More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_2460 on replicon NC_013526
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
264 aa  530  1e-150  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  50.76 
 
 
284 aa  256  3e-67  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  40.39 
 
 
254 aa  179  4e-44  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  43.53 
 
 
250 aa  177  1e-43  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  41.34 
 
 
258 aa  175  7e-43  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  36.9 
 
 
257 aa  174  1.9999999999999998e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  36.76 
 
 
254 aa  171  1e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  38.34 
 
 
257 aa  170  3e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  39.06 
 
 
288 aa  166  4e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  41.5 
 
 
260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  37.3 
 
 
258 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  37.3 
 
 
258 aa  163  3e-39  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  37.3 
 
 
258 aa  163  3e-39  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  38.52 
 
 
258 aa  161  8.000000000000001e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  43.72 
 
 
252 aa  161  9e-39  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  36.19 
 
 
255 aa  157  2e-37  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.19 
 
 
258 aa  156  3e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  35.71 
 
 
254 aa  155  6e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  39.15 
 
 
253 aa  155  6e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  36.5 
 
 
265 aa  155  8e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  36.72 
 
 
253 aa  152  4e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  36.97 
 
 
251 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  37.97 
 
 
267 aa  152  5.9999999999999996e-36  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
256 aa  152  5.9999999999999996e-36  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  39.22 
 
 
260 aa  151  8.999999999999999e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  39.6 
 
 
254 aa  151  1e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17940  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.48 
 
 
251 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1560  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.48 
 
 
251 aa  150  3e-35  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  34.13 
 
 
256 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  34.52 
 
 
257 aa  149  5e-35  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  36.36 
 
 
256 aa  148  7e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  36.51 
 
 
254 aa  148  8e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  36.69 
 
 
260 aa  148  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  39.92 
 
 
282 aa  148  1.0000000000000001e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  40 
 
 
261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  36.33 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.34 
 
 
269 aa  147  2.0000000000000003e-34  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  37.3 
 
 
267 aa  146  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2162  transcriptional regulator, DeoR family  34.47 
 
 
261 aa  146  4.0000000000000006e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  38.4 
 
 
253 aa  145  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  33.73 
 
 
254 aa  145  6e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  36.19 
 
 
253 aa  145  7.0000000000000006e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  35.46 
 
 
274 aa  145  8.000000000000001e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  32.68 
 
 
252 aa  145  9e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  37.89 
 
 
261 aa  144  1e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  37.02 
 
 
253 aa  144  2e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  35.71 
 
 
260 aa  144  2e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  35.8 
 
 
253 aa  144  2e-33  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  38.68 
 
 
267 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  35.57 
 
 
253 aa  143  4e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  36.51 
 
 
253 aa  142  4e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16690  transcriptional regulator, DeoR family  40.31 
 
 
261 aa  142  6e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  36.4 
 
 
261 aa  142  8e-33  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.51 
 
 
269 aa  141  9.999999999999999e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  36.22 
 
 
254 aa  140  9.999999999999999e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  37.8 
 
 
251 aa  140  9.999999999999999e-33  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45720  glycerol-3-phosphate regulon repressor protein GlpR  34.02 
 
 
251 aa  141  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  35.77 
 
 
261 aa  140  1.9999999999999998e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  38.22 
 
 
290 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
261 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  32.81 
 
 
261 aa  140  3e-32  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  35.54 
 
 
253 aa  140  3e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  34.63 
 
 
253 aa  140  3e-32  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.83 
 
 
269 aa  139  3.9999999999999997e-32  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  37.29 
 
 
289 aa  139  4.999999999999999e-32  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  32.83 
 
 
269 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  32.83 
 
 
269 aa  139  6e-32  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.83 
 
 
269 aa  139  6e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.83 
 
 
269 aa  139  6e-32  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.83 
 
 
269 aa  139  6e-32  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  32.83 
 
 
269 aa  139  6e-32  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.83 
 
 
269 aa  139  6e-32  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  33.73 
 
 
260 aa  139  6e-32  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.33 
 
 
251 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  31.9 
 
 
251 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
251 aa  138  7.999999999999999e-32  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  33.46 
 
 
278 aa  138  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  32.41 
 
 
261 aa  138  1e-31  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  38.59 
 
 
256 aa  137  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  37.7 
 
 
266 aa  137  2e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  33.47 
 
 
252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0940  putative DEOR-type transcriptional regulator  35.11 
 
 
275 aa  136  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000268196  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1103  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 
251 aa  136  4e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  36.36 
 
 
253 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1074  DeoR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
251 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  29.76 
 
 
257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01920  transcriptional regulator of sugar metabolism  35.34 
 
 
261 aa  135  6.0000000000000005e-31  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1115  DeoR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
286 aa  135  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.360982  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  32.67 
 
 
254 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  32.76 
 
 
252 aa  135  8e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  32.41 
 
 
257 aa  135  9e-31  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 
266 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4338  DeoR family transcriptional regulator  32.33 
 
 
251 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  36.36 
 
 
254 aa  134  9.999999999999999e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  33.73 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
257 aa  132  7.999999999999999e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  31.23 
 
 
266 aa  132  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.94 
 
 
278 aa  131  1.0000000000000001e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  33.06 
 
 
250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>