More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_0171 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_0171  porin  100 
 
 		 332 aa  681    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0152  porin Gram-negative type  72.13 
 
 		 326 aa  451  1.0000000000000001e-126  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0134  porin  72.13 
 
 		 324 aa  449  1e-125  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1258  porin  30.26 
 
 		 322 aa  108  1e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170456 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  31.61 
 
 		 344 aa  107  2e-22  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  29.57 
 
 		 340 aa  103  4e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  29.78 
 
 		 338 aa  103  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  29.02 
 
 		 374 aa  101  2e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2566  porin  30.84 
 
 		 307 aa  98.6  1e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957532 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  30.32 
 
 		 363 aa  97.4  3e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  29.53 
 
 		 342 aa  96.7  5e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  30 
 
 		 363 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  30 
 
 		 363 aa  95.9  8e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  28.7 
 
 		 363 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  29.88 
 
 		 363 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  29.88 
 
 		 363 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  29.88 
 
 		 363 aa  93.6  4e-18  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  29.88 
 
 		 363 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  28.24 
 
 		 341 aa  93.2  5e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  29.88 
 
 		 363 aa  93.6  5e-18  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  29.29 
 
 		 367 aa  92.8  6e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4558  porin  30.59 
 
 		 360 aa  92.8  8e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  29.55 
 
 		 363 aa  92.4  9e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3812  porin  29.59 
 
 		 360 aa  91.7  1e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.625248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  29.88 
 
 		 449 aa  92  1e-17  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  29.55 
 
 		 363 aa  92  1e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  29.35 
 
 		 392 aa  90.9  3e-17  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  31.07 
 
 		 363 aa  90.1  5e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  30.06 
 
 		 335 aa  89.7  6e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  30.53 
 
 		 350 aa  88.2  2e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2314  porin  30.39 
 
 		 350 aa  87.4  3e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  29.94 
 
 		 349 aa  87  4e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2271  porin  30.43 
 
 		 355 aa  87  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0154536  hitchhiker  0.000000413543 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2933  porin  28.62 
 
 		 365 aa  87  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435653 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  28.7 
 
 		 362 aa  86.7  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  30.64 
 
 		 362 aa  85.9  9e-16  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0966  porin  29.7 
 
 		 355 aa  85.5  0.000000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  29.09 
 
 		 351 aa  85.1  0.000000000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  28.33 
 
 		 353 aa  85.9  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  30.63 
 
 		 348 aa  84.7  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  29.57 
 
 		 354 aa  84.7  0.000000000000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4956  porin  26.61 
 
 		 347 aa  84  0.000000000000003  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  30.61 
 
 		 344 aa  84.3  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  27.87 
 
 		 358 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4258  porin  28.81 
 
 		 344 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0937831  hitchhiker  0.000204948 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3679  porin  31.03 
 
 		 339 aa  81.6  0.00000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0438317  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3413  outer membrane porin  27.25 
 
 		 348 aa  82  0.00000000000001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000336209 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  28.75 
 
 		 327 aa  80.5  0.00000000000003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  27.79 
 
 		 351 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3117  porin  27.57 
 
 		 375 aa  80.5  0.00000000000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0494554  normal  0.199472 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  29.66 
 
 		 400 aa  80.5  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  29.16 
 
 		 351 aa  79.7  0.00000000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  28.53 
 
 		 360 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  25.69 
 
 		 359 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  28.49 
 
 		 355 aa  79  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  27.6 
 
 		 369 aa  78.6  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  27.88 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  27.88 
 
 		 352 aa  77.8  0.0000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  28.61 
 
 		 367 aa  77  0.0000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  28.89 
 
 		 353 aa  77  0.0000000000005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  26.63 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0438  OmpC family outer membrane porin  27.07 
 
 		 344 aa  76.6  0.0000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.513218  normal  0.842946 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4265  porin Gram-negative type  26.21 
 
 		 348 aa  76.3  0.0000000000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.505475 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  28 
 
 		 358 aa  76.3  0.0000000000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1088  porin  27.11 
 
 		 414 aa  75.5  0.000000000001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.56864  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2262  porin Gram-negative type  28.38 
 
 		 356 aa  75.9  0.000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.865753  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  30.48 
 
 		 348 aa  75.1  0.000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4221  outer membrane porin  27.27 
 
 		 362 aa  75.9  0.000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2136  porin signal peptide protein  29.23 
 
 		 352 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101357  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  28.49 
 
 		 350 aa  74.7  0.000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  26.95 
 
 		 340 aa  74.3  0.000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3122  periplasmic-binding protein  28.39 
 
 		 413 aa  74.7  0.000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00833115  normal  0.0608186 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  26.95 
 
 		 379 aa  73.9  0.000000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4315  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  26.78 
 
 		 357 aa  73.9  0.000000000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.320108  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  28.83 
 
 		 355 aa  73.6  0.000000000004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  30.19 
 
 		 335 aa  73.6  0.000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  27.74 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5961  porin Gram-negative type  25.13 
 
 		 426 aa  73.2  0.000000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.116317  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  29.33 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  29.76 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000007  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  29.76 
 
 		 355 aa  72.8  0.000000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1478  porin Gram-negative type  25.45 
 
 		 346 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6530  outer membrane protein, (porin)-like  27.49 
 
 		 417 aa  72.8  0.000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  30 
 
 		 370 aa  72  0.00000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0804  porin  27.82 
 
 		 373 aa  72.4  0.00000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  29.19 
 
 		 354 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  26.89 
 
 		 362 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  28.99 
 
 		 358 aa  71.6  0.00000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6941  outer membrane protein (porin)  28.76 
 
 		 373 aa  71.6  0.00000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000310318  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  28.57 
 
 		 352 aa  71.6  0.00000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  29.13 
 
 		 368 aa  70.5  0.00000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1174  porin  27.63 
 
 		 363 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  28.05 
 
 		 374 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  28.94 
 
 		 383 aa  70.1  0.00000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  29.03 
 
 		 386 aa  70.1  0.00000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2894  OmpC family outer membrane porin  28.45 
 
 		 387 aa  69.7  0.00000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.33569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1412  porin  27.89 
 
 		 371 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170387  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0265  porin  26.21 
 
 		 373 aa  69.3  0.00000000009  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.0179073  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1352  outer membrane porin  28.45 
 
 		 371 aa  68.9  0.0000000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0561388  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  27.21 
 
 		 385 aa  68.6  0.0000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>