More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_4118 on replicon NC_010676
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010676  Bphyt_4118  porin Gram-negative type  100 
 
 		 342 aa  682    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0545  OmpC family outer membrane porin  83.14 
 
 		 352 aa  575  1.0000000000000001e-163  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  37.97 
 
 		 356 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  37.97 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  37.97 
 
 		 356 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  37.71 
 
 		 356 aa  194  1e-48  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  38.25 
 
 		 327 aa  192  9e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1214  hypothetical protein  60.15 
 
 		 221 aa  159  8e-38  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  30.99 
 
 		 349 aa  130  3e-29  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  41.24 
 
 		 364 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  29.79 
 
 		 383 aa  108  1e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0333  outer membrane porin, putative  30.61 
 
 		 365 aa  105  8e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277065  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  30.21 
 
 		 350 aa  100  5e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  30.77 
 
 		 350 aa  99.8  7e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1819  OmpC family outer membrane porin  42.25 
 
 		 364 aa  97.8  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223264  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  29.27 
 
 		 376 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  30.27 
 
 		 385 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  30.22 
 
 		 350 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  30.22 
 
 		 350 aa  96.7  5e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3897  porin  30.46 
 
 		 372 aa  95.1  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.239452 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3623  porin  29.92 
 
 		 372 aa  94  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5110  porin Gram-negative type  29.01 
 
 		 371 aa  94.4  3e-18  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  44.78 
 
 		 398 aa  94.4  3e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  32.69 
 
 		 380 aa  92  1e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  33.33 
 
 		 380 aa  92.4  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2492  outer membrane protein (porin)  29.86 
 
 		 372 aa  92  1e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  27.8 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  32.43 
 
 		 355 aa  92  1e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2395  porin  30.87 
 
 		 379 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  39.73 
 
 		 335 aa  90.5  4e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3529  porin  28.3 
 
 		 376 aa  90.1  4e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327335 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  29.64 
 
 		 355 aa  89.7  7e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5535  porin Gram-negative type  31.21 
 
 		 391 aa  89.7  7e-17  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.438233 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  29.64 
 
 		 355 aa  89.7  7e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5070  porin  28.84 
 
 		 372 aa  89.4  8e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.189644 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  36.71 
 
 		 396 aa  89.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  29.64 
 
 		 347 aa  88.6  1e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  27.9 
 
 		 359 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  41.11 
 
 		 403 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  29.28 
 
 		 393 aa  88.6  1e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  32.13 
 
 		 380 aa  88.6  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  40.22 
 
 		 471 aa  88.2  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  28.66 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  30.77 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  38.12 
 
 		 385 aa  88.2  2e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6666  outer membrane protein (porin)  32.68 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16051  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  38.93 
 
 		 376 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  28.95 
 
 		 390 aa  88.2  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2703  porin Gram-negative type  28.88 
 
 		 372 aa  87.8  2e-16  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0949  porin Gram-negative type  29.79 
 
 		 411 aa  87.4  3e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0379261 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  28.34 
 
 		 362 aa  87.4  3e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  38.1 
 
 		 383 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  37.5 
 
 		 385 aa  87.4  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  29.67 
 
 		 385 aa  87.8  3e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  38.75 
 
 		 389 aa  87.8  3e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  37.5 
 
 		 386 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  37.5 
 
 		 386 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  37.5 
 
 		 386 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  37.5 
 
 		 386 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  37.5 
 
 		 386 aa  87  4e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  30.22 
 
 		 368 aa  87  4e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  37.5 
 
 		 436 aa  87  4e-16  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  30.5 
 
 		 354 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  30.88 
 
 		 380 aa  87  4e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  30.5 
 
 		 354 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  27.25 
 
 		 381 aa  87  4e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0008  OmpC family outer membrane porin  40.91 
 
 		 365 aa  87  4e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  31.32 
 
 		 380 aa  87  5e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  27.67 
 
 		 355 aa  86.3  7e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  38.27 
 
 		 386 aa  86.3  7e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3126  porin  37.36 
 
 		 394 aa  86.3  8e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0189644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4307  porin  45.65 
 
 		 418 aa  85.9  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0314487  normal  0.78321 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  30.88 
 
 		 380 aa  85.9  9e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  32.44 
 
 		 379 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  30.05 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  34.76 
 
 		 395 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5288  outer membrane porin  45.45 
 
 		 386 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.13289 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3848  porin  44.93 
 
 		 418 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0155  porin  36.3 
 
 		 370 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4385  porin  39.22 
 
 		 385 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.375427  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  36.88 
 
 		 383 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3880  porin  43.55 
 
 		 384 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.00909398  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3981  porin  39.22 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.886193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  44.04 
 
 		 393 aa  84.3  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  36.88 
 
 		 436 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3786  putative outer membrane porin  39.69 
 
 		 391 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4328  porin  37.57 
 
 		 391 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.428613  normal  0.0399975 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3547  porin  39.22 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.251126  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  31.55 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  41.67 
 
 		 387 aa  84.3  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  27.71 
 
 		 358 aa  84.3  0.000000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  40 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  31.55 
 
 		 344 aa  84  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  40 
 
 		 430 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  38.29 
 
 		 385 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1157  porin  37.88 
 
 		 379 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  31.55 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  43.4 
 
 		 389 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5435  porin  37.75 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00368116  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1882  putative outer membrane porin  40 
 
 		 384 aa  83.6  0.000000000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.400971  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>