More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tcr_0464 on replicon NC_007520
Organism: Thiomicrospira crunogena XCL-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007520  Tcr_0464  porin  100 
 
 		 345 aa  687    Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  0.0000000000000937994  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2970  porin  35.47 
 
 		 316 aa  144  2e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00088463  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1073  porin  35.15 
 
 		 308 aa  139  7.999999999999999e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0147353  normal  0.297004 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2769  porin  33.61 
 
 		 314 aa  132  6.999999999999999e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0218371  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1206  putative outer membrane porin  30.24 
 
 		 340 aa  129  6e-29  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3304  porin  33.53 
 
 		 314 aa  124  2e-27  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000871207  hitchhiker  0.00000130468 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0448  outer membrane protein (porin)  30.75 
 
 		 362 aa  117  3e-25  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  decreased coverage  0.0000207768  normal  0.425074 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2750  porin  31.96 
 
 		 316 aa  116  5e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.0000019899  unclonable  0.00000382336 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3454  porin  31.74 
 
 		 315 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0284932  hitchhiker  0.000170236 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0503  porin  28.74 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00290192  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1295  porin  31.77 
 
 		 316 aa  114  3e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000017597  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2784  putative porin  31.86 
 
 		 339 aa  112  7.000000000000001e-24  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  unclonable  0.00000063685  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4152  porin  27.57 
 
 		 342 aa  112  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0544389  normal  0.155829 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2880  porin  31.95 
 
 		 314 aa  112  9e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.000000245677  hitchhiker  0.00000646129 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2778  porin  31.95 
 
 		 314 aa  112  9e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000203454  decreased coverage  0.000224903 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4151  porin  29.52 
 
 		 348 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  decreased coverage  0.00169518  normal  0.241214 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2710  porin  31.66 
 
 		 314 aa  111  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000036835  hitchhiker  0.00000168324 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1363  porin  32.27 
 
 		 314 aa  110  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0264795  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1377  porin  32.27 
 
 		 314 aa  109  6e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.000151109  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3750  outer membrane protein (porin)  31.08 
 
 		 302 aa  109  6e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.817752 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2982  porin Gram-negative type  32.27 
 
 		 313 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000345498  hitchhiker  0.00128876 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2690  porin  32.74 
 
 		 317 aa  108  1e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000491313  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1402  porin  31.58 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0177121  normal  0.0236539 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1557  outer membrane porin, putative  31.12 
 
 		 321 aa  107  2e-22  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4009  porin  28.99 
 
 		 342 aa  107  3e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.000000245606  unclonable  0.000000000165223 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1984  porin Gram-negative type  31.89 
 
 		 367 aa  105  9e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.00000864013  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0589  porin  27.11 
 
 		 344 aa  105  1e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.0000000486852  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3570  porin  29.02 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.00000000255579  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0814  porin Gram-negative type  29.02 
 
 		 354 aa  103  4e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  decreased coverage  0.000000049607  unclonable  0.00000000000354557 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2749  porin  27.08 
 
 		 372 aa  103  4e-21  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3252  porin  28.76 
 
 		 352 aa  103  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000145814  normal  0.417141 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0545  outer membrane porin, putative  29.17 
 
 		 355 aa  103  6e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.00179021  hitchhiker  0.00341076 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2681  porin  27.08 
 
 		 347 aa  102  8e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.201946  normal  0.861695 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0821  porin  27.96 
 
 		 365 aa  100  3e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.000000436075  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3260  porin  27.97 
 
 		 342 aa  99  1e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.000000138522  normal  0.0127606 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0590  porin  27.48 
 
 		 354 aa  99  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0124003  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0789  porin  28.27 
 
 		 346 aa  97.1  4e-19  Shewanella baltica OS185  Bacteria  decreased coverage  0.00000000129455  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3474  porin  40.22 
 
 		 384 aa  95.1  1e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00203539  normal  0.190966 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0544  outer membrane porin, putative  24.94 
 
 		 361 aa  95.5  1e-18  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000269892  normal  0.0120764 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4008  porin  26.72 
 
 		 354 aa  94  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000296209  hitchhiker  0.0000000599213 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3239  outer membrane porin, putative  26.84 
 
 		 338 aa  92  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.922918 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0781  porin  28.87 
 
 		 353 aa  92  1e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000021464  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3228  porin  28.23 
 
 		 356 aa  90.1  5e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000270281  hitchhiker  0.000000479229 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2587  porin  27.17 
 
 		 351 aa  90.1  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0815  porin Gram-negative type  27.87 
 
