More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C6941 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C6941  outer membrane protein (porin)  100 
 
 		 373 aa  750    Burkholderia sp. 383  Bacteria  unclonable  0.00000000000310318  normal  0.643054 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7242  outer membrane protein (porin)  55.91 
 
 		 372 aa  422  1e-117  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.264722  normal  0.33817 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3611  porin  41.67 
 
 		 370 aa  259  6e-68  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1412  porin  41.08 
 
 		 371 aa  259  7e-68  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.170387  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1437  outer membrane porin  40.81 
 
 		 371 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.817141  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2592  outer membrane porin protein  40.81 
 
 		 371 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1352  outer membrane porin  40.81 
 
 		 371 aa  252  8.000000000000001e-66  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0561388  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1242  putative outer membrane porin  40.54 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0486  putative outer membrane porin  40.54 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.278408  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1086  putative outer membrane porin  40.54 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0213  putative outer membrane porin  40.54 
 
 		 371 aa  250  3e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4097  porin  40.56 
 
 		 367 aa  245  9.999999999999999e-64  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.334732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5307  porin Gram-negative type  39.57 
 
 		 361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4439  porin  40.64 
 
 		 369 aa  244  1.9999999999999999e-63  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.989602  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3975  porin  40.85 
 
 		 369 aa  243  3e-63  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0863036  normal  0.0262262 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1296  outer membrane protein (porin)  39.52 
 
 		 368 aa  241  1e-62  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.066565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4550  porin  39.78 
 
 		 368 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.537681 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5754  porin  39.78 
 
 		 368 aa  239  4e-62  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.363123  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3818  porin  39.55 
 
 		 369 aa  230  2e-59  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0843  OmpC family outer membrane porin  41.78 
 
 		 375 aa  229  8e-59  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0712597 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6806  OmpC family outer membrane porin  39.44 
 
 		 383 aa  204  2e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0880  outer membrane protein (porin)-like protein  39.67 
 
 		 360 aa  202  8e-51  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  38.61 
 
 		 354 aa  202  8e-51  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  38.33 
 
 		 358 aa  200  3.9999999999999996e-50  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2455  outer membrane protein (porin)-like protein  39.94 
 
 		 361 aa  199  5e-50  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00019464  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5737  outer membrane protein (porin)-like  39.5 
 
 		 359 aa  199  9e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0160198  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0884  porin  39.95 
 
 		 362 aa  197  2.0000000000000003e-49  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.273334  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2320  outer membrane protein (porin)-like protein  39.39 
 
 		 360 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0798185  normal  0.76892 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1091  putative outer membrane porin  38.52 
 
 		 363 aa  193  4e-48  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.432467  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2270  putative outer membrane porin  38.87 
 
 		 362 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0743  outer membrane porin, putative  38.87 
 
 		 362 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  decreased coverage  0.000425296  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1086  putative outer membrane porin  38.87 
 
 		 362 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.420468  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1244  porin  38.87 
 
 		 362 aa  193  5e-48  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289233  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1583  putative outer membrane porin  38.87 
 
 		 362 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0360665  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3014  putative outer membrane porin  38.87 
 
 		 362 aa  193  5e-48  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  decreased coverage  0.0000144829  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1798  outer membrane protein (porin)-like  38.67 
 
 		 359 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.660059  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2410  outer membrane protein (porin)-like protein  38.67 
 
 		 359 aa  192  8e-48  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.08631  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2414  outer membrane protein (porin)-like protein  38.67 
 
 		 358 aa  192  1e-47  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.200003  decreased coverage  0.00381795 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2167  OmpC family outer membrane porin  38.92 
 
 		 369 aa  187  3e-46  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  hitchhiker  0.0000000159789  hitchhiker  0.00000436019 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1119  outer membrane porin, OmpC family  37.6 
 
 		 383 aa  186  4e-46  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.561071  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2271  porin  36.84 
 
 		 355 aa  183  4.0000000000000006e-45  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0154536  hitchhiker  0.000000413543 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3394  OmpC family outer membrane porin  37.11 
 
