More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_5820 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_5820  porin  100 
 
 		 338 aa  687    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1245  porin  44.35 
 
 		 342 aa  275  1.0000000000000001e-72  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.240847  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  28.8 
 
 		 369 aa  87.8  2e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  29.89 
 
 		 335 aa  88.2  2e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3009  putative outer membrane porin signal peptide protein  28.81 
 
 		 367 aa  86.3  8e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.494139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  28.2 
 
 		 316 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  30.5 
 
 		 329 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  30.06 
 
 		 372 aa  82.8  0.000000000000008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  28.96 
 
 		 336 aa  82  0.00000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  33.48 
 
 		 383 aa  81.6  0.00000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  28.96 
 
 		 336 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  29.16 
 
 		 340 aa  79  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3122  periplasmic-binding protein  32.47 
 
 		 413 aa  77.4  0.0000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00833115  normal  0.0608186 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  30.64 
 
 		 370 aa  77.8  0.0000000000003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  27.67 
 
 		 335 aa  77.8  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  29.39 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  27.64 
 
 		 344 aa  76.3  0.0000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  29.43 
 
 		 374 aa  75.9  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  31.68 
 
 		 351 aa  75.9  0.0000000000009  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6034  porin  31.74 
 
 		 382 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.017791  normal  0.203355 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  28.43 
 
 		 380 aa  75.5  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  27.04 
 
 		 340 aa  75.5  0.000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5190  outer membrane porin  27.47 
 
 		 371 aa  75.5  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.353922 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7660  outer membrane protein (porin)  27.74 
 
 		 366 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0194748  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0667  OmpC family outer membrane porin  33.64 
 
 		 389 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0000990839  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  27.68 
 
 		 381 aa  73.9  0.000000000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  29.43 
 
 		 359 aa  73.9  0.000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  29.5 
 
 		 339 aa  74.3  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2400  OmpC family outer membrane porin  32.57 
 
 		 390 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0762385  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  27.32 
 
 		 390 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  27.46 
 
 		 327 aa  73.2  0.000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3019  outer membrane protein (porin)  37.13 
 
 		 366 aa  73.2  0.000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.38657 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  27.64 
 
 		 382 aa  73.2  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  29.23 
 
 		 344 aa  72.8  0.000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4097  outer membrane porin  33.15 
 
 		 374 aa  72.8  0.000000000008  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.552753  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  28.57 
 
 		 349 aa  72.4  0.00000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  29.87 
 
 		 362 aa  72.4  0.00000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  28.72 
 
 		 344 aa  72.4  0.00000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1478  porin Gram-negative type  26.33 
 
 		 346 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  28.4 
 
 		 426 aa  72  0.00000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  31.84 
 
 		 395 aa  72  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  31.84 
 
 		 395 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4204  porin  29.48 
 
 		 471 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.152026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  27.55 
 
 		 314 aa  72  0.00000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  28.72 
 
 		 344 aa  71.2  0.00000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  27.55 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5890  porin Gram-negative type  28.38 
 
 		 358 aa  71.2  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.654987  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  29.08 
 
 		 385 aa  71.6  0.00000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4768  porin  28 
 
 		 384 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  28.66 
 
 		 436 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2370  outer membrane porin OpcP  30.4 
 
 		 419 aa  71.2  0.00000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  27.24 
 
 		 313 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  27.55 
 
 		 314 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2562  outer membrane porin, putative  28.41 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.98462  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0225  outer membrane protein (porin)  28.53 
 
 		 383 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.436147  normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3561  outer membrane porin  28.41 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3536  outer membrane porin  28.41 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3221  putative outer membrane porin  28.41 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1342  putative outer membrane porin  28.41 
 
 		 386 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  28.41 
 
 		 436 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  33.65 
 
 		 385 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5892  porin Gram-negative type  31.96 
 
 		 391 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.957036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0570  OmpC family outer membrane porin  29.9 
 
 		 366 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000938723  normal  0.683282 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  30.04 
 
 		 395 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0963  porin  30.5 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000213989  normal  0.474423 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3481  porin Gram-negative type  33.49 
 
 		 389 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00201616  hitchhiker  0.00388153 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  33.65 
 
 		 385 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  30.1 
 
 		 314 aa  69.7  0.00000000006  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  30.1 
 
 		 314 aa  70.1  0.00000000006  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5230  outer membrane protein, (porin)  28.86 
 
 		 348 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1343  porin  27.59 
 
 		 355 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.674319  normal  0.0139944 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2048  outer membrane porin  35.93 
 
 		 366 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.569362  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2189  outer membrane porin  35.93 
 
 		 366 aa  69.3  0.00000000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  26.49 
 
 		 341 aa  69.3  0.00000000009  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  27.86 
 
 		 380 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  28.01 
 
 		 360 aa  69.3  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  26.5 
 
 		 358 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0483  putative outer membrane porin  28.12 
 
 		 386 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  31.98 
 
 		 384 aa  68.9  0.0000000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0464  porin  32.05 
 
 		 345 aa  68.9  0.0000000001  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1003  porin  30.14 
 
 		 383 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000241018  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0812  OmpC family outer membrane porin  27 
 
 		 388 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.366822 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  29.61 
 
 		 314 aa  68.6  0.0000000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  31.84 
 
 		 394 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  30.5 
 
 		 355 aa  68.2  0.0000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  26.84 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  27.24 
 
 		 449 aa  67.8  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  26.93 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  26.84 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  30.14 
 
 		 386 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  29.52 
 
 		 342 aa  68.6  0.0000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  27.04 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  26.93 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  27.04 
 
 		 390 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  26.84 
 
 		 363 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  27.9 
 
 		 354 aa  67.4  0.0000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1258  porin  28.24 
 
 		 322 aa  67.8  0.0000000003  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170456 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0103  outer membrane porin OpcP  34.69 
 
 		 411 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.660902  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  28.11 
 
 		 363 aa  67.4  0.0000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  28.11 
 
 		 363 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>