More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_B3020 on replicon NC_007511
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007511  Bcep18194_B3020  outer membrane protein (porin)  100 
 
 		 365 aa  736    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.377594 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  51.21 
 
 		 351 aa  320  3.9999999999999996e-86  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  48.94 
 
 		 352 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  48.94 
 
 		 352 aa  301  2e-80  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  48.32 
 
 		 356 aa  299  6e-80  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  47.71 
 
 		 356 aa  295  7e-79  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0880  porin  45.08 
 
 		 361 aa  272  8.000000000000001e-72  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0359628  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0534  putative outer membrane porin protein precursor  45.29 
 
 		 387 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0511105  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0355  outer membrane porin  45.29 
 
 		 358 aa  271  2e-71  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.17583  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  44.85 
 
 		 358 aa  268  8e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  44.98 
 
 		 358 aa  268  8.999999999999999e-71  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  44.69 
 
 		 359 aa  266  5e-70  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0154  porin  43.1 
 
 		 367 aa  256  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.167447  normal  0.122543 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2963  porin  42.55 
 
 		 358 aa  256  4e-67  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  42.73 
 
 		 358 aa  253  4.0000000000000004e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0429  porin Gram-negative type  43.64 
 
 		 361 aa  251  1e-65  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.568653 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2968  porin  42.25 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2988  porin  42.25 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2354  porin  42.25 
 
 		 358 aa  249  4e-65  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.296881  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4279  OmpC family outer membrane porin  43.03 
 
 		 361 aa  249  4e-65  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.115808 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  42.42 
 
 		 358 aa  248  8e-65  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  42.12 
 
 		 358 aa  248  1e-64  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0804  OmpC family outer membrane porin  40.73 
 
 		 363 aa  248  1e-64  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.554989  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5685  porin  43.03 
 
 		 357 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.523942  normal  0.0446871 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1469  outer membrane protein (porin)-like  39.55 
 
 		 360 aa  243  3.9999999999999997e-63  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00910235  normal  0.207544 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5908  porin  42.42 
 
 		 357 aa  241  2e-62  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.359102  decreased coverage  0.00179215 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  37.72 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  37.43 
 
 		 344 aa  181  2e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1564  porin  36.95 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247151  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6266  porin  36.95 
 
 		 357 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  37.61 
 
 		 344 aa  180  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  36.9 
 
 		 362 aa  179  4.999999999999999e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6742  porin  35.49 
 
 		 357 aa  178  1e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3229  porin  35.65 
 
 		 357 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.484687 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5435  porin precursor transmembrane protein  41.24 
 
 		 332 aa  177  2e-43  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4931  porin  35.65 
 
 		 357 aa  178  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  37.58 
 
 		 340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1479  porin Gram-negative type  34.18 
 
 		 341 aa  167  2.9999999999999998e-40  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  36.17 
 
 		 341 aa  164  2.0000000000000002e-39  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  36.14 
 
 		 342 aa  149  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7659  outer membrane protein (porin)  34.66 
 
 		 340 aa  145  9e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.24829  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  30.59 
 
 		 344 aa  89  1e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  27.3 
 
 		 348 aa  89  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  29.78 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1378  porin  30.5 
 
 		 354 aa  86.3  7e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0478872  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  29.28 
 
 		 355 aa  86.3  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  31.29 
 
 		 351 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  29.45 
 
 		 350 aa  84  0.000000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  29.13 
 
 		 339 aa  82.8  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3234  porin  31.44 
 
 		 401 aa  81.3  0.00000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2122  hypothetical protein  43.33 
 
 		 104 aa  81.3  0.00000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.521605  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  28.31 
 
 		 362 aa  80.5  0.00000000000004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5359  porin  28.32 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.292845  normal  0.581333 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  28.61 
 
 		 350 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  28.61 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  28.61 
 
 		 350 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3623  porin  28.66 
 
 		 372 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3210  porin Gram-negative type  28.61 
 
 		 375 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114966  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3186  porin  27.98 
 
 		 379 aa  77.8  0.0000000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.501929  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3529  porin  27.54 
 
 		 376 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.327335 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0155  porin  30.11 
 
 		 370 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  32.42 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7084  outer membrane protein (porin)  28.12 
 
 		 394 aa  77.4  0.0000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  32.42 
 
 		 354 aa  77  0.0000000000004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3897  porin  28.35 
 
 		 372 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.239452 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6771  porin Gram-negative type  36.77 
 
 		 379 aa  77  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0165431  normal  0.243338 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  29.52 
 
 		 351 aa  77  0.0000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0333  outer membrane porin, putative  28.88 
 
 		 365 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.277065  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  28.76 
 
 		 369 aa  76.6  0.0000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1202  outer membrane protein (porin)  32.06 
 
 		 361 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.818549  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  29.27 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  28.93 
 
 		 360 aa  76.6  0.0000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6595  porin  33.51 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.924404  normal  0.0790344 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1237  porin  33.51 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6199  porin  33.51 
 
 		 394 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.687747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  29.23 
 
 		 357 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02059  porin signal peptide protein  31.05 
 
 		 347 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.000217082  normal  0.648974 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  40.31 
 
 		 355 aa  74.7  0.000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2492  outer membrane protein (porin)  28 
 
 		 372 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0279095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  36.57 
 
 		 349 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  28.61 
 
 		 362 aa  73.6  0.000000000005  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  33.21 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  33.21 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  33.58 
 
 		 449 aa  73.6  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  33.21 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  33.21 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  33.21 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  27.2 
 
 		 387 aa  73.2  0.000000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  30.57 
 
 		 363 aa  73.2  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3848  porin  41.84 
 
 		 418 aa  72  0.00000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0274  OmpC family outer membrane porin  31.31 
 
 		 350 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000878136  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5504  outer membrane porin  26.4 
 
 		 379 aa  71.6  0.00000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1952  putative outer membrane porin  34.52 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.832177  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6767  outer membrane protein (porin)-like  30.18 
 
 		 370 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0380133  normal  0.91585 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1256  putative outer membrane porin  34.52 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0969  putative outer membrane porin  34.52 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.449227  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  28.86 
 
 		 362 aa  72  0.00000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2230  putative outer membrane porin  34.52 
 
 		 359 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.856101  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0061  OmpC family outer membrane porin  26.61 
 
 		 379 aa  71.2  0.00000000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4307  porin  39.72 
 
 		 418 aa  70.9  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0314487  normal  0.78321 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>