon NC_010623
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010623  Bphy_4271  porin  100 
 
 		 370 aa  743    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  44.85 
 
 		 381 aa  292  5e-78  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  45.57 
 
 		 383 aa  283  5.000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  45.05 
 
 		 383 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  44.1 
 
 		 383 aa  282  8.000000000000001e-75  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  45.38 
 
 		 381 aa  281  1e-74  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  45.16 
 
 		 374 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  43.85 
 
 		 383 aa  279  5e-74  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  45.34 
 
 		 381 aa  278  1e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  45.08 
 
 		 379 aa  277  2e-73  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  45.71 
 
 		 380 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  45.71 
 
 		 380 aa  273  3e-72  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  43.41 
 
 		 381 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  44.47 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  44.47 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  44.47 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  44.47 
 
 		 379 aa  271  1e-71  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  44.47 
 
 		 379 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  45.43 
 
 		 384 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  43.6 
 
 		 375 aa  270  4e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  45.5 
 
 		 377 aa  269  7e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  43.86 
 
 		 375 aa  268  1e-70  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  44.33 
 
 		 384 aa  266  4e-70  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  44.69 
 
 		 377 aa  266  5.999999999999999e-70  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  43.34 
 
 		 375 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  43.34 
 
 		 375 aa  265  7e-70  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  44.33 
 
 		 384 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  44.33 
 
 		 384 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  44.33 
 
 		 384 aa  265  8.999999999999999e-70  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  44.86 
 
 		 379 aa  265  1e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  44.07 
 
 		 384 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  44.07 
 
 		 384 aa  263  3e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  45.26 
 
 		 392 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  42.53 
 
 		 384 aa  261  1e-68  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  43.44 
 
 		 379 aa  260  2e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  41.22 
 
 		 396 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  43.56 
 
 		 384 aa  258  1e-67  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  41.21 
 
 		 394 aa  257  2e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  43.04 
 
 		 394 aa  257  3e-67  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  42.57 
 
 		 383 aa  257  3e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  41.27 
 
 		 386 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  42.29 
 
 		 387 aa  256  6e-67  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  40.62 
 
 		 386 aa  253  3e-66  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  40.15 
 
 		 403 aa  252  7e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  45.48 
 
 		 374 aa  251  1e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  44.41 
 
 		 363 aa  251  2e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  45.22 
 
 		 374 aa  250  2e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  44.96 
 
 		 374 aa  250  3e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  45.22 
 
 		 374 aa  250  3e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  43.17 
 
 		 380 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  43.63 
 
 		 380 aa  249  5e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  44.99 
 
 		 376 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  44.99 
 
 		 376 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  44.99 
 
 		 376 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  44.99 
 
 		 376 aa  249  6e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  41.8 
 
 		 386 aa  249  6e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  43.63 
 
 		 380 aa  248  9e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  41.44 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  41.44 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  41.44 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  41.44 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  44.66 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  44.66 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  41.44 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  41.44 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  41.44 
 
 		 384 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  44.66 
 
 		 362 aa  248  1e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  41.6 
 
 		 390 aa  247  2e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  43.17 
 
 		 379 aa  246  4e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  44.96 
 
 		 374 aa  246  4e-64  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  42.26 
 
 		 380 aa  246  4.9999999999999997e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1988  outer membrane porin  41.95 
 
 		 407 aa  245  8e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  41.07 
 
 		 381 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4101  porin  42.29 
 
 		 372 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  40.11 
 
 		 414 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  42.03 
 
 		 375 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2144  outer membrane protein  41.69 
 
 		 419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0977931  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  39.6 
 
 		 471 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2370  outer membrane porin OpcP  41.27 
 
 		 419 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1125  outer membrane porin OpcP, putative  41.69 
 
 		 407 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.61922  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0932  putative outer membrane porin  41.69 
 
 		 407 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1567  putative outer membrane porin  41.69 
 
 		 407 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0706686  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2009  outer membrane porin  41.69 
 
 		 407 aa  243  5e-63  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0227  putative outer membrane porin  41.69 
 
 		 407 aa  243  5e-63  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  40.26 
 
 		 384 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  42.71 
 
 		 376 aa  242  7.999999999999999e-63  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  39.74 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  39.74 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  39.74 
 
 		 384 aa  241  1e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4385  outer membrane protein, (porin)  38.78 
 
 		 380 aa  241  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  41.6 
 
 		 380 aa  240  2e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  38.7 
 
 		 383 aa  240  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0393  OmpC family outer membrane porin  38.68 
 
 		 386 aa  239  4e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.728955  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  42.23 
 
 		 383 aa  239  4e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5355  porin Gram-negative type  44.26 
 
 		 383 aa  238  9e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.483069 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  41.05 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  41.05 
 
 		 366 aa  238  1e-61  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  40.83 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3950  porin  40.05 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4416  porin  40.05 
 
 		 403 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545214  normal  0.669739 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>