More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ajs_0134 on replicon NC_008782
Organism: Acidovorax sp. JS42



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008782  Ajs_0134  porin  100 
 
 		 324 aa  659    Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0152  porin Gram-negative type  97.84 
 
 		 326 aa  624  1e-178  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0171  porin  71.52 
 
 		 332 aa  449  1e-125  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0683  porin  32.01 
 
 		 374 aa  119  9.999999999999999e-26  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.925989  normal  0.138138 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  32.68 
 
 		 344 aa  116  6.9999999999999995e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2566  porin  34.86 
 
 		 307 aa  114  3e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00957532 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2452  porin Gram-negative type  27.38 
 
 		 340 aa  99.8  5e-20  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  30.34 
 
 		 348 aa  92.8  7e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2920  porin  28.23 
 
 		 342 aa  92  1e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.281008 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3712  porin  30.86 
 
 		 350 aa  90.9  2e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0718332  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  30.81 
 
 		 335 aa  91.7  2e-17  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  28.31 
 
 		 385 aa  90.9  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  28.31 
 
 		 385 aa  90.9  3e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  31.27 
 
 		 351 aa  90.9  3e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0527  porin  29.69 
 
 		 352 aa  90.5  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.0023989  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1258  porin  28.7 
 
 		 322 aa  90.5  4e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000170456 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3663  porin  30.03 
 
 		 363 aa  90.1  5e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.107889  normal  0.482694 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1770  outer membrane protein (porin)  29.81 
 
 		 363 aa  90.1  5e-17  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.170315  normal  0.0138453 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2933  porin  27.51 
 
 		 365 aa  89.4  8e-17  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.435653 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5954  porin  28.53 
 
 		 327 aa  88.6  1e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.77832  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1795  porin  29.97 
 
 		 362 aa  89  1e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1304  porin  31.55 
 
 		 349 aa  89  1e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.916901 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4241  porin  28.92 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0294588  normal  0.0402554 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  27.56 
 
 		 338 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4125  porin  28.92 
 
 		 363 aa  88.2  2e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0517462  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3276  porin  29.22 
 
 		 363 aa  87.4  3e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0390165  normal  0.139851 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0932  porin  29.53 
 
 		 344 aa  87.4  3e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.444223  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1041  OmpC family outer membrane porin  28.66 
 
 		 358 aa  87.8  3e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.000439487  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1125  porin  27.46 
 
 		 341 aa  87  4e-16  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2314  porin  29.66 
 
 		 350 aa  87  4e-16  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.224998 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0661  porin Gram-negative type  29.41 
 
 		 362 aa  86.7  5e-16  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0957089  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4137  porin  29.52 
 
 		 363 aa  86.7  5e-16  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0387994  normal  0.314302 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3413  outer membrane porin  28.57 
 
 		 348 aa  86.7  5e-16  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    decreased coverage  0.000000336209 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  28.86 
 
 		 363 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  28.86 
 
 		 363 aa  86.3  6e-16  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  28.86 
 
 		 363 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  28.86 
 
 		 363 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  28.86 
 
 		 363 aa  86.3  7e-16  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4363  porin  29.04 
 
 		 392 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.357316  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  28.86 
 
 		 449 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  30.38 
 
 		 362 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4343  porin  29.54 
 
 		 329 aa  84  0.000000000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.926116 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2603  porin  29.22 
 
 		 335 aa  83.2  0.000000000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00285277  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1728  porin  28.57 
 
 		 363 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  27.36 
 
 		 389 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2589  porin Gram-negative type  29.17 
 
 		 358 aa  82.8  0.000000000000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3000  porin Gram-negative type  28.3 
 
 		 348 aa  82.4  0.000000000000009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3532  porin  30.43 
 
 		 350 aa  82  0.00000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.869887 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4558  porin  31.7 
 
 		 360 aa  81.3  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2999  porin Gram-negative type  28.66 
 
