More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_2271 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_2271  porin  100 
 
 		 355 aa  711    Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0154536  hitchhiker  0.000000413543 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2136  porin signal peptide protein  63.22 
 
 		 352 aa  414  1e-114  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101357  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  59.32 
 
 		 358 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  60.17 
 
 		 354 aa  411  1e-114  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2314  porin  55.45 
 
 		 350 aa  354  1e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2760  putative porin signal peptide protein  55.62 
 
 		 353 aa  337  9.999999999999999e-92  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102409  normal  0.556039 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1412  porin  43.12 
 
 		 371 aa  263  4.999999999999999e-69  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170387  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1352  outer membrane porin  42.59 
 
 		 371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0561388  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2592  outer membrane porin protein  42.59 
 
 		 371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1437  outer membrane porin  42.59 
 
 		 371 aa  259  5.0000000000000005e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1242  putative outer membrane porin  42.33 
 
 		 371 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0213  putative outer membrane porin  42.33 
 
 		 371 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1086  putative outer membrane porin  42.33 
 
 		 371 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0486  putative outer membrane porin  42.33 
 
 		 371 aa  258  1e-67  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.278408  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1174  porin  41.97 
 
 		 363 aa  250  3e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2933  porin  42.09 
 
 		 365 aa  248  1e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435653 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1296  outer membrane protein (porin)  40.4 
 
 		 368 aa  244  9.999999999999999e-64  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5754  porin  40.69 
 
 		 368 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4550  porin  40.69 
 
 		 368 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.537681 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3975  porin  40.4 
 
 		 369 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0863036  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4439  porin  40.4 
 
 		 369 aa  242  6e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.989602  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5307  porin Gram-negative type  39.56 
 
 		 361 aa  241  2e-62  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4097  porin  40.69 
 
 		 367 aa  240  2e-62  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3611  porin  39.24 
 
 		 370 aa  240  2.9999999999999997e-62  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1236  outer membrane porin lipoprotein transmembrane  41.53 
 
 		 369 aa  233  3e-60  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3818  porin  40.57 
 
 		 369 aa  233  3e-60  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2167  OmpC family outer membrane porin  42.09 
 
 		 369 aa  229  5e-59  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159789  hitchhiker  0.00000436019 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0884  porin  42.78 
 
 		 362 aa  229  6e-59  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273334  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1583  putative outer membrane porin  42.5 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0360665  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  42.5 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  42.5 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2270  putative outer membrane porin  42.5 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  42.5 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  42.5 
 
 		 362 aa  227  2e-58  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000144829  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  42.5 
 
 		 363 aa  227  2e-58  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6806  OmpC family outer membrane porin  41.21 
 
 		 383 aa  223  3e-57  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0843  OmpC family outer membrane porin  38.46 
 
 		 375 aa  223  3e-57  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0712597 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3132  porin  37.1 
 
 		 376 aa  213  4.9999999999999996e-54  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.011649  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2320  outer membrane protein (porin)-like protein  39.83 
 
 		 360 aa  209  6e-53  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0798185  normal  0.76892 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2455  outer membrane protein (porin)-like protein  39.54 
 
 		 361 aa  208  1e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00019464  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0880  outer membrane protein (porin)-like protein  39.43 
 
 		 360 aa  204  2e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5737  outer membrane protein (porin)-like  38.04 
 
 		 359 aa  203  4e-51  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0160198  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2414  outer membrane protein (porin)-like protein  37.75 
 
 		 358 aa  202  9e-51  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200003  decreased coverage  0.00381795 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1798  outer membrane protein (porin)-like  37.75 
 
 		 359 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2410  outer membrane protein (porin)-like protein  37.75 
 
 		 359 aa  202  9.999999999999999e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08631  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1313  OmpC family outer membrane porin  35.06 
 
 		 399 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0122268  normal  0.936999 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1119  outer membrane porin, OmpC family  39.4 
 
 		 383 aa  196  6e-49  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.561071  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3394  OmpC family outer membrane porin  39.51 
 
 		 383 aa  195  9e-49  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126338  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6941  outer membrane protein (porin)  37.46 
 
 		 373 aa  177  2e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000310318  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7242  outer membrane protein (porin)  33.43 
 
 		 372 aa  168  1e-40  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264722  normal  0.33817 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  35.69 
 
 		 355 aa  137  3.0000000000000003e-31  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  34.07 
 
 		 355 aa  133  3.9999999999999996e-30  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  34.32 
 
 		 363 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  34.32 
 
 		 363 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  33.96 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  34.32 
 
 		 449 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  33.96 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  33.96 
 
 		 363 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  33.52 
 
 		 368 aa  130  4.0000000000000003e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3097  porin  34.6 
 
 		 402 aa  129  6e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  33.79 
 
 		 367 aa  129  8.000000000000001e-29  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  32.87 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  32.87 
 
 		 355 aa  128  2.0000000000000002e-28  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  33.43 
 
 		 367 aa  125  2e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  33.04 
 
 		 358 aa  124  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  32.98 
 
 		 363 aa  122  9e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  32.03 
 
 		 354 aa  122  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  33.23 
 
 		 363 aa  121  1.9999999999999998e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3064  porin Gram-negative type  34.52 
 
 		 386 aa  121  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  32.66 
 
 		 376 aa  120  3e-26  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3410  porin Gram-negative type  34.52 
 
 		 386 aa  120  3e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.670382 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  34.55 
 
 		 338 aa  119  7e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  35.29 
 
 		 368 aa  119  7.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3025  porin Gram-negative type  31.23 
 
 		 376 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4230  outer membrane porin  35.28 
 
 		 379 aa  117  1.9999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000540205  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  33.15 
 
 		 335 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  31.23 
 
 		 376 aa  118  1.9999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1737  putative transmembrane outer membrane porin signal peptide protein  32.75 
 
 		 353 aa  117  3e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.172575  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  34.5 
 
 		 374 aa  117  3.9999999999999997e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  32.77 
 
 		 353 aa  117  3.9999999999999997e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3009  putative outer membrane porin signal peptide protein  33.15 
 
 		 367 aa  116  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.494139  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2933  putative porin signal peptide protein  34.58 
 
 		 379 aa  116  6e-25  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  33.77 
 
 		 363 aa  116  6.9999999999999995e-25  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  33.96 
 
 		 354 aa  115  1.0000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3211  porin  31.47 
 
 		 391 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.774727  normal  1 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6332  porin  33.69 
 
 		 365 aa  114  4.0000000000000004e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  decreased coverage  0.00191281  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  30.35 
 
 		 357 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5131  outer membrane protein (porin)  35.65 
 
 		 356 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3237  outer membrane protein (porin)  35.65 
 
 		 356 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.133992  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5150  porin  35.65 
 
 		 356 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.376337  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  31.99 
 
 		 354 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  31.99 
 
 		 354 aa  112  8.000000000000001e-24  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  34.7 
 
 		 356 aa  112  1.0000000000000001e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  33.02 
 
 		 351 aa  110  3e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  32.26 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  30.98 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  30.98 
 
 		 392 aa  110  3e-23  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4265  porin Gram-negative type  33.05 
 
 		 348 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.505475 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6772  porin Gram-negative type  31.45 
 
 		 377 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.00264492  normal  0.103826 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  33.33 
 
 		 363 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>