More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Smal_3818 on replicon NC_011071
Organism: Stenotrophomonas maltophilia R551-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  100 
 
 		 258 aa  513  1e-144  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  52.78 
 
 		 269 aa  257  2e-67  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  52.38 
 
 		 269 aa  256  4e-67  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  51.76 
 
 		 269 aa  254  9e-67  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  51.98 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  51.98 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  51.98 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  51.98 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  51.98 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  51.98 
 
 		 269 aa  253  2.0000000000000002e-66  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  51.19 
 
 		 269 aa  249  4e-65  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  44.53 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  44.53 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  44.53 
 
 		 258 aa  223  2e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  46.64 
 
 		 260 aa  222  4e-57  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 257 aa  222  4e-57  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 261 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 261 aa  216  4e-55  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  46.27 
 
 		 261 aa  215  7e-55  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  45.1 
 
 		 256 aa  213  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  47.24 
 
 		 267 aa  202  3e-51  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  41.11 
 
 		 254 aa  195  5.000000000000001e-49  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 264 aa  191  1e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  42.34 
 
 		 255 aa  187  1e-46  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  41.6 
 
 		 288 aa  184  2.0000000000000003e-45  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  38.58 
 
 		 254 aa  180  2e-44  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  42.29 
 
 		 256 aa  180  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 258 aa  179  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  39.52 
 
 		 257 aa  178  7e-44  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  36.99 
 
 		 250 aa  173  2.9999999999999996e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  38.58 
 
 		 252 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  39.22 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  39.22 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  39.22 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  39.22 
 
 		 257 aa  170  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  38.82 
 
 		 257 aa  168  6e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  38.82 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  38.82 
 
 		 257 aa  168  7e-41  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  37.8 
 
 		 254 aa  168  9e-41  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  38.43 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  38.43 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  38.43 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  38.43 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  38.43 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  38.04 
 
 		 257 aa  166  2.9999999999999998e-40  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  40.96 
 
 		 254 aa  165  5e-40  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0673  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  36.26 
 
 		 269 aa  165  5.9999999999999996e-40  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  38.04 
 
 		 257 aa  163  2.0000000000000002e-39  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  39.2 
 
 		 255 aa  162  5.0000000000000005e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  38.49 
 
 		 257 aa  162  6e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  38.55 
 
 		 254 aa  161  9e-39  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  37.35 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 254 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  36.72 
 
 		 257 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3840  DeoR family transcriptional regulator  43.13 
 
 		 256 aa  160  2e-38  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.897226  hitchhiker  0.000196031 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  36.08 
 
 		 259 aa  160  2e-38  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  36.72 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1537  DeoR family transcriptional regulator  39.92 
 
 		 260 aa  159  3e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000092764  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  36.72 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  36.72 
 
 		 257 aa  159  3e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 253 aa  159  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  36.72 
 
 		 257 aa  159  5e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1140  galactitol utilization operon repressor  35.36 
 
 		 263 aa  158  6e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.556636  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  35.69 
 
 		 259 aa  158  6e-38  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  35.69 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  35.69 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  35.69 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  35.69 
 
 		 257 aa  158  7e-38  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1034  DeoR family transcriptional regulator  37.65 
 
 		 268 aa  157  2e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.631262  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 251 aa  156  2e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  38.65 
 
 		 258 aa  157  2e-37  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  41.67 
 
 		 266 aa  157  2e-37  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4041  transcriptional regulator, DeoR family protein  41.29 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.112055  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  33.73 
 
 		 263 aa  156  4e-37  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  40.41 
 
 		 264 aa  155  4e-37  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 253 aa  156  4e-37  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  39 
 
 		 267 aa  155  5.0000000000000005e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1101  transcriptional regulator, DeoR family  37.4 
 
 		 257 aa  155  6e-37  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3921  DeoR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 260 aa  152  4e-36  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.230254  normal  0.0231627 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4742  DeoR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  39.36 
 
 		 260 aa  152  5e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4013  DeoR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0489456  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2823  putative glucitol operon repressor  38.52 
 
 		 254 aa  152  5.9999999999999996e-36  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  37.15 
 
 		 257 aa  151  8e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2162  transcriptional regulator, DeoR family  38.31 
 
 		 261 aa  151  1e-35  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  38.43 
 
 		 266 aa  150  1e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4126  DeoR family transcriptional regulator  40.84 
 
 		 256 aa  151  1e-35  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.138481  normal  0.420745 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4482  DeoR family transcriptional regulator  41.22 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000793967 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3952  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 		 256 aa  150  2e-35  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.00923928  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  40.24 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4361  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.14783  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  38.59 
 
 		 256 aa  149  6e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4503  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.259499  normal  0.116271 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  35 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4235  DeoR family transcriptional regulator  41.35 
 
 		 268 aa  147  1.0000000000000001e-34  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00275113  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4362  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 		 257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0187642  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  36.8 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  37.94 
 
 		 284 aa  146  3e-34  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3530  transcriptional regulator, DeoR family  32.55 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127721  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>