More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acel_0720 on replicon NC_008578
Organism: Acidothermus cellulolyticus 11B



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  503  1e-141  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  58 
 
 		 253 aa  281  7.000000000000001e-75  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  56.52 
 
 		 253 aa  278  5e-74  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  56.92 
 
 		 253 aa  270  2e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  57.2 
 
 		 253 aa  269  2.9999999999999997e-71  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  54.94 
 
 		 253 aa  261  1e-68  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  54.1 
 
 		 253 aa  258  6e-68  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  56.92 
 
 		 253 aa  257  1e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  55.34 
 
 		 253 aa  254  1.0000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  53.47 
 
 		 253 aa  252  5.000000000000001e-66  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  51.78 
 
 		 253 aa  245  6e-64  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  53.66 
 
 		 253 aa  234  8e-61  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  51.44 
 
 		 255 aa  217  1e-55  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 255 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 255 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  49.19 
 
 		 255 aa  215  4e-55  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  48.95 
 
 		 255 aa  209  2e-53  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  47.7 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  47.44 
 
 		 259 aa  202  5e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  41.84 
 
 		 274 aa  191  1e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  39.92 
 
 		 253 aa  189  5e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  46.44 
 
 		 256 aa  186  4e-46  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  46.58 
 
 		 256 aa  179  2.9999999999999997e-44  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  43.75 
 
 		 258 aa  172  2.9999999999999996e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5588  DeoR family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 252 aa  167  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  33.88 
 
 		 253 aa  165  6.9999999999999995e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  37.93 
 
 		 250 aa  164  1.0000000000000001e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  39.83 
 
 		 258 aa  163  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  39.77 
 
 		 269 aa  163  3e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  42.15 
 
 		 254 aa  162  4.0000000000000004e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  37.34 
 
 		 254 aa  159  4e-38  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  39.09 
 
 		 267 aa  159  5e-38  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  35.93 
 
 		 254 aa  158  9e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  38.43 
 
 		 268 aa  157  1e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  35.1 
 
 		 257 aa  157  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  39.27 
 
 		 267 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  37.99 
 
 		 251 aa  155  4e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  34.92 
 
 		 288 aa  154  1e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  38.79 
 
 		 260 aa  152  7e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  37.76 
 
 		 257 aa  152  7e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  40.49 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  39.15 
 
 		 264 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  37.1 
 
 		 258 aa  149  5e-35  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  37.86 
 
 		 258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  39.22 
 
 		 266 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 256 aa  146  3e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  37.89 
 
 		 282 aa  145  7.0000000000000006e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  39.9 
 
 		 264 aa  144  1e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  38.67 
 
 		 289 aa  144  1e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  37.6 
 
 		 253 aa  144  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  40.95 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  33.99 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  37.4 
 
 		 254 aa  142  5e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  37.93 
 
 		 254 aa  142  7e-33  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  34.43 
 
 		 259 aa  141  8e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  34.43 
 
 		 259 aa  141  8e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  38.63 
 
 		 257 aa  141  8e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  38.26 
 
 		 264 aa  141  9e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  34.43 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  34.43 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  34.43 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  34.43 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  29.64 
 
 		 258 aa  140  3e-32  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  38.84 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  35.97 
 
 		 254 aa  139  3e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  34.87 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  37.05 
 
 		 254 aa  140  3e-32  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  35.54 
 
 		 256 aa  139  3e-32  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  35.97 
 
 		 254 aa  139  3.9999999999999997e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  37.96 
 
 		 256 aa  139  4.999999999999999e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22300  transcriptional regulator of sugar metabolism  41.45 
 
 		 253 aa  139  6e-32  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  38.66 
 
 		 252 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  36.86 
 
 		 290 aa  138  7.999999999999999e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 254 aa  138  7.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  35.57 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  34.21 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  39.27 
 
 		 267 aa  137  1e-31  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  37.02 
 
 		 255 aa  137  1e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0895  transcriptional regulator, DeoR family  39.84 
 
 		 260 aa  137  1e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.0542275 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  35.57 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  35.42 
 
 		 259 aa  137  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  37.02 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  37.97 
 
 		 258 aa  137  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  33.48 
 
 		 253 aa  136  2e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  36.84 
 
 		 268 aa  137  2e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  37.02 
 
 		 255 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  37.23 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  37.23 
 
 		 265 aa  136  3.0000000000000003e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  37.55 
 
 		 261 aa  136  3.0000000000000003e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  30.35 
 
 		 258 aa  135  4e-31  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  30.35 
 
 		 258 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  30.35 
 
 		 258 aa  135  4e-31  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  36.48 
 
 		 254 aa  135  5e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  34.5 
 
 		 256 aa  135  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  35.96 
 
 		 265 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>