More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_4522 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_4522  porin  100 
 
 		 359 aa  708    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0333  outer membrane porin, putative  40 
 
 		 365 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277065  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0155  porin  36.99 
 
 		 370 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  37.89 
 
 		 376 aa  186  5e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3529  porin  37.71 
 
 		 376 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327335 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3623  porin  37.71 
 
 		 372 aa  182  7e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2492  outer membrane protein (porin)  37.68 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279095  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3897  porin  37.61 
 
 		 372 aa  181  1e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.239452 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  36.01 
 
 		 335 aa  176  8e-43  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5070  porin  38.73 
 
 		 372 aa  171  1e-41  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.189644 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  33.24 
 
 		 357 aa  148  2.0000000000000003e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  33.33 
 
 		 347 aa  146  6e-34  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  34.71 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  34.71 
 
 		 354 aa  145  1e-33  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  34.45 
 
 		 356 aa  145  1e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  32.15 
 
 		 354 aa  142  7e-33  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  33.82 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  33.82 
 
 		 355 aa  142  9.999999999999999e-33  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  34.47 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  34.47 
 
 		 356 aa  140  3e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  31.75 
 
 		 369 aa  140  3.9999999999999997e-32  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  34.72 
 
 		 374 aa  140  4.999999999999999e-32  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  34.76 
 
 		 327 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  34.47 
 
 		 356 aa  138  1e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  32.44 
 
 		 338 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  34.78 
 
 		 353 aa  136  6.0000000000000005e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  32.25 
 
 		 327 aa  136  6.0000000000000005e-31  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  34.55 
 
 		 384 aa  135  9.999999999999999e-31  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  34.66 
 
 		 362 aa  133  3.9999999999999996e-30  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  32.61 
 
 		 353 aa  133  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5031  porin  33.24 
 
 		 357 aa  134  3.9999999999999996e-30  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  32.57 
 
 		 364 aa  134  3.9999999999999996e-30  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  33.97 
 
 		 436 aa  133  5e-30  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  33.97 
 
 		 386 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  33.97 
 
 		 386 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  33.97 
 
 		 386 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  33.97 
 
 		 386 aa  132  6e-30  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  33.97 
 
 		 386 aa  132  6e-30  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4416  porin Gram-negative type  33.81 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3342  porin  34.04 
 
 		 386 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00592431 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4306  porin Gram-negative type  33.81 
 
 		 354 aa  132  1.0000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.273779  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2227  porin Gram-negative type  34.92 
 
 		 387 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0459424  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  33.42 
 
 		 383 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  34.58 
 
 		 349 aa  132  1.0000000000000001e-29  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  32.86 
 
 		 362 aa  132  1.0000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  34.11 
 
 		 386 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  41.33 
 
 		 380 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  33.97 
 
 		 389 aa  130  3e-29  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5955  porin Gram-negative type  36.55 
 
 		 384 aa  130  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.144043  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  33.82 
 
 		 351 aa  130  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  33.7 
 
 		 386 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  32.97 
 
 		 436 aa  129  6e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  32.39 
 
 		 351 aa  129  6e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  32.59 
 
 		 392 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  32.59 
 
 		 392 aa  129  9.000000000000001e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  35.29 
 
 		 370 aa  128  1.0000000000000001e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  40.51 
 
 		 380 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0475  Outer membrane protein (porin)  33.75 
 
 		 389 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0924719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  40.51 
 
 		 379 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  32.16 
 
 		 355 aa  128  1.0000000000000001e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  33.78 
 
 		 385 aa  127  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  33.78 
 
 		 385 aa  128  2.0000000000000002e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  41.33 
 
 		 380 aa  127  3e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  34.84 
 
 		 391 aa  127  3e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1084  porin transmembrane protein  34.83 
 
 		 364 aa  126  5e-28  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00229533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3782  porin  42.5 
 
 		 388 aa  126  5e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  31.63 
 
 		 348 aa  126  5e-28  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  31.82 
 
 		 377 aa  126  6e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4825  porin  33.02 
 
 		 383 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0552625  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4871  porin  32.12 
 
 		 371 aa  125  1e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.0000247804  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  34.37 
 
 		 389 aa  125  1e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  40 
 
 		 380 aa  125  1e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6035  porin  33.84 
 
 		 405 aa  124  2e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.00334523  normal  0.102447 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  32.1 
 
 		 355 aa  124  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  38.46 
 
 		 380 aa  125  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  34.62 
 
 		 373 aa  124  2e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  40 
 
 		 380 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  41.67 
 
 		 399 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  34.47 
 
 		 347 aa  124  3e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  31.36 
 
 		 383 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4539  porin  33.52 
 
 		 382 aa  124  3e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.516976  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3567  porin  33.7 
 
 		 363 aa  123  4e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.000504769  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  32.06 
 
 		 383 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2044  OmpC family outer membrane porin  32.46 
 
 		 387 aa  123  4e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.231547  normal  0.626735 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  33.06 
 
 		 365 aa  123  5e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  38.54 
 
 		 403 aa  123  5e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  35.41 
 
 		 368 aa  122  7e-27  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7566  outer membrane protein (porin)  33.23 
 
 		 405 aa  122  7e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0747228  normal  0.81381 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4800  porin  32.54 
 
 		 367 aa  122  8e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0160312  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2364  OmpC family outer membrane porin  39.15 
 
 		 409 aa  122  8e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.247928  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  36.28 
 
 		 388 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5510  porin  32.77 
 
 		 372 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.913776  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  31.54 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  32.34 
 
 		 367 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  31.84 
 
 		 389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  33.33 
 
 		 379 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  32.08 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  32.41 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0265  porin  32.56 
 
 		 373 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0179073  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  32.08 
 
 		 383 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>