More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphyt_0153 on replicon NC_010681
Organism: Burkholderia phytofirmans PsJN



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  100 
 
 		 344 aa  688    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  92.44 
 
 		 344 aa  641    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  76.09 
 
 		 344 aa  508  1e-143  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  44.54 
 
 		 367 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  46.04 
 
 		 356 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  46.83 
 
 		 352 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  46.83 
 
 		 352 aa  263  4e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  46.04 
 
 		 356 aa  262  6e-69  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  45.65 
 
 		 351 aa  256  4e-67  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  44.78 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  44.81 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  44.81 
 
 		 358 aa  247  2e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  44.21 
 
 		 358 aa  245  6.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  40.29 
 
 		 359 aa  244  1.9999999999999999e-63  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  44.48 
 
 		 358 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  44.48 
 
 		 358 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  44.48 
 
 		 358 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  39.2 
 
 		 361 aa  239  4e-62  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  41.79 
 
 		 358 aa  234  2.0000000000000002e-60  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  42.04 
 
 		 387 aa  231  1e-59  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  42.04 
 
 		 358 aa  231  2e-59  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  42.47 
 
 		 357 aa  230  2e-59  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  42.04 
 
 		 358 aa  230  2e-59  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  41.27 
 
 		 361 aa  231  2e-59  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  41.18 
 
 		 357 aa  230  3e-59  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  40.36 
 
 		 361 aa  227  2e-58  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  40.31 
 
 		 340 aa  224  1e-57  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  39.5 
 
 		 363 aa  222  6e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5435  porin precursor transmembrane protein  46.49 
 
 		 332 aa  220  3e-56  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  41.5 
 
 		 360 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  39.45 
 
 		 341 aa  207  2e-52  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  39.13 
 
 		 342 aa  205  1e-51  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  36.53 
 
 		 357 aa  187  3e-46  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  36.83 
 
 		 357 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  36.83 
 
 		 357 aa  186  7e-46  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  36.83 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  36.83 
 
 		 357 aa  184  2.0000000000000003e-45  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3020  outer membrane protein (porin)  37.72 
 
 		 365 aa  181  2e-44  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  37.13 
 
 		 362 aa  176  5e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  36.34 
 
 		 341 aa  175  9.999999999999999e-43  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7659  outer membrane protein (porin)  38.27 
 
 		 340 aa  172  1e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  33.86 
 
 		 339 aa  127  4.0000000000000003e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  32.41 
 
 		 338 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  35 
 
 		 383 aa  122  9.999999999999999e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  33.04 
 
 		 383 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  33.04 
 
 		 383 aa  120  1.9999999999999998e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  33.23 
 
 		 351 aa  120  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2385  outer membrane protein (porin)  34.88 
 
 		 375 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  32.15 
 
 		 383 aa  117  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  32.05 
 
 		 383 aa  116  6e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1516  porin  33.14 
 
 		 376 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6313  porin  33.14 
 
 		 376 aa  115  7.999999999999999e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.597714 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6971  porin  33.05 
 
 		 376 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.829977  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  34.26 
 
 		 354 aa  114  2.0000000000000002e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  33.54 
 
 		 363 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  33.02 
 
 		 355 aa  114  2.0000000000000002e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3798  porin  34.17 
 
 		 375 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0973702 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  32.44 
 
 		 383 aa  114  3e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  35.16 
 
 		 353 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  33.13 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2478  outer membrane protein (porin)  31.52 
 
 		 385 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.917959 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0482  outer membrane protein (porin)  32.64 
 
 		 357 aa  112  9e-24  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3723  porin  32.78 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.0948757 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4640  porin  32.78 
 
 		 375 aa  112  1.0000000000000001e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  31.64 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1733  porin  32.69 
 
 		 398 aa  110  3e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0848216  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  31.64 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  33.99 
 
 		 368 aa  110  4.0000000000000004e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3748  porin  30.17 
 
 		 409 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.130347  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4620  porin  30.17 
 
 		 409 aa  109  5e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.382092 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  32.66 
 
 		 357 aa  110  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  34.58 
 
 		 401 aa  109  6e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  32.51 
 
 		 351 aa  109  7.000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  30.55 
 
 		 335 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  30.75 
 
 		 393 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  33.43 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  34.95 
 
 		 374 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  33.43 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  31.96 
 
 		 389 aa  108  2e-22  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5684  porin  29.93 
 
 		 391 aa  107  2e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.101118 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3151  outer membrane protein (porin)  29.59 
 
 		 370 aa  108  2e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.185486  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  32.43 
 
 		 352 aa  108  2e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  34.22 
 
 		 355 aa  107  2e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  30.9 
 
 		 386 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  31.94 
 
 		 358 aa  107  4e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  34.37 
 
 		 352 aa  106  5e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  30.75 
 
 		 360 aa  106  6e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  29.86 
 
 		 379 aa  106  7e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6734  outer membrane protein (porin)  31.56 
 
 		 394 aa  105  8e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0780973  normal  1 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  32.14 
 
 		 354 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  32.14 
 
 		 354 aa  105  9e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2708  porin  29.13 
 
 		 400 aa  105  1e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  32.93 
 
 		 335 aa  104  2e-21  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5966  porin  33.33 
 
 		 380 aa  103  3e-21  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.084261 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  31.28 
 
 		 394 aa  103  4e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0702  outer membrane porin OpcP  29.8 
 
 		 523 aa  103  4e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.259508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2582  porin  35.22 
 
 		 400 aa  103  4e-21  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  32 
 
 		 390 aa  103  6e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  33.14 
 
 		 386 aa  103  6e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5850  porin  30.61 
 
 		 366 aa  102  7e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>