More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene SbBS512_E3638 on replicon NC_010658
Organism: Shigella boydii CDC 3083-94



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010658  SbBS512_E3638  DeoR-family regulatory protein  100 
 
 
271 aa  555  1e-157  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0131254  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0458  DeoR family transcriptional regulator  39.01 
 
 
299 aa  112  6e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3184  DeoR family transcriptional regulator  32.6 
 
 
269 aa  94.4  2e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.395611 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3420  regulatory protein, DeoR  35.75 
 
 
439 aa  93.2  4e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.382426  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  26.24 
 
 
258 aa  85.9  7e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  26.24 
 
 
258 aa  85.9  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  26.24 
 
 
258 aa  85.9  7e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  30.77 
 
 
254 aa  85.1  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  27.35 
 
 
260 aa  85.1  0.000000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  29.49 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  28.69 
 
 
259 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  29.49 
 
 
259 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3640  DeoR family transcriptional regulator  31.75 
 
 
254 aa  84  0.000000000000002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000875661  normal  0.0587725 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  28.51 
 
 
294 aa  83.2  0.000000000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  29.78 
 
 
257 aa  82.8  0.000000000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.48 
 
 
278 aa  81.6  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.46 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  31.46 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.46 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.46 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.46 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.46 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  31.46 
 
 
269 aa  81.3  0.00000000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
259 aa  80.5  0.00000000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  33.52 
 
 
263 aa  80.1  0.00000000000003  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  25.29 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  25.29 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.49 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  25.29 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  25.29 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  25.29 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  25.29 
 
 
257 aa  80.1  0.00000000000004  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  32.22 
 
 
255 aa  80.1  0.00000000000004  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.71 
 
 
252 aa  79.7  0.00000000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  25.29 
 
 
257 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.94 
 
 
269 aa  79.7  0.00000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.88 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.88 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
290 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.88 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.88 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.88 
 
 
259 aa  79.7  0.00000000000005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  26.88 
 
 
259 aa  79.3  0.00000000000007  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2902  DeoR family transcriptional regulator  26.69 
 
 
254 aa  79  0.00000000000007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.88 
 
 
278 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6002  DeoR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
259 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  26.88 
 
 
278 aa  79  0.00000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  24.9 
 
 
257 aa  79  0.00000000000008  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  31.67 
 
 
263 aa  79  0.00000000000008  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.71 
 
 
252 aa  79  0.00000000000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  24.9 
 
 
257 aa  79  0.00000000000008  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  27.69 
 
 
294 aa  79  0.00000000000009  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2894  transcriptional regulator, DeoR family  30 
 
 
265 aa  78.2  0.0000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0151849 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4742  DeoR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2210  DeoR family transcriptional regulator  26.61 
 
 
259 aa  78.6  0.0000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.71 
 
 
252 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  32.2 
 
 
254 aa  78.2  0.0000000000001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  27.27 
 
 
294 aa  78.2  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.71 
 
 
252 aa  78.6  0.0000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4126  DeoR family transcriptional regulator  32.63 
 
 
256 aa  78.6  0.0000000000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.138481  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  28.1 
 
 
256 aa  78.2  0.0000000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  31.18 
 
 
252 aa  77.8  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3952  DeoR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00923928  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  29.53 
 
 
274 aa  77.8  0.0000000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.1 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3921  DeoR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230254  normal  0.0231627 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.51 
 
 
269 aa  77.8  0.0000000000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4013  DeoR family transcriptional regulator  32.11 
 
 
256 aa  77.8  0.0000000000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0489456  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4361  DeoR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
256 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.14783  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4503  DeoR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
257 aa  77.4  0.0000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259499  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  31.46 
 
 
270 aa  78.2  0.0000000000002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2688  transcriptional regulator, DeoR family  26.97 
 
 
260 aa  77.8  0.0000000000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0042  transcriptional regulator, DeoR family  31.67 
 
 
252 aa  77.4  0.0000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.15 
 
 
252 aa  77  0.0000000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  26.59 
 
 
256 aa  77  0.0000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.15 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.15 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.15 
 
 
252 aa  76.6  0.0000000000004  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  28.7 
 
 
256 aa  76.6  0.0000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0038  DeoR family transcriptional regulator  28.65 
 
 
260 aa  76.3  0.0000000000005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  32.03 
 
 
264 aa  76.3  0.0000000000005  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0477  DeoR family transcriptional regulator  26.77 
 
 
259 aa  75.9  0.0000000000007  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979079  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4893  DeoR family transcriptional regulator  29.57 
 
 
256 aa  75.9  0.0000000000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239282  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  33.15 
 
 
252 aa  75.5  0.0000000000009  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3044  glycerol-3-phosphate regulon repressor transcription regulator protein  29.39 
 
 
261 aa  75.5  0.0000000000009  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453979  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4041  transcriptional regulator, DeoR family protein  31.02 
 
 
256 aa  74.7  0.000000000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112055  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00830  transcriptional regulator  27.6 
 
 
253 aa  74.7  0.000000000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1565  transcriptional regulator, DeoR family  29.94 
 
 
266 aa  74.3  0.000000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  24.32 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  26.59 
 
 
278 aa  74.3  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4306  transcriptional regulator, DeoR family  31.05 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000000121893 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  24.32 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  24.32 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  24.32 
 
 
257 aa  73.9  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  24.32 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4235  DeoR family transcriptional regulator  30.16 
 
 
268 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00275113  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.39 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.39 
 
 
251 aa  73.9  0.000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4362  DeoR family transcriptional regulator  31.05 
 
 
257 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0187642  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.57 
 
 
257 aa  73.6  0.000000000003  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>