More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bcenmc03_2703 on replicon NC_010508
Organism: Burkholderia cenocepacia MC0-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 
259 aa  533  1e-151  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6002  DeoR family transcriptional regulator  99.61 
 
 
259 aa  531  1e-150  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  99.23 
 
 
294 aa  530  1e-150  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  99.61 
 
 
294 aa  531  1e-150  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  98.46 
 
 
290 aa  527  1e-149  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  98.46 
 
 
259 aa  526  1e-148  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0623  DeoR family transcriptional regulator  96.14 
 
 
294 aa  517  1e-146  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  94.21 
 
 
259 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  94.21 
 
 
259 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  94.21 
 
 
259 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  94.21 
 
 
259 aa  508  1e-143  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  94.21 
 
 
259 aa  508  1e-143  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  94.21 
 
 
278 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  93.82 
 
 
278 aa  505  9.999999999999999e-143  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  94.21 
 
 
278 aa  506  9.999999999999999e-143  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  89.15 
 
 
259 aa  486  1e-136  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3316  transcriptional regulator, DeoR family  88.03 
 
 
259 aa  476  1e-133  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.302839  normal  0.645793 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  87.64 
 
 
259 aa  473  1e-132  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  58 
 
 
261 aa  295  4e-79  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3832  DeoR family transcriptional regulator  54.76 
 
 
277 aa  278  4e-74  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.197321 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2210  DeoR family transcriptional regulator  53.52 
 
 
259 aa  275  4e-73  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1439  transcriptional regulator, DeoR family  51.38 
 
 
275 aa  273  2.0000000000000002e-72  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0159016  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2979  transcriptional regulator, DeoR family  54.8 
 
 
257 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.50447  normal  0.977185 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3326  transcriptional regulator, DeoR family  54.8 
 
 
257 aa  270  2e-71  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  53.6 
 
 
257 aa  268  8e-71  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3044  glycerol-3-phosphate regulon repressor transcription regulator protein  55.37 
 
 
261 aa  266  2.9999999999999995e-70  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.453979  normal  0.196819 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  54.17 
 
 
251 aa  264  1e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  54.62 
 
 
251 aa  263  2e-69  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  54.2 
 
 
251 aa  262  4e-69  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0477  DeoR family transcriptional regulator  55.32 
 
 
259 aa  262  4e-69  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979079  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0374  transcriptional regulator, DeoR family  50.2 
 
 
262 aa  262  4e-69  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.300794  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  53.09 
 
 
251 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  53.09 
 
 
251 aa  261  8e-69  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2323  DeoR family transcriptional regulator  55.46 
 
 
254 aa  261  8.999999999999999e-69  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387167  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  53.31 
 
 
286 aa  260  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  52.67 
 
 
251 aa  259  2e-68  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  54.2 
 
 
251 aa  260  2e-68  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3731  regulatory protein, DeoR  52.02 
 
 
254 aa  259  4e-68  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0383  DeoR family transcriptional regulator  51.78 
 
 
254 aa  259  4e-68  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002674  glycerol-3-phosphate regulon repressor DeoR family  48.59 
 
 
263 aa  258  5.0000000000000005e-68  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  53.78 
 
 
251 aa  258  7e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3398  transcriptional regulator, DeoR family  52.8 
 
 
255 aa  258  7e-68  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.833771  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  55.41 
 
 
251 aa  257  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0603  DeoR family transcriptional regulator  52.36 
 
 
254 aa  257  1e-67  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  56.28 
 
 
263 aa  256  2e-67  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0199  glycerol-3-phosphate transcriptional regulator  54.22 
 
 
263 aa  257  2e-67  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464707  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2235  DeoR family transcriptional regulator  50.78 
 
 
259 aa  256  2e-67  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.859699  normal  0.0514044 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2105  DeoR family transcriptional regulator  53.16 
 
 
256 aa  256  3e-67  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  57.14 
 
 
256 aa  256  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  48.99 
 
 
263 aa  256  3e-67  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0191  glycerol-3-phosphate regulon repressor  53.82 
 
 
314 aa  256  4e-67  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.276628  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3954  DeoR family transcriptional regulator  53.85 
 
 
256 aa  254  1.0000000000000001e-66  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2902  DeoR family transcriptional regulator  55.17 
 
 
254 aa  254  1.0000000000000001e-66  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  51.19 
 
 
253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  53.33 
 
 
252 aa  252  3e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5984  transcriptional regulator, DeoR family  54.66 
 
 
257 aa  251  7e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  50.59 
 
 
259 aa  251  7e-66  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  50.64 
 
 
255 aa  251  9.000000000000001e-66  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  54.66 
 
 
257 aa  251  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  51.28 
 
 
253 aa  251  1e-65  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  50.2 
 
 
259 aa  249  2e-65  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  56.03 
 
 
256 aa  249  3e-65  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  51.6 
 
 
284 aa  248  5e-65  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1769  DeoR family transcriptional regulator  53.01 
 
 
265 aa  247  2e-64  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.125805  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1024  DeoR family transcriptional regulator  50 
 
 
254 aa  246  3e-64  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3997  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  48.18 
 
 
252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3757  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  48.18 
 
 
252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0157  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  48.18 
 
 
252 aa  245  4.9999999999999997e-64  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  48.18 
 
 
252 aa  244  9e-64  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  48.18 
 
 
252 aa  244  9e-64  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  47.77 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4640  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  48.36 
 
 
252 aa  243  1.9999999999999999e-63  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0313  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  47.77 
 
 
252 aa  242  5e-63  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  50.61 
 
 
277 aa  242  5e-63  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00243  Glycerol-3-phosphate regulon repressor  49.37 
 
 
252 aa  239  2e-62  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2619  DeoR family transcriptional regulator  50 
 
 
256 aa  239  2e-62  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.694868 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3176  transcriptional regulator of DeoR family protein  47.01 
 
 
270 aa  240  2e-62  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.548886  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  51.21 
 
 
266 aa  239  2.9999999999999997e-62  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  48.61 
 
 
257 aa  239  4e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4660  DeoR family transcriptional regulator  53.91 
 
 
260 aa  238  5e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  51.64 
 
 
268 aa  237  1e-61  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3729  transcriptional regulator, DeoR family  52.84 
 
 
267 aa  236  3e-61  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  49.19 
 
 
257 aa  235  6e-61  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3270  DeoR family transcriptional regulator  51.01 
 
 
253 aa  234  9e-61  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  50.43 
 
 
254 aa  230  2e-59  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4896  transcriptional regulator, DeoR family  48.8 
 
 
265 aa  228  7e-59  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302168  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  47.39 
 
 
252 aa  227  1e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  47.39 
 
 
252 aa  227  1e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  47.39 
 
 
252 aa  227  1e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  47.39 
 
 
252 aa  227  1e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  48.48 
 
 
252 aa  226  3e-58  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1360  DeoR family transcriptional regulator  49.6 
 
 
274 aa  225  4e-58  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.019749  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  45.8 
 
 
252 aa  225  5.0000000000000005e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2180  DeoR family transcriptional regulator  45.42 
 
 
273 aa  225  6e-58  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  46.96 
 
 
252 aa  224  1e-57  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  46.96 
 
 
252 aa  224  1e-57  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  46.96 
 
 
252 aa  224  1e-57  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  46.96 
 
 
252 aa  224  1e-57  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  46.75 
 
 
252 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  46.75 
 
 
252 aa  224  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>