More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_0154 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_0154  porin  100 
 
 		 367 aa  741    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  77.51 
 
 		 358 aa  525  1e-148  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  77.81 
 
 		 361 aa  521  1e-147  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  76.6 
 
 		 358 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  76.9 
 
 		 358 aa  520  1e-146  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  75 
 
 		 387 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  76.29 
 
 		 361 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  69.75 
 
 		 358 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  75.91 
 
 		 358 aa  515  1.0000000000000001e-145  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  75 
 
 		 358 aa  514  1.0000000000000001e-145  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  75.61 
 
 		 358 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  75.61 
 
 		 358 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  75 
 
 		 358 aa  513  1e-144  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  75.61 
 
 		 358 aa  511  1e-144  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  53.78 
 
 		 363 aa  382  1e-105  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  59.45 
 
 		 356 aa  375  1e-103  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  59.76 
 
 		 356 aa  377  1e-103  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  51.63 
 
 		 360 aa  369  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  57.75 
 
 		 352 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  57.75 
 
 		 352 aa  366  1e-100  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  56.97 
 
 		 351 aa  358  6e-98  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  49.86 
 
 		 357 aa  324  2e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  49.72 
 
 		 357 aa  323  3e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  48.2 
 
 		 359 aa  301  8.000000000000001e-81  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  48.46 
 
 		 361 aa  295  7e-79  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  45.98 
 
 		 344 aa  277  2e-73  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  44.54 
 
 		 344 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3020  outer membrane protein (porin)  43.1 
 
 		 365 aa  256  4e-67  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  43.58 
 
 		 344 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5435  porin precursor transmembrane protein  44.13 
 
 		 332 aa  211  2e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  38.04 
 
 		 362 aa  208  9e-53  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  38.67 
 
 		 340 aa  196  6e-49  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  37.05 
 
 		 342 aa  193  4e-48  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  36.53 
 
 		 357 aa  191  2e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  36.44 
 
 		 357 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  36.44 
 
 		 357 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  35.51 
 
 		 357 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  35.51 
 
 		 357 aa  189  1e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  36.47 
 
 		 341 aa  187  3e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  38.55 
 
 		 341 aa  183  3e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7659  outer membrane protein (porin)  36.2 
 
 		 340 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1937  porin  35.19 
 
 		 386 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0139631 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1240  porin  33.33 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382217  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1266  porin  33.33 
 
 		 386 aa  124  2e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.162269 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  33.89 
 
 		 386 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0875  porin  33.15 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1357  porin  33.15 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0495362  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  34.38 
 
 		 352 aa  121  1.9999999999999998e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1338  porin  33.15 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.490298  normal  0.0334295 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  30.57 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  42.13 
 
 		 361 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  31.67 
 
 		 359 aa  117  3e-25  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  30.25 
 
 		 359 aa  116  6e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3655  porin  29.97 
 
 		 359 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.228307  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  29.97 
 
 		 359 aa  116  6e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5588  porin  29.97 
 
 		 359 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00406297 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  31.78 
 
 		 369 aa  116  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  30.34 
 
 		 359 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4594  porin  33.91 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.561867 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  30.12 
 
 		 359 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5348  porin  31.96 
 
 		 388 aa  113  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.118369 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  31 
 
 		 344 aa  112  8.000000000000001e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  30.45 
 
 		 394 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3529  porin  30.17 
 
 		 376 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327335 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  32.23 
 
 		 350 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4740  porin Gram-negative type  31.71 
 
 		 390 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.146924  normal  0.780423 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2103  outer membrane protein (porin)  32.49 
 
 		 385 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.938895  normal  0.317864 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  32.09 
 
 		 338 aa  110  5e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  31.7 
 
 		 394 aa  109  7.000000000000001e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  30.14 
 
 		 386 aa  109  7.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  30.08 
 
 		 394 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  30.08 
 
 		 394 aa  109  8.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  30.08 
 
 		 394 aa  109  9.000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  30.14 
 
 		 386 aa  109  9.000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  32.3 
 
 		 376 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  32.39 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  32.39 
 
 		 376 aa  108  2e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  32.01 
 
 		 385 aa  108  2e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010627  Bphy_7493  porin  29.78 
 
 		 383 aa  107  3e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0254041  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  34.51 
 
 		 356 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3876  porin  31.92 
 
 		 385 aa  107  4e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.311637  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  34.51 
 
 		 356 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  34.51 
 
 		 356 aa  106  5e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1413  OmpC family outer membrane porin  35.51 
 
 		 379 aa  105  8e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  unclonable  7.59024e-18  normal  0.238821 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0071  OmpC family outer membrane porin  37.67 
 
 		 380 aa  105  2e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.192485  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  28.5 
 
 		 370 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  29.29 
 
 		 379 aa  103  3e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  31.23 
 
 		 350 aa  103  5e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  29.56 
 
 		 384 aa  103  5e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4600  porin  31.14 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.447707  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5676  porin  30.31 
 
 		 389 aa  103  6e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.919602 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6406  porin Gram-negative type  31.28 
 
 		 381 aa  103  7e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2394  porin  30.34 
 
 		 373 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.636281  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  30.84 
 
 		 350 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  30.84 
 
 		 350 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5740  porin Gram-negative type  32.27 
 
 		 403 aa  102  9e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.917391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3027  porin  30.34 
 
 		 373 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3008  porin  30.34 
 
 		 373 aa  102  9e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4230  porin  28.41 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  31.03 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>