More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Veis_3420 on replicon NC_008786
Organism: Verminephrobacter eiseniae EF01-2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008786  Veis_3420  regulatory protein, DeoR  100 
 
 		 439 aa  879    Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.382426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3184  DeoR family transcriptional regulator  60.67 
 
 		 269 aa  316  6e-85  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395611 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2362  hypothetical protein  92.54 
 
 		 137 aa  118  1.9999999999999998e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.409842  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2799  type III restriction enzyme, res subunit  78.38 
 
 		 814 aa  115  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0231877  normal  0.391027 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4834  acriflavin resistance protein  100 
 
 		 1083 aa  112  1.0000000000000001e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0829  CoA-binding domain-containing protein  98.21 
 
 		 766 aa  112  2.0000000000000002e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.900451 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1649  isochorismatase hydrolase  96.49 
 
 		 281 aa  110  4.0000000000000004e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.137775  normal  0.599986 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0217  hypothetical protein  100 
 
 		 387 aa  110  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2442  ABC transporter related  60.55 
 
 		 634 aa  110  6e-23  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0403227  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3614  hypothetical protein  57.46 
 
 		 256 aa  109  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0599096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1882  short-chain dehydrogenase/reductase SDR  98.18 
 
 		 312 aa  108  1e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.551347  normal  0.560402 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4187  carbamoyl-phosphate synthase L chain, ATP-binding  86.36 
 
 		 721 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.162597 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4550  hypothetical protein  98.15 
 
 		 952 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0653  hypothetical protein  93.22 
 
 		 108 aa  108  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.10879 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0830  hypothetical protein  91.67 
 
 		 383 aa  108  3e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.360573  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1385  hypothetical protein  98.15 
 
 		 311 aa  107  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.319953  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0647  hypothetical protein  96.36 
 
 		 940 aa  107  5e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.34885  normal  0.818335 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2843  hypothetical protein  77.92 
 
 		 260 aa  106  7e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00708177  normal  0.851819 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4091  hypothetical protein  98.18 
 
 		 87 aa  106  9e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459018  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2437  amino acid adenylation domain-containing protein  96.36 
 
 		 2200 aa  105  1e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4671  hypothetical protein  94.64 
 
 		 101 aa  105  2e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.651437  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3462  hypothetical protein  84.62 
 
 		 100 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0486  hypothetical protein  91.38 
 
 		 100 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2212  hypothetical protein  96.36 
 
 		 383 aa  104  3e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0366732  normal  0.76249 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4553  diaminopimelate epimerase  94.55 
 
 		 382 aa  104  4e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2898  hypothetical protein  96.36 
 
 		 75 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0111524 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0216  hypothetical protein  98.11 
 
 		 220 aa  103  5e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3056  hypothetical protein  96.36 
 
 		 94 aa  103  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0293375 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0516  hypothetical protein  96.3 
 
 		 202 aa  103  6e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0335528  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4861  imidazole glycerol phosphate synthase, glutamine amidotransferase subunit  96.3 
 
 		 270 aa  103  7e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.285943  normal  0.174767 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0145  hypothetical protein  77.03 
 
 		 93 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.356397  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1350  hypothetical protein  96.3 
 
 		 160 aa  102  1e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.137623 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3301  hypothetical protein  96.3 
 
 		 178 aa  101  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.244366 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0862  hypothetical protein  94.55 
 
 		 114 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1191  hypothetical protein  77.46 
 
 		 108 aa  102  2e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0759  hypothetical protein  94.55 
 
 		 80 aa  101  3e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4827  hypothetical protein  92.86 
 
 		 382 aa  100  4e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.419507 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3585  hypothetical protein  87.93 
 
 		 95 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.767622  normal  0.347274 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4462  hypothetical protein  96.23 
 
 		 167 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00243841  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4079  branched-chain amino acid transport  94.34 
 
 		 166 aa  100  5e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3399  hypothetical protein  92.59 
 
 		 109 aa  100  7e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.355088  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0506  hypothetical protein  82.81 
 