 		 354 aa  89.7  6e-17  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00496289  hitchhiker  0.000000000146698 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3896  outer membrane porin, putative  26.68 
 
 		 369 aa  89.4  8e-17  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  28.31 
 
 		 369 aa  89.4  8e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0822  porin  26.91 
 
 		 354 aa  88.6  1e-16  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0441851  normal  0.422579 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0761  porin  26.91 
 
 		 353 aa  88.2  2e-16  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000331419  unclonable  0.0000251685 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0790  porin  27.84 
 
 		 354 aa  87.8  2e-16  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000041631  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  32.45 
 
 		 329 aa  88.2  2e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3569  porin  27.48 
 
 		 354 aa  88.2  2e-16  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00136982  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3227  outer membrane porin, putative  27.37 
 
 		 354 aa  87  4e-16  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000101033  hitchhiker  0.000000540368 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0733  porin  26.75 
 
 		 359 aa  86.3  8e-16  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.0000000551944  decreased coverage  0.0000318488 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0734  porin  26.82 
 
 		 354 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000494692  decreased coverage  0.0000362774 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0762  outer membrane porin, putative  26.61 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.0000457647  unclonable  0.0000246582 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1114  porin  26.61 
 
 		 365 aa  83.2  0.000000000000006  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.600912 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0593  porin  29.59 
 
 		 368 aa  80.1  0.00000000000005  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000197819  unclonable  2.8842300000000004e-18 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2679  putative outer membrane protein (porin)  28.72 
 
 		 394 aa  79  0.0000000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0022  porin Gram-negative type  29.71 
 
 		 342 aa  78.2  0.0000000000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.561527  normal  0.116595 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  27.39 
 
 		 368 aa  77.4  0.0000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  40 
 
 		 338 aa  73.2  0.000000000006  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  31.08 
 
 		 357 aa  72.8  0.000000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3905  porin  38.4 
 
 		 413 aa  72  0.00000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  29.63 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5820  porin  31.55 
 
 		 338 aa  72  0.00000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.595518  normal  0.841519 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  31.08 
 
 		 357 aa  72  0.00000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2569  porin  26.82 
 
 		 365 aa  72  0.00000000002  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  unclonable  0.0000000237522  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2050  porin  26.17 
 
 		 376 aa  71.2  0.00000000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.946286  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2476  outer membrane porin precursor  28.07 
 
 		 374 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3374  porin  28.23 
 
 		 385 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  28.24 
 
 		 360 aa  70.5  0.00000000004  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  30.37 
 
 		 387 aa  70.5  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  27.99 
 
 		 335 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1214  outer membrane porin  28.07 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1287  outer membrane porin  28.07 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.236633  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1679  outer membrane protein (porin)  35.9 
 
 		 380 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.537554  normal  0.868597 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1520  outer membrane porin OpcP  27.71 
 
 		 374 aa  69.3  0.00000000009  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.86077  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1353  outer membrane porin OpcP  27.93 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.666158  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3122  periplasmic-binding protein  28.72 
 
 		 413 aa  68.9  0.0000000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00833115  normal  0.0608186 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0337  putative outer membrane porin  27.93 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  27.78 
 
 		 344 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2846  outer membrane protein (porin)  27.82 
 
 		 383 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.42536 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  31.58 
 
 		 344 aa  69.3  0.0000000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0615  putative outer membrane porin  27.93 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0954  putative outer membrane porin  27.93 
 
 		 376 aa  69.3  0.0000000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  31.18 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1420  outer membrane porin, putative  22.64 
 
 		 345 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3606  porin  27.98 
 
 		 383 aa  68.2  0.0000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.616699 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  30.99 
 
 		 344 aa  68.6  0.0000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  27.16 
 
 		 356 aa  67.4  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4500  outer membrane protein, (porin)  28.5 
 
 		 386 aa  67.8  0.0000000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.048827  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  27.16 
 
 		 356 aa  67.8  0.0000000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  27.72 
 
 		 374 aa  66.6  0.0000000006  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  26.5 
 
 		 361 aa  66.6  0.0000000006  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  34.68 
 
 		 351 aa  66.2  0.0000000008  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2278  porin  22.77 
 
 		 346 aa  66.2  0.0000000008  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.134296  normal  0.609479 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0594  porin  25.53 
 
 		 354 aa  65.9  0.0000000009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  unclonable  0.000000227625  unclonable  3.1886500000000004e-18 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  29.3 
 
 		 436 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2282  porin  35.71 
 
 		 357 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>