More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_3184 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010002  Daci_3184  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 269 aa  543  1e-153  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.395611 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3420  regulatory protein, DeoR  60.22 
 
 		 439 aa  305  6e-82  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.382426  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3638  DeoR-family regulatory protein  33.77 
 
 		 271 aa  102  6e-21  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0131254  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0458  DeoR family transcriptional regulator  32.46 
 
 		 299 aa  91.7  1e-17  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  30.62 
 
 		 257 aa  88.2  1e-16  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  26.38 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  26.38 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  26.38 
 
 		 258 aa  79.7  0.00000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  30.64 
 
 		 254 aa  79.3  0.00000000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 256 aa  77.4  0.0000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.35 
 
 		 269 aa  77.8  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  27.6 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.19 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  27.19 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.19 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.19 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.19 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  27.19 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.19 
 
 		 269 aa  76.3  0.0000000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  27.6 
 
 		 251 aa  75.5  0.000000000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.9 
 
 		 269 aa  74.7  0.000000000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  27.18 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  27.18 
 
 		 251 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  27.42 
 
 		 252 aa  73.9  0.000000000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  24.3 
 
 		 252 aa  73.2  0.000000000004  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3954  DeoR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 256 aa  72.8  0.000000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  27.2 
 
 		 252 aa  71.6  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2105  DeoR family transcriptional regulator  27.92 
 
 		 256 aa  71.6  0.00000000001  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.72 
 
 		 269 aa  72  0.00000000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  25.93 
 
 		 274 aa  69.3  0.00000000006  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.8 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.8 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0374  transcriptional regulator, DeoR family  25.61 
 
 		 262 aa  68.9  0.00000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.300794  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.8 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.8 
 
 		 252 aa  68.9  0.00000000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  25.42 
 
 		 264 aa  68.6  0.00000000009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  27.2 
 
 		 251 aa  68.2  0.0000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0383  DeoR family transcriptional regulator  26.21 
 
 		 254 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  28.4 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  28.4 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  28.4 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  27.53 
 
 		 257 aa  67.4  0.0000000002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  28.4 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  30.93 
 
 		 282 aa  67.8  0.0000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  28.4 
 
 		 257 aa  68.2  0.0000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  28.57 
 
 		 259 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5410  DeoR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.378654  hitchhiker  0.00216246 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  28.57 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  28.57 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5292  DeoR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 258 aa  67  0.0000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.358766 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  32.05 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  28.57 
 
 		 257 aa  67  0.0000000003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2823  putative glucitol operon repressor  26.46 
 
 		 254 aa  67  0.0000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4235  DeoR family transcriptional regulator  31.64 
 
 		 268 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00275113  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5428  DeoR family transcriptional regulator  31.28 
 
 		 258 aa  66.2  0.0000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  28.57 
 
 		 259 aa  66.2  0.0000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2323  DeoR family transcriptional regulator  25.73 
 
 		 254 aa  66.2  0.0000000006  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.387167  normal  0.710388 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3640  DeoR family transcriptional regulator  30.68 
 
 		 254 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.000875661  normal  0.0587725 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4348  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  25.98 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4141  DeoR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.767927 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4102  DeoR family transcriptional regulator  25.98 
 
 		 262 aa  65.1  0.000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4603  DeoR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 256 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  26.01 
 
 		 251 aa  63.9  0.000000002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  26.36 
 
 		 252 aa  63.9  0.000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1024  DeoR family transcriptional regulator  26.45 
 
 		 254 aa  64.3  0.000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  25.42 
 
 		 257 aa  64.3  0.000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0477  DeoR family transcriptional regulator  24.05 
 
 		 259 aa  64.3  0.000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.979079  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  26 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  26.02 
 
 		 259 aa  63.5  0.000000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0291  transcriptional regulator, DeoR family  26 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  26 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  28.63 
 
 		 290 aa  63.9  0.000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3832  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.58 
 
 		 252 aa  63.5  0.000000003  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.365514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4482  DeoR family transcriptional regulator  25.5 
 
 		 256 aa  63.2  0.000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000793967 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000004  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  26.86 
 
 		 257 aa  62.8  0.000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4730  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26 
 
 		 252 aa  63.2  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  27.14 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26 
 
 		 252 aa  62.8  0.000000006  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4893  DeoR family transcriptional regulator  28.41 
 
 		 256 aa  62.8  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.239282  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  26.05 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000007  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1565  transcriptional regulator, DeoR family  24.31 
 
 		 266 aa  62.4  0.000000007  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.333712  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03885  transcriptional regulator, DeoR family protein  30.98 
 
 		 269 aa  62.4  0.000000008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.81593  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0643  DeoR family transcriptional regulator  26.14 
 
 		 259 aa  62  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.933913  normal  0.670874 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  24.37 
 
 		 253 aa  61.6  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3949  chitinase II  31.49 
 
 		 255 aa  62  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.985635  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0231  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.69 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2267  transcriptional regulator, DeoR family  28.1 
 
 		 259 aa  61.6  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.481568  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4126  DeoR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 256 aa  61.6  0.00000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.138481  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3929  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.69 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  24.58 
 
 		 257 aa  61.6  0.00000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4122  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  26.69 
 
 		 252 aa  62  0.00000001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3840  DeoR family transcriptional regulator  27.84 
 
 		 256 aa  62  0.00000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.897226  hitchhiker  0.000196031 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  26.36 
 
 		 253 aa  61.2  0.00000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  29.31 
 
 		 288 aa  61.2  0.00000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  24.46 
 
 		 256 aa  61.2  0.00000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>