More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dtpsy_2452 on replicon NC_011992
Organism: Acidovorax ebreus TPSY



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  100 
 
 		 340 aa  692    Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  80.37 
 
 		 341 aa  541  1e-153  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  56.56 
 
 		 342 aa  347  1e-94  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  42.33 
 
 		 361 aa  251  2e-65  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  45.48 
 
 		 351 aa  246  3e-64  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  45.71 
 
 		 356 aa  245  6.999999999999999e-64  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  43.3 
 
 		 359 aa  245  8e-64  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  45.09 
 
 		 356 aa  241  9e-63  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  41.18 
 
 		 344 aa  237  2e-61  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  43.73 
 
 		 344 aa  236  4e-61  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  40.76 
 
 		 344 aa  236  6e-61  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  45.15 
 
 		 352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  45.15 
 
 		 352 aa  234  1.0000000000000001e-60  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  42.69 
 
 		 358 aa  225  8e-58  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  42.41 
 
 		 358 aa  223  3e-57  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  42.12 
 
 		 358 aa  223  4.9999999999999996e-57  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  42.41 
 
 		 358 aa  222  7e-57  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  42.69 
 
 		 358 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  42.69 
 
 		 358 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  42.69 
 
 		 358 aa  220  1.9999999999999999e-56  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  39.64 
 
 		 358 aa  211  2e-53  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  40.48 
 
 		 357 aa  206  3e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  40.48 
 
 		 357 aa  206  5e-52  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  40.12 
 
 		 358 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  40.12 
 
 		 387 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  40.12 
 
 		 358 aa  205  8e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  39.14 
 
 		 363 aa  202  6e-51  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  38.46 
 
 		 357 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  38.19 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  38.19 
 
 		 357 aa  201  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  37.14 
 
 		 367 aa  200  3e-50  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  38.32 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  38.32 
 
 		 357 aa  197  3e-49  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5435  porin precursor transmembrane protein  42.28 
 
 		 332 aa  195  8.000000000000001e-49  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  37.88 
 
 		 361 aa  195  1e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  38.21 
 
 		 362 aa  194  2e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  37.88 
 
 		 361 aa  194  2e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  37.85 
 
 		 360 aa  185  9e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B3020  outer membrane protein (porin)  37.5 
 
 		 365 aa  182  7e-45  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  32.35 
 
 		 341 aa  158  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  36.07 
 
 		 344 aa  148  2.0000000000000003e-34  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7659  outer membrane protein (porin)  33.84 
 
 		 340 aa  144  2e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  32.07 
 
 		 339 aa  137  3.0000000000000003e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  32.95 
 
 		 335 aa  130  5.0000000000000004e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  32.76 
 
 		 374 aa  129  9.000000000000001e-29  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  29.24 
 
 		 369 aa  127  2.0000000000000002e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  31.17 
 
 		 352 aa  125  9e-28  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  33.42 
 
 		 350 aa  123  4e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  33.06 
 
 		 351 aa  123  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  34.29 
 
 		 362 aa  123  6e-27  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  31.58 
 
 		 348 aa  122  9.999999999999999e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  31.86 
 
 		 350 aa  120  4.9999999999999996e-26  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  33.24 
 
 		 350 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  33.24 
 
 		 350 aa  119  7.999999999999999e-26  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  32.97 
 
 		 350 aa  118  1.9999999999999998e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  30.75 
 
 		 354 aa  118  1.9999999999999998e-25  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  33.15 
 
 		 338 aa  117  3.9999999999999997e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  30.6 
 
 		 387 aa  115  6.9999999999999995e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  32.01 
 
 		 360 aa  115  8.999999999999998e-25  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  30.87 
 
 		 355 aa  114  3e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  34.08 
 
 		 335 aa  114  3e-24  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  33.72 
 
 		 362 aa  114  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  32.33 
 
 		 370 aa  112  8.000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  32.24 
 
 		 344 aa  112  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  31.64 
 
 		 348 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  31.48 
 
 		 329 aa  106  5e-22  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  29.93 
 
 		 400 aa  105  8e-22  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4558  porin  33.14 
 
 		 360 aa  105  8e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0171  porin  29.57 
 
 		 332 aa  103  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  30.56 
 
 		 349 aa  103  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  31.11 
 
 		 414 aa  103  6e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3158  porin  30.77 
 
 		 368 aa  102  9e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.410423  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1085  porin Gram-negative type  29.97 
 
 		 381 aa  102  1e-20  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.923155  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1069  porin Gram-negative type  30.4 
 
 		 372 aa  101  2e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.992947  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0152  porin Gram-negative type  27.98 
 
 		 326 aa  101  2e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  29.09 
 
 		 355 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0134  porin  27.38 
 
 		 324 aa  99.4  7e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3812  porin  32.96 
 
 		 360 aa  98.6  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.625248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  28.76 
 
 		 355 aa  97.8  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5927  porin  29.44 
 
 		 431 aa  96.7  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.186679  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  29.7 
 
 		 426 aa  96.7  6e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  29.6 
 
 		 355 aa  96.3  6e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  31.01 
 
 		 327 aa  96.3  7e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  28.95 
 
 		 382 aa  95.5  1e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3009  putative outer membrane porin signal peptide protein  32.26 
 
 		 367 aa  94.7  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.494139  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4252  porin  31.45 
 
 		 385 aa  94.7  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.73857  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2502  putative outer membrane protein (porin)  31.46 
 
 		 376 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.506227  normal  0.418434 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2108  putative outer membrane protein (porin)  31.46 
 
 		 376 aa  93.2  5e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  29.06 
 
 		 355 aa  93.2  5e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  30.16 
 
 		 340 aa  92.8  7e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  29.12 
 
 		 336 aa  91.3  2e-17  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  31.08 
 
 		 355 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  31.08 
 
 		 355 aa  91.7  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5999  porin  30.63 
 
 		 352 aa  91.3  2e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.565883  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  29.12 
 
 		 336 aa  90.5  4e-17  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  30.97 
 
 		 358 aa  89.4  9e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6530  outer membrane protein, (porin)-like  27.65 
 
 		 417 aa  87.8  3e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  31.7 
 
 		 368 aa  87.4  4e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  29.31 
 
 		 347 aa  86.7  6e-16  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4956  porin  29.02 
 
 		 347 aa  85.5  0.000000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>