More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mesil_3053 on replicon NC_014212
Organism: Meiothermus silvanus DSM 9946



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 257 aa  513  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 267 aa  160  2e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  37.35 
 
 		 258 aa  160  2e-38  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  36.82 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  37.34 
 
 		 250 aa  159  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  37.31 
 
 		 259 aa  158  7e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  37.31 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  37.31 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  37.31 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  37.31 
 
 		 259 aa  158  8e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 254 aa  154  1e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  37.65 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  37.65 
 
 		 251 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  36.65 
 
 		 254 aa  153  2.9999999999999998e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  37.75 
 
 		 266 aa  152  5.9999999999999996e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  37.15 
 
 		 264 aa  151  8e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  36.95 
 
 		 266 aa  151  8.999999999999999e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  37.2 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  37.75 
 
 		 282 aa  151  1e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 255 aa  150  1e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  37.2 
 
 		 255 aa  150  2e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  37.2 
 
 		 255 aa  149  3e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.8 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  36.8 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  36.82 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  37.01 
 
 		 254 aa  149  6e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 254 aa  148  8e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  37.8 
 
 		 266 aa  148  9e-35  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  38.49 
 
 		 263 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  37.01 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  38.58 
 
 		 267 aa  147  1.0000000000000001e-34  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0778  transcriptional regulator, DeoR family  40 
 
 		 256 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.532407  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  36 
 
 		 260 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  37.01 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  36.69 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  37.01 
 
 		 254 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  37.66 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.47 
 
 		 269 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  37.61 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  38.6 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 251 aa  145  5e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.94 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  32.94 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.94 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.94 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  32.94 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.94 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.94 
 
 		 269 aa  145  6e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  38.79 
 
 		 254 aa  145  7.0000000000000006e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 251 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  37.61 
 
 		 251 aa  145  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  36.11 
 
 		 248 aa  145  8.000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  35.94 
 
 		 267 aa  145  8.000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  38.94 
 
 		 286 aa  144  9e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  36.51 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 251 aa  144  1e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  30.92 
 
 		 254 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4660  DeoR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.95 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  40.09 
 
 		 251 aa  143  3e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  36.18 
 
 		 274 aa  142  4e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  33.6 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  36.29 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 		 290 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  36.61 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  33.6 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 258 aa  142  4e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1487  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 249 aa  142  6e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000342714  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  36.86 
 
 		 256 aa  142  6e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  35.46 
 
 		 261 aa  142  7e-33  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0113  transcriptional regulator, DeoR family  34.29 
 
 		 253 aa  142  7e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0895  transcriptional regulator, DeoR family  38.4 
 
 		 260 aa  141  8e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0542275 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  34.65 
 
 		 258 aa  142  8e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0146  DeoR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  33.74 
 
 		 260 aa  140  9.999999999999999e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  36.32 
 
 		 284 aa  140  9.999999999999999e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  36.22 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  36.22 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0011  sugar metabolism transcriptional regulator  35.18 
 
 		 252 aa  141  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  36.22 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2958  transcriptional regulator, DeoR family  37.9 
 
 		 262 aa  141  9.999999999999999e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00162277  decreased coverage  0.000126005 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0131  DeoR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 263 aa  141  9.999999999999999e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  36.22 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01261  predicted DNA-binding transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.016563  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1919  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00149597  hitchhiker  0.0000000000000423731 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1844  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000849222  hitchhiker  4.81659e-17 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1396  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000000115636  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1460  DeoR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.585922  normal  0.541781 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2746  DeoR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 269 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.437292  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2342  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.148271  hitchhiker  0.00000344058 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  36.22 
 
 		 258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3326  transcriptional regulator, DeoR family  33.86 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2824  DeoR family transcriptional regulator  34.77 
 
 		 270 aa  140  1.9999999999999998e-32  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1515  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 249 aa  140  1.9999999999999998e-32  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0337774  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2363  transcriptional regulator, DeoR family  32.93 
 
 		 249 aa  140  3e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000267978  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1439  transcriptional regulator, DeoR family  30.95 
 
 		 275 aa  139  3e-32  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0159016  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  34 
 
 		 261 aa  139  3.9999999999999997e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>