More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcep18194_C7660 on replicon NC_007509
Organism: Burkholderia sp. 383



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007509  Bcep18194_C7660  outer membrane protein (porin)  100 
 
 		 366 aa  755    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0194748  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1478  porin Gram-negative type  87.57 
 
 		 346 aa  643    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5195  outer membrane porin  77.25 
 
 		 382 aa  569  1e-161  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.163302  normal  0.133933 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6618  porin Gram-negative type  30.16 
 
 		 350 aa  120  3e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0528  porin  32.12 
 
 		 338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  unclonable  0.000000423032  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5721  outer membrane porin  32.19 
 
 		 352 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2607  OmpC family outer membrane porin  30.89 
 
 		 363 aa  116  6e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.782547  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6031  porin  31.27 
 
 		 383 aa  115  1.0000000000000001e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  decreased coverage  0.00960697  normal  0.0888656 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5468  porin  31.22 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00161783  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5394  porin  31.22 
 
 		 383 aa  113  5e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342687 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4876  porin  31.22 
 
 		 383 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4702  porin  31.04 
 
 		 383 aa  111  2.0000000000000002e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.218408  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4871  porin Gram-negative type  37.68 
 
 		 399 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0668668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3709  porin Gram-negative type  31.22 
 
 		 383 aa  110  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0741295  hitchhiker  0.00542912 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5115  porin Gram-negative type  30.06 
 
 		 335 aa  110  5e-23  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0274682 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4239  outer membrane porin  29.02 
 
 		 377 aa  109  7.000000000000001e-23  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.983201  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5216  porin  31.27 
 
 		 354 aa  109  8.000000000000001e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1756  porin Gram-negative type  32.17 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.448713 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_5974  porin OmpC  32.17 
 
 		 355 aa  108  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0182107  normal  0.0474626 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6127  porin  30.24 
 
 		 355 aa  109  1e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000616948  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4209  porin  36.06 
 
 		 395 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0172598  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3359  porin  36.23 
 
 		 394 aa  107  3e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  decreased coverage  0.00120299  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1546  outer membrane protein (porin)  27.63 
 
 		 403 aa  107  4e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.836623 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4762  porin  30.35 
 
 		 350 aa  107  4e-22  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.821427  normal  0.658294 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4157  porin  36.06 
 
 		 395 aa  107  5e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.142098  decreased coverage  0.00226863 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2739  OmpC family outer membrane porin  38.14 
 
 		 364 aa  106  5e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0788528 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5351  porin  30.35 
 
 		 350 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5510  porin  30.35 
 
 		 350 aa  106  6e-22  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0724  porin  29.44 
 
 		 348 aa  106  6e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0148  outer membrane protein (porin)  30.27 
 
 		 350 aa  106  7e-22  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.268856 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4436  porin  28.99 
 
 		 383 aa  105  1e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.412738 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4522  porin  28.19 
 
 		 359 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.243199  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2179  porin Gram-negative type  27.7 
 
 		 344 aa  104  2e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1873  outer membrane protein (porin)  34.62 
 
 		 395 aa  104  3e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  decreased coverage  0.000645139  normal  0.212155 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1795  OmpC family outer membrane porin  37.2 
 
 		 399 aa  103  3e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.234435  hitchhiker  0.000102374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3210  porin Gram-negative type  28.21 
 
 		 375 aa  103  4e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.114966  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4991  porin  28 
 
 		 393 aa  103  4e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.156454  normal  0.214455 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1819  OmpC family outer membrane porin  30.56 
 
 		 364 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.223264  normal  0.224519 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1936  OmpC family outer membrane porin  31.75 
 
 		 369 aa  103  4e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000467885  normal  0.0609572 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0452  porin  37.14 
 
 		 385 aa  103  7e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.14543  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2855  putative outer membrane porin signal peptide protein  28.71 
 
 		 389 aa  102  9e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2747  OmpC family outer membrane porin  37.37 
 
 		 378 aa  102  9e-21  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.168938  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0477  porin  36.67 
 
 		 385 aa  102  1e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3091  outer membrane porin signal peptide protein  35.41 
 
 		 376 aa  101  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.314497  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4834  putative outer membrane pore protein (gram-negative type)  30.22 
 
 		 353 aa  101  2e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  decreased coverage  0.000215004  normal  0.0137442 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2085  porin Gram-negative type  28.25 
 
 		 344 aa  101  2e-20  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3119  outer membrane porin  36.84 
 
 		 430 aa  101  2e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0341441  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1231  OmpC family outer membrane porin  28.05 
 
 		 396 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00623674  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5137  porin  29.82 
 
 		 368 aa  101  3e-20  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5682  porin  29.32 
 
