More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_A4385 on replicon NC_007510
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007510  Bcep18194_A4385  outer membrane protein, (porin)  100 
 
 		 380 aa  776    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6642  porin  45.14 
 
 		 386 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000730188  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  46.08 
 
 		 386 aa  286  2.9999999999999996e-76  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  44.64 
 
 		 381 aa  285  1.0000000000000001e-75  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1250  OmpC family outer membrane porin  45.21 
 
 		 376 aa  281  2e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.748402  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  44.76 
 
 		 381 aa  279  5e-74  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  43.14 
 
 		 383 aa  278  9e-74  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  45.39 
 
 		 409 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  45.39 
 
 		 409 aa  277  2e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  43.81 
 
 		 375 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  43.81 
 
 		 375 aa  276  3e-73  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  42.89 
 
 		 383 aa  277  3e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  45.39 
 
 		 391 aa  276  5e-73  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  43.22 
 
 		 381 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  43.91 
 
 		 379 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  43.65 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  44.07 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0524  porin  44.53 
 
 		 374 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000201406  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  43.65 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7203  porin Gram-negative type  45.03 
 
 		 386 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  44.07 
 
 		 375 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  43.65 
 
 		 379 aa  274  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  43.4 
 
 		 379 aa  273  4.0000000000000004e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  44.2 
 
 		 379 aa  272  9e-72  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  45.09 
 
 		 379 aa  270  4e-71  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  43.19 
 
 		 379 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  42.71 
 
 		 381 aa  263  4e-69  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0875  outer membrane insertion C-terminal signal  44.36 
 
 		 380 aa  263  4e-69  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.223148  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0533  putative outer membrane porin  41.77 
 
 		 384 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.121969  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1286  putative outer membrane porin  41.77 
 
 		 384 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1294  outer membrane porin  41.77 
 
 		 384 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2546  outer membrane porin  41.77 
 
 		 384 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0263  putative outer membrane porin  41.77 
 
 		 384 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1374  outer membrane porin  41.77 
 
 		 384 aa  262  6e-69  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1034  putative outer membrane porin  41.77 
 
 		 384 aa  262  6e-69  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1454  outer membrane porin OpcP  41.52 
 
 		 414 aa  262  6.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.176502  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6314  porin  42.78 
 
 		 377 aa  262  8e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0863  porin  44.1 
 
 		 380 aa  260  2e-68  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00000949722  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1234  outer membrane protein (porin)  41.01 
 
 		 384 aa  259  6e-68  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00398986  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  40.92 
 
 		 381 aa  258  1e-67  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  41.98 
 
 		 384 aa  256  5e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  40.05 
 
 		 394 aa  255  7e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3761  porin  40.25 
 
 		 384 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.192618  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5697  porin  40.25 
 
 		 384 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00705206 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4607  porin  40.25 
 
 		 384 aa  255  8e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.192363  normal  0.0218853 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  40.1 
 
 		 383 aa  255  8e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4037  porin  40.76 
 
 		 384 aa  254  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.27779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4495  porin  40.76 
 
 		 384 aa  253  3e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0599  putative outer membrane porin  41.44 
 
 		 384 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0869  putative outer membrane porin  41.44 
 
 		 384 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  40.36 
 
 		 471 aa  252  7e-66  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1836  putative outer membrane porin  41.44 
 
 		 384 aa  252  7e-66  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0345511  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2827  outer membrane porin OpcP  43.36 
 
 		 375 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  40.8 
 
 		 394 aa  251  1e-65  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2331  outer membrane porin OpcP  41.44 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  39.95 
 
 		 383 aa  251  1e-65  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  40.46 
 
 		 403 aa  251  1e-65  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0370  OmpC family outer membrane porin  38.52 
 
 		 389 aa  251  1e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.166204  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1029  outer membrane porin  41.44 
 
 		 384 aa  251  1e-65  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4948  porin Gram-negative type  40.75 
 
 		 386 aa  252  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0530377  normal  0.0846854 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  41.22 
 
 		 383 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1228  OmpC family outer membrane porin  41.03 
 
 		 387 aa  251  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.208027 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1699  OmpC family outer membrane porin  41.13 
 
 		 386 aa  250  2e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0712335  normal  0.645361 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1643  outer membrane porin OpcP  41.19 
 
 		 384 aa  250  3e-65  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.262884  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  39.85 
 
 		 396 aa  250  3e-65  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3938  porin  42.05 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1115  outer membrane porin  40.94 
 
 		 384 aa  247  2e-64  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.368238  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  40.31 
 
 		 383 aa  248  2e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4307  porin  39.69 
 
 		 418 aa  246  3e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0314487  normal  0.78321 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1989  porin Gram-negative type  41.29 
 
 		 385 aa  247  3e-64  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.508045 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3950  porin  39.34 
 
 		 403 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4416  porin  39.34 
 
 		 403 aa  246  6e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.545214  normal  0.669739 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5889  porin  39.34 
 
 		 398 aa  246  6.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.28884 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3115  outer membrane protein (porin)  41.58 
 
 		 374 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4039  porin  41.27 
 
 		 384 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.784778  normal  0.473466 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3848  porin  39.19 
 
 		 418 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0388  OmpC family outer membrane porin  40.61 
 
 		 384 aa  241  2e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.62464  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5547  porin  40.45 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  41.01 
 
 		 377 aa  238  1e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3632  porin  40.45 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  40.45 
 
 		 362 aa  238  1e-61  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1023  outer membrane protein (porin)  42.23 
 
 		 361 aa  237  3e-61  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.615146  normal  0.0954699 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  41.54 
 
 		 391 aa  236  4e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  40.46 
 
 		 383 aa  236  4e-61  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2786  OmpC family outer membrane porin  40.2 
 
 		 377 aa  236  5.0000000000000005e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4838  porin  38.86 
 
 		 385 aa  235  8e-61  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.000248162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4271  porin  39.79 
 
 		 370 aa  233  3e-60  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7454  outer membrane protein (porin)  37.91 
 
 		 383 aa  233  5e-60  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  39.74 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  39.74 
 
 		 389 aa  232  6e-60  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  39.74 
 
 		 389 aa  233  6e-60  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  40.15 
 
 		 374 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6291  porin  40.2 
 
 		 392 aa  231  2e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00384497  normal  0.183754 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  40.15 
 
 		 374 aa  231  2e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2108  porin signal peptide protein  37.97 
 
 		 381 aa  230  3e-59  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0434327  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  39.45 
 
 		 380 aa  230  4e-59  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  40.15 
 
 		 374 aa  229  4e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  40 
 
 		 380 aa  230  4e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  39.45 
 
 		 380 aa  229  5e-59  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  40.15 
 
 		 390 aa  229  6e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>