 		 383 aa  179  4.999999999999999e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.126338  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2136  porin signal peptide protein  38.14 
 
 		 352 aa  172  6.999999999999999e-42  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101357  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2760  putative porin signal peptide protein  36.06 
 
 		 353 aa  171  1e-41  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.102409  normal  0.556039 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1313  OmpC family outer membrane porin  34.34 
 
 		 399 aa  164  3e-39  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0122268  normal  0.936999 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2314  porin  35.75 
 
 		 350 aa  164  3e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2933  porin  34.63 
 
 		 365 aa  162  9e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435653 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1174  porin  33.42 
 
 		 363 aa  154  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1236  outer membrane porin lipoprotein transmembrane  33.6 
 
 		 369 aa  141  1.9999999999999998e-32  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3132  porin  29.23 
 
 		 376 aa  137  2e-31  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.011649  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2100  porin  30.63 
 
 		 367 aa  114  3e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  31.9 
 
 		 358 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  31.56 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  31.56 
 
 		 363 aa  108  2e-22  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  31.28 
 
 		 449 aa  107  3e-22  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1628  porin  30.21 
 
 		 354 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1639  porin  32.46 
 
 		 367 aa  107  4e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0946277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  32.31 
 
 		 351 aa  106  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  30.18 
 
 		 363 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  31.28 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  31.28 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  31.28 
 
 		 363 aa  105  1e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  31.83 
 
 		 363 aa  104  2e-21  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  30.69 
 
 		 355 aa  103  3e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  29.62 
 
 		 392 aa  103  4e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  30.54 
 
 		 363 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  30.32 
 
 		 355 aa  102  9e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  30.32 
 
 		 355 aa  102  9e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  32.25 
 
 		 353 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1072  outer membrane porin  29.9 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.645195  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2365  porin  29.9 
 
 		 379 aa  102  1e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.130283  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5679  porin Gram-negative type  29.44 
 
 		 361 aa  102  1e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.841044 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  29.53 
 
 		 357 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  30.43 
 
 		 363 aa  101  2e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  32.57 
 
 		 383 aa  101  2e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1571  OmpC family outer membrane porin  28.43 
 
 		 382 aa  100  3e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.319374  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  28.5 
 
 		 371 aa  100  5e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  29.95 
 
 		 350 aa  99.8  6e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  29.89 
 
 		 363 aa  99  1e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_012855  Rpic12D_4962  porin Gram-negative type  29.17 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0589815  normal  0.0680007 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2783  porin Gram-negative type  29.17 
 
 		 354 aa  98.6  1e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0106499  normal  0.0987784 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  29.97 
 
 		 354 aa  97.8  2e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  30.12 
 
 		 376 aa  97.8  3e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3816  porin  31.19 
 
 		 409 aa  97.8  3e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.386084  normal  0.290962 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4106  porin  30.75 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.437968  normal  0.0586067 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  30.43 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  30.43 
 
 		 363 aa  97.8  3e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6666  outer membrane protein (porin)  29.13 
 
 		 373 aa  97.1  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16051  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1102  outer membrane protein (porin)  29.75 
 
 		 359 aa  96.7  5e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.243207 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5077  porin Gram-negative type  28.84 
 
 		 382 aa  97.1  5e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0332495  hitchhiker  0.00543855 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4922  porin  28.09 
 
 		 390 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3241  porin  28.09 
 
 		 390 aa  96.3  7e-19  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.535768 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4878  porin  29.06 
 
 		 382 aa  96.3  8e-19  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.311549  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4499  outer membrane protein (porin)  28.65 
 
 		 363 aa  95.9  9e-19  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3981  porin  29.8 
 
 		 359 aa  95.9  9e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0266554 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4571  porin  30.47 
 
 		 359 aa  95.9  9e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.442786  hitchhiker  0.0000361687 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  31.9 
 
 		 353 aa  95.5  1e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  27.97 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  28.87 
 
 		 355 aa  94.7  2e-18  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4712  porin  29.27 
 
 		 359 aa  94.4  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.875326  normal  0.163784 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>