 		 351 aa  100  4e-20  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000517962  normal  0.387629 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5118  outer membrane porin  28.18 
 
 		 355 aa  100  4e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4344  porin  29.43 
 
 		 371 aa  100  6e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1453  outer membrane porin  36.36 
 
 		 430 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3234  outer membrane porin  36.36 
 
 		 430 aa  100  6e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.283288  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0829  OmpC family outer membrane porin  32.11 
 
 		 362 aa  99.8  7e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.0039007  normal  0.098536 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3210  porin Gram-negative type  30.24 
 
 		 368 aa  99.4  9e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0880  OmpC family outer membrane porin  34.98 
 
 		 378 aa  99.4  9e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.456854  normal  0.339444 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6252  porin  30.14 
 
 		 353 aa  99  1e-19  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0682  porin  30.41 
 
 		 362 aa  99  1e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.821761  normal  0.272491 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2847  porin  34.95 
 
 		 389 aa  99  1e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1755  outer membrane protein (porin)  27.15 
 
 		 344 aa  99  1e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1367  putative outer membrane porin  35.89 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2059  porin Gram-negative type  30.37 
 
 		 351 aa  97.8  2e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.806422 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2273  outer membrane porin protein  44.52 
 
 		 449 aa  98.2  2e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5230  outer membrane protein, (porin)  28.41 
 
 		 348 aa  97.8  2e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.430005 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2863  porin Gram-negative type  32.64 
 
 		 374 aa  98.6  2e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.180964 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1107  outer membrane porin OpcP  34.53 
 
 		 436 aa  98.6  2e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1085  putative outer membrane porin  35.89 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.376652  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2350  putative outer membrane porin  35.89 
 
 		 430 aa  98.2  2e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1131  porin  47.06 
 
 		 363 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2059  putative outer membrane porin  35.89 
 
 		 390 aa  97.8  3e-19  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1725  porin  30.32 
 
 		 348 aa  97.8  3e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.340698 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1505  putative outer membrane porin  47.06 
 
 		 363 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0794813  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3786  putative outer membrane porin  28.39 
 
 		 391 aa  97.8  3e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6809  porin gram-negative type  27.85 
 
 		 359 aa  97.4  3e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.357402  hitchhiker  0.0000584942 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0109  putative outer membrane porin  47.06 
 
 		 363 aa  97.4  3e-19  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3372  porin Gram-negative type  32.57 
 
 		 376 aa  97.1  4e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6063  porin  36.92 
 
 		 390 aa  97.1  4e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3605  OmpC family outer membrane porin  29.73 
 
 		 355 aa  97.1  4e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000104312  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1032  outer membrane porin  47.06 
 
 		 363 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5757  outer membrane porin  29.74 
 
 		 387 aa  97.1  4e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0947  outer membrane porin  47.06 
 
 		 363 aa  97.4  4e-19  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.651765  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0649  porin  27.88 
 
 		 344 aa  96.7  6e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220947  normal  0.240142 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2320  outer membrane protein (porin)-like  30.51 
 
 		 381 aa  96.7  6e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4283  porin  35.43 
 
 		 380 aa  96.7  6e-19  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.0748908  normal  0.344647 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2270  outer membrane porin OpcP  36.14 
 
 		 386 aa  96.3  7e-19  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.272228  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3564  porin  36.07 
 
 		 398 aa  96.7  7e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.219626  normal  0.589803 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0650  porin  27.16 
 
 		 369 aa  96.3  8e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  unclonable  0.000000349197  normal  0.162286 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2735  porin Gram-negative type  34.11 
 
 		 392 aa  96.3  8e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.396659  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3100  porin Gram-negative type  34.11 
 
 		 392 aa  96.3  8e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3555  outer membrane porin  35.55 
 
 		 436 aa  95.9  9e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.525449  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5837  porin  36.92 
 
 		 390 aa  95.5  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.543767 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4046  porin  36.07 
 
 		 398 aa  95.9  1e-18  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.565887  normal  0.186391 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_5977  porin  29.55 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297374  decreased coverage  0.000158153 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6498  porin  34.45 
 
 		 390 aa  95.1  1e-18  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0845493  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0158  porin Gram-negative type  28.9 
 
 		 347 aa  95.9  1e-18  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2370  outer membrane porin OpcP  34.2 
 
 		 419 aa  95.5  1e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.52025  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5613  porin  29.55 
 
 		 363 aa  95.5  1e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  decreased coverage  0.00000212183  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6666  outer membrane protein (porin)  34.87 
 
 		 373 aa  94.7  2e-18  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.16051  normal  0.0897495 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0519  porin  34.93 
 
 		 383 aa  94.7  2e-18  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.680874  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>