 		 354 aa  80.9  0.00000000000003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.959541  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4265  porin Gram-negative type  26.57 
 
 		 348 aa  80.9  0.00000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.505475 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3032  porin Gram-negative type  29 
 
 		 336 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0983473  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3347  porin Gram-negative type  27.47 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.735046 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0768  OmpC family outer membrane porin  29.03 
 
 		 393 aa  80.5  0.00000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  28.25 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1313  OmpC family outer membrane porin  28.69 
 
 		 399 aa  80.1  0.00000000000005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0122268  normal  0.936999 
 
 
-
 
NC_003296  RS00714  porin precursor transmembrane protein  27.79 
 
 		 351 aa  79.3  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  decreased coverage  0.000654265  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3634  outer membrane protein, (porin)  27.2 
 
 		 383 aa  79.7  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3751  porin  28.47 
 
 		 336 aa  79.3  0.00000000000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4344  porin  28.79 
 
 		 340 aa  79.3  0.00000000000008  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0698  OmpC family outer membrane porin  28.62 
 
 		 351 aa  79.3  0.00000000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.151008  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS05376  porin signal peptide protein  26.5 
 
 		 368 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.0326647 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3117  porin  29.33 
 
 		 360 aa  79  0.0000000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.482889  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  28.97 
 
 		 390 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0305  outer membrane porin  27.76 
 
 		 358 aa  77.8  0.0000000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.460177  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3812  porin  30.21 
 
 		 360 aa  78.2  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.625248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  27.46 
 
 		 369 aa  77.8  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  28.97 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  28.97 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  28.97 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  28.97 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  28.97 
 
 		 430 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  26.35 
 
 		 383 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  28.97 
 
 		 430 aa  77  0.0000000000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4644  porin  28.19 
 
 		 387 aa  77  0.0000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.182536  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2136  porin signal peptide protein  31.63 
 
 		 352 aa  76.3  0.0000000000008  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.101357  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4796  porin Gram-negative type  26.97 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.0944571 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1084  porin Gram-negative type  30.03 
 
 		 370 aa  74.3  0.000000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0141489  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2439  porin  26.2 
 
 		 359 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4956  porin  27.44 
 
 		 347 aa  74.7  0.000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.845155 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4383  putative porin precursor transmembrane protein  26.87 
 
 		 355 aa  75.1  0.000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.806146 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2361  OmpC family outer membrane porin  29.64 
 
 		 349 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.149156  normal  0.52718 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3719  porin Gram-negative type  26.97 
 
 		 352 aa  75.1  0.000000000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0865217  normal  0.777538 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0497  OmpC family outer membrane porin  28.22 
 
 		 393 aa  74.7  0.000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0440197  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4447  porin Gram-negative type  27.57 
 
 		 393 aa  75.1  0.000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.257562  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  28.62 
 
 		 344 aa  73.9  0.000000000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3122  periplasmic-binding protein  28.78 
 
 		 413 aa  73.9  0.000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00833115  normal  0.0608186 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1478  porin Gram-negative type  25.96 
 
 		 346 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0548  porin  26.63 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.979197  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6317  outer membrane protein, (porin)  26.43 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0610  porin Gram-negative type  29.35 
 
 		 400 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2878  porin  26.43 
 
 		 358 aa  73.6  0.000000000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.636826 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0066  porin  26.63 
 
 		 383 aa  73.9  0.000000000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4787  porin  27.49 
 
 		 357 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0681178  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0153  porin Gram-negative type  28.36 
 
 		 344 aa  73.6  0.000000000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3015  porin  26.13 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  29.92 
 
 		 348 aa  73.2  0.000000000005  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1939  porin Gram-negative type  26.33 
 
 		 356 aa  73.6  0.000000000005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.173023  normal  0.0269425 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0343  outer membrane porin  27.42 
 
 		 358 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0415  OmpC family outer membrane porin  29 
 
 		 386 aa  73.2  0.000000000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>