More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_0355 on replicon NC_009076
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  100 
 
 
387 aa  723    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  99.44 
 
 
358 aa  716    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  94.69 
 
 
358 aa  663    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  100 
 
 
358 aa  722    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  76.54 
 
 
358 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  75.7 
 
 
358 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  76.26 
 
 
358 aa  548  1e-155  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  76.54 
 
 
358 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  76.54 
 
 
358 aa  550  1e-155  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  75.98 
 
 
358 aa  548  1e-155  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  75.98 
 
 
358 aa  545  1e-154  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  70.84 
 
 
367 aa  528  1e-149  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  71.27 
 
 
361 aa  496  1e-139  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  70.72 
 
 
361 aa  490  1e-137  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  59.94 
 
 
356 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  59.94 
 
 
356 aa  379  1e-104  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  58.66 
 
 
352 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  58.66 
 
 
352 aa  374  1e-102  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  54.13 
 
 
360 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  56.19 
 
 
351 aa  357  1.9999999999999998e-97  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  51.87 
 
 
363 aa  352  8e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  54.46 
 
 
357 aa  346  3e-94  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  53.87 
 
 
357 aa  344  2e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  50.41 
 
 
359 aa  322  9.000000000000001e-87  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  49.06 
 
 
361 aa  314  9.999999999999999e-85  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3020  outer membrane protein (porin)  43.18 
 
 
365 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  41.55 
 
 
344 aa  238  8e-62  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  41.79 
 
 
344 aa  236  3e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  39.66 
 
 
344 aa  224  1e-57  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  40.44 
 
 
362 aa  208  1e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  40.12 
 
 
340 aa  206  7e-52  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5435  porin precursor transmembrane protein  43.8 
 
 
332 aa  204  2e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  39.46 
 
 
357 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  39.46 
 
 
357 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  40.06 
 
 
342 aa  200  3.9999999999999996e-50  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  39.58 
 
 
341 aa  194  1e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  38.08 
 
 
357 aa  192  9e-48  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  38 
 
 
341 aa  189  4e-47  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7659  outer membrane protein (porin)  38.81 
 
 
340 aa  186  4e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  38.05 
 
 
357 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  38.05 
 
 
357 aa  186  6e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  34.11 
 
 
359 aa  132  1.0000000000000001e-29  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  33.52 
 
 
390 aa  131  2.0000000000000002e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  33.06 
 
 
359 aa  130  3e-29  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  33.06 
 
 
359 aa  129  7.000000000000001e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  33.8 
 
 
359 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  32.53 
 
 
344 aa  125  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  35.13 
 
 
361 aa  124  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  33.61 
 
 
359 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  33.43 
 
 
359 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  33.43 
 
 
359 aa  123  4e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  32.19 
 
 
369 aa  122  9.999999999999999e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  34.37 
 
 
389 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  33.7 
 
 
386 aa  120  4.9999999999999996e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  33.7 
 
 
386 aa  119  6e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  32.83 
 
 
376 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1962  OmpC family outer membrane porin  34.74 
 
 
391 aa  119  9.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.350651  normal  0.328983 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  34.1 
 
 
383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  34.1 
 
 
383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  32.75 
 
 
393 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  32.6 
 
 
386 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  32.6 
 
 
386 aa  116  6e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  33.24 
 
 
383 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4291  porin Gram-negative type  31.27 
 
 
383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.407078  normal  0.139177 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_7056  porin Gram-negative type  29.66 
 
 
357 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.236319  normal  0.38539 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  33.81 
 
 
383 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  33.33 
 
 
376 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  32.95 
 
 
386 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  31.99 
 
 
386 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  32.02 
 
 
361 aa  113  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  33.24 
 
 
368 aa  113  6e-24  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  30.49 
 
 
351 aa  113  6e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  33.33 
 
 
339 aa  112  7.000000000000001e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  32.12 
 
 
350 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  31.32 
 
 
352 aa  112  8.000000000000001e-24  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  30.23 
 
 
357 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  32.16 
 
 
386 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0620  OmpC family outer membrane porin  31.81 
 
 
383 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0145861 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  33.59 
 
 
400 aa  112  8.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  33.72 
 
 
385 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7282  outer membrane protein (porin)  31.51 
 
 
393 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.584886  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  31.45 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  33.43 
 
 
385 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  33.14 
 
 
363 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  31.45 
 
 
386 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  33.24 
 
 
393 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  33.43 
 
 
350 aa  110  3e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2074  porin  33.33 
 
 
360 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1504  outer membrane porin OpcP  31.88 
 
 
496 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  32.39 
 
 
400 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  30.59 
 
 
393 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  35.47 
 
 
363 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0745  outer membrane porin  31.61 
 
 
430 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.812329  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  35.47 
 
 
363 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  30.62 
 
 
350 aa  110  5e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  31.71 
 
 
338 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  35.47 
 
 
363 aa  110  5e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3529  porin  32.45 
 
 
376 aa  110  5e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.327335 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2416  outer membrane porin  31.61 
 
 
430 aa  110  5e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.163493  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4735  porin  31.76 
 
 
362 aa  109  6e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00659366 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>