More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_2267 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_2267  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 259 aa  516  1.0000000000000001e-145  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.481568  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2688  transcriptional regulator, DeoR family  35.71 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  36.9 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 258 aa  132  5e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  35.12 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  38.4 
 
 		 274 aa  123  2e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  34.54 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  32.51 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  28.74 
 
 		 254 aa  120  3e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  30.77 
 
 		 257 aa  119  3.9999999999999996e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 267 aa  118  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  31.25 
 
 		 260 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  30.8 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  32.53 
 
 		 267 aa  116  3.9999999999999997e-25  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.56 
 
 		 269 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  29.88 
 
 		 254 aa  114  2.0000000000000002e-24  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  29.64 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  31.73 
 
 		 257 aa  113  3e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2802  DeoR family transcriptional regulator  31.62 
 
 		 262 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.364979  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 261 aa  112  5e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  29.15 
 
 		 261 aa  112  6e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  31.78 
 
 		 264 aa  109  5e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  34.47 
 
 		 250 aa  109  5e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  29.54 
 
 		 258 aa  108  6e-23  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  28 
 
 		 288 aa  109  6e-23  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  30.83 
 
 		 264 aa  108  6e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  29.54 
 
 		 258 aa  108  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.67 
 
 		 269 aa  108  6e-23  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  29.54 
 
 		 258 aa  108  6e-23  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  28.75 
 
 		 275 aa  108  7.000000000000001e-23  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  28 
 
 		 253 aa  108  7.000000000000001e-23  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  28.17 
 
 		 263 aa  108  8.000000000000001e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  30.21 
 
 		 256 aa  108  8.000000000000001e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  29.53 
 
 		 289 aa  108  1e-22  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  32.39 
 
 		 255 aa  107  1e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  26.67 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3716  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 257 aa  107  1e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  27.92 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  27.92 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.92 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  27.42 
 
 		 266 aa  107  2e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  31.08 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.92 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.92 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  27.92 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  27.92 
 
 		 269 aa  107  2e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0326  DeoR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 251 aa  106  4e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.281127  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  28.03 
 
 		 269 aa  105  5e-22  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  31.33 
 
 		 252 aa  105  6e-22  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  34.48 
 
 		 251 aa  104  1e-21  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  27.71 
 
 		 260 aa  104  1e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 256 aa  104  1e-21  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  32.26 
 
 		 254 aa  103  2e-21  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  28.93 
 
 		 282 aa  104  2e-21  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  28.51 
 
 		 290 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02920  transcriptional regulator of sugar metabolism  28.68 
 
 		 276 aa  103  3e-21  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 260 aa  103  4e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0705  transcriptional regulator, DeoR family  29.92 
 
 		 255 aa  102  7e-21  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  31.03 
 
 		 253 aa  101  9e-21  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  27.69 
 
 		 266 aa  102  9e-21  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  29.08 
 
 		 284 aa  101  1e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  31.74 
 
 		 265 aa  101  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3321  DeoR family transcriptional regulator  30.91 
 
 		 245 aa  101  1e-20  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3215  transcriptional regulator, DeoR family  28.8 
 
 		 252 aa  101  1e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 251 aa  100  2e-20  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  32.22 
 
 		 248 aa  100  2e-20  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  28.86 
 
 		 262 aa  100  2e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2643  DeoR family transcriptional regulator  26.97 
 
 		 248 aa  100  3e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00470761  hitchhiker  0.000206401 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  26.8 
 
 		 256 aa  100  3e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  31.1 
 
 		 254 aa  100  3e-20  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  31.9 
 
 		 266 aa  100  3e-20  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3738  DeoR family transcriptional regulator  28.52 
 
 		 266 aa  99.8  4e-20  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.387174  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 255 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 255 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  26.25 
 
 		 255 aa  99.4  6e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  28.99 
 
 		 257 aa  99  6e-20  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  30.17 
 
 		 260 aa  98.6  9e-20  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  27.31 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 252 aa  98.2  1e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  27.49 
 
 		 267 aa  97.8  1e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  28.76 
 
 		 253 aa  98.2  1e-19  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  30.17 
 
 		 258 aa  97.8  1e-19  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1851  regulatory protein, DeoR  27.45 
 
 		 264 aa  97.4  2e-19  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1070  transcriptional regulator, DeoR family  32.91 
 
 		 256 aa  97.4  2e-19  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0167958  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  27.6 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  31.08 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.08 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  31.08 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  27.6 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.08 
 
 		 257 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.08 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2055  DeoR family transcriptional regulator  27.67 
 
 		 252 aa  97.1  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0500413 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  27.6 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.08 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.08 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  31.08 
 
 		 257 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  27.6 
 
 		 252 aa  96.7  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  27.6 
 
 		 252 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  27.2 
 
 		 252 aa  96.3  4e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>