 		 172 aa  99.8  9e-20  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2461  class II aldolase/adducin-like protein  77.46 
 
 		 297 aa  99.4  1e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.770236  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0327  hypothetical protein  83.61 
 
 		 113 aa  98.6  2e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.453061  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0788  extracellular solute-binding protein  73.61 
 
 		 358 aa  97.4  4e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00176914  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0406  hypothetical protein  90.74 
 
 		 373 aa  97.1  5e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.173 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0144  hypothetical protein  90.91 
 
 		 183 aa  96.7  7e-19  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0873838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  34.21 
 
 		 257 aa  96.3  9e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3581  hypothetical protein  86.21 
 
 		 106 aa  96.3  1e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0121712  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2085  hypothetical protein  81.54 
 
 		 82 aa  95.1  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.0702268 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3638  DeoR-family regulatory protein  35.75 
 
 		 271 aa  93.2  8e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0131254  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1717  hypothetical protein  89.29 
 
 		 107 aa  93.2  8e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.235337  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  32.21 
 
 		 256 aa  91.7  2e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2430  hypothetical protein  79.66 
 
 		 93 aa  91.3  3e-17  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0458  DeoR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 299 aa  84.3  0.000000000000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0118  hypothetical protein  81.03 
 
 		 120 aa  84.3  0.000000000000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.899916  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2008  acyl-CoA dehydrogenase domain-containing protein  78.57 
 
 		 833 aa  81.6  0.00000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.773218 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  25 
 
 		 258 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  25 
 
 		 258 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  25 
 
 		 258 aa  79.3  0.0000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.41 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  31.41 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.41 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.41 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.41 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.95 
 
 		 269 aa  77  0.0000000000007  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  31.41 
 
 		 269 aa  76.6  0.0000000000007  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.41 
 
 		 269 aa  75.5  0.000000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  25.32 
 
 		 269 aa  75.1  0.000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  28.16 
 
 		 278 aa  74.3  0.000000000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2823  putative glucitol operon repressor  27.56 
 
 		 254 aa  73.9  0.000000000006  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5410  DeoR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.378654  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0038  DeoR family transcriptional regulator  28.79 
 
 		 260 aa  73.6  0.000000000007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5292  DeoR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 258 aa  73.6  0.000000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2701  transcriptional regulator  28.33 
 
 		 270 aa  73.2  0.000000000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.42 
 
 		 269 aa  73.2  0.000000000009  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4603  DeoR family transcriptional regulator  32.16 
 
 		 256 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  24.05 
 
 		 252 aa  72.4  0.00000000001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1537  DeoR family transcriptional regulator  32.18 
 
 		 260 aa  72.8  0.00000000001  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000092764  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5428  DeoR family transcriptional regulator  31.84 
 
 		 258 aa  72.8  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3744  regulatory protein, DeoR  32.16 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  27.05 
 
 		 257 aa  70.9  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  29.1 
 
 		 257 aa  70.5  0.00000000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1024  DeoR family transcriptional regulator  29.38 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000006  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  25.68 
 
 		 260 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3640  DeoR family transcriptional regulator  32.34 
 
 		 254 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000875661  normal  0.0587725 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 263 aa  70.1  0.00000000008  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6351  GlmR transcriptional regulator  31.66 
 
 		 257 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0191  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.51 
 
 		 314 aa  69.7  0.0000000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.276628  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 256 aa  69.3  0.0000000001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73190  GlmR transcriptional regulator  31.66 
 
 		 257 aa  69.3  0.0000000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  25.81 
 
 		 251 aa  68.9  0.0000000002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0199  glycerol-3-phosphate transcriptional regulator  30.51 
 
 		 263 aa  68.6  0.0000000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464707  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5197  DeoR family transcriptional regulator  31.66 
 
 		 258 aa  68.9  0.0000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.342459  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3270  DeoR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 253 aa  68.6  0.0000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  28.89 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  26.96 
 
 		 256 aa  67.8  0.0000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  25.63 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  27.94 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  25.63 
 
 		 251 aa  67.4  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>