More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1214 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1214  hypothetical protein  100 
 
 		 221 aa  446  1.0000000000000001e-124  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.243188 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4118  porin Gram-negative type  60.15 
 
 		 342 aa  159  4e-38  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0545  OmpC family outer membrane porin  57.89 
 
 		 352 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.674895 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1222  porin  36.84 
 
 		 356 aa  80.5  0.00000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4384  outer membrane protein, (porin)  39.39 
 
 		 356 aa  78.6  0.00000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1250  porin  39.39 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.341565  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0769  porin  39.39 
 
 		 356 aa  77.8  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.8463  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1141  porin  37.88 
 
 		 327 aa  74.7  0.000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.259275 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  49.32 
 
 		 383 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  46.24 
 
 		 338 aa  60.5  0.00000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1819  OmpC family outer membrane porin  57.35 
 
 		 364 aa  59.7  0.00000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223264  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0674  porin  49.33 
 
 		 381 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.161927  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  46.07 
 
 		 376 aa  57  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  43.66 
 
 		 364 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0008  OmpC family outer membrane porin  47.06 
 
 		 365 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3897  porin  48.1 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.239452 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  50.68 
 
 		 381 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  30.71 
 
 		 349 aa  55.8  0.0000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  45.21 
 
 		 386 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  45.21 
 
 		 386 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  45.21 
 
 		 436 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  45.21 
 
 		 386 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  45.21 
 
 		 386 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  45.21 
 
 		 386 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5138  porin  49.3 
 
 		 396 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0176797  normal  0.966332 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  45.21 
 
 		 386 aa  55.5  0.0000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0333  outer membrane porin, putative  37.8 
 
 		 365 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277065  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  45.21 
 
 		 436 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0910  OmpC family outer membrane porin  48 
 
 		 381 aa  55.5  0.0000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0510287  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  47.14 
 
 		 376 aa  55.1  0.0000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0844  outer membrane porin  43.04 
 
 		 383 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.109957  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0486  putative outer membrane porin  43.04 
 
 		 380 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0695  putative outer membrane porin  43.04 
 
 		 383 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.336216  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3194  porin  52.24 
 
 		 380 aa  54.3  0.000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.809666  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2123  outer membrane porin  43.04 
 
 		 380 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  51.35 
 
 		 380 aa  54.7  0.000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3623  porin  46.84 
 
 		 372 aa  54.7  0.000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0991  putative outer membrane porin  43.04 
 
 		 383 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0756  outer membrane porin  43.04 
 
 		 383 aa  54.7  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1963  putative outer membrane porin  43.04 
 
 		 383 aa  54.7  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  47.14 
 
 		 376 aa  55.1  0.000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6321  porin  50.77 
 
 		 394 aa  54.3  0.000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00119227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  45.95 
 
 		 383 aa  53.9  0.000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1592  outer membrane porin OpcP  48 
 
 		 379 aa  54.3  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  hitchhiker  0.000753079  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  45.71 
 
 		 376 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2089  outer membrane porin, putative  46.67 
 
 		 379 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3009  outer membrane porin  46.67 
 
 		 379 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.205234  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3288  porin  41.25 
 
 		 380 aa  53.1  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3043  outer membrane protein  46.67 
 
 		 379 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.00000337977  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  45.21 
 
 		 383 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4111  outer membrane protein, (porin)  46.67 
 
 		 381 aa  53.5  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.0000000510275  normal  0.307303 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2943  outer membrane porin  46.67 
 
 		 379 aa  53.1  0.000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.0000414234  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2596  outer membrane protein (porin)  46.48 
 
 		 394 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.121818  normal  0.826149 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2236  porin  49.37 
 
 		 359 aa  53.1  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5311  porin  42.31 
 
 		 386 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1957  putative outer membrane porin  46.67 
 
 		 379 aa  53.1  0.000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3529  porin  42.7 
 
 		 376 aa  53.1  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327335 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3572  porin  52.63 
 
 		 379 aa  52.8  0.000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.52228  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  42.31 
 
 		 384 aa  53.1  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1853  outer membrane porin OpcP  40.74 
 
 		 481 aa  52.8  0.000004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0277472  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4039  porin  56.9 
 
 		 379 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0993774  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  46.58 
 
 		 385 aa  52.8  0.000004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0218  OmpC family outer membrane porin  52.38 
 
 		 392 aa  52.8  0.000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000219093  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4327  porin  56.9 
 
 		 380 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.872591 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  45.83 
 
 		 335 aa  52.8  0.000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  48.61 
 
 		 363 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  48.61 
 
 		 363 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  48.61 
 
 		 363 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4216  porin  56.9 
 
 		 380 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.951814  normal  0.390513 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3742  porin  56.9 
 
 		 380 aa  52.4  0.000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.40751  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3080  porin Gram-negative type  46.67 
 
 		 381 aa  52.8  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  48.61 
 
 		 449 aa  52.4  0.000005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  46.58 
 
 		 385 aa  52.8  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  48.61 
 
 		 363 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  48.61 
 
 		 363 aa  52.8  0.000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  47.89 
 
 		 358 aa  52.4  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3381  porin  47.95 
 
 		 362 aa  52  0.000006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.573075  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  45.21 
 
 		 389 aa  52.4  0.000006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1722  outer membrane protein (porin)  47.3 
 
 		 357 aa  52  0.000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0914033  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4628  porin  46.38 
 
 		 389 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3105  putative outer membrane protein (porin)  43.68 
 
 		 435 aa  52  0.000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.22621 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0589  outer membrane protein (porin)  50.88 
 
 		 379 aa  51.6  0.000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4482  porin  51.79 
 
 		 379 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.46976  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3740  porin  46.38 
 
 		 389 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  46.38 
 
 		 389 aa  52  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5007  porin  51.79 
 
 		 379 aa  52  0.000008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.167994  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5215  porin  50.88 
 
 		 379 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.778318 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5070  porin  50.88 
 
 		 379 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.58235  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3298  porin  50.88 
 
 		 379 aa  51.6  0.000009  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.406065  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_5070  porin  46.05 
 
 		 372 aa  51.6  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.189644 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2134  porin  41.77 
 
 		 387 aa  51.6  0.00001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.543846  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5219  porin  47.95 
 
 		 362 aa  51.2  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.10924  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  41.56 
 
 		 383 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0285  outer membrane protein (porin)  46.15 
 
 		 367 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2492  outer membrane protein (porin)  44.74 
 
 		 372 aa  51.2  0.00001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  47.06 
 
 		 363 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  47.44 
 
 		 386 aa  51.2  0.00001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  45.21 
 
 		 383 aa  51.2  0.00001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  50 
 
 		 389 aa  50.8  0.00001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  49.25 
 
 		 380 aa  51.2  0.00001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>