More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbro_2219 on replicon NC_013441
Organism: Gordonia bronchialis DSM 43247



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  100 
 
 
256 aa  500  1e-140  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  57.03 
 
 
259 aa  268  7e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
255 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
255 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  56.25 
 
 
255 aa  263  2e-69  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  53.91 
 
 
255 aa  248  9e-65  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  55.08 
 
 
255 aa  246  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  53.52 
 
 
259 aa  243  9.999999999999999e-64  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  53.91 
 
 
256 aa  241  1e-62  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  52.22 
 
 
269 aa  237  2e-61  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  49.81 
 
 
268 aa  221  8e-57  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  49.61 
 
 
253 aa  211  1e-53  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  48.83 
 
 
253 aa  204  8e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  45.45 
 
 
253 aa  204  2e-51  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  46.8 
 
 
253 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  46.46 
 
 
253 aa  199  3.9999999999999996e-50  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  50.39 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  46.85 
 
 
253 aa  197  1.0000000000000001e-49  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  46.46 
 
 
253 aa  196  2.0000000000000003e-49  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  45.31 
 
 
253 aa  194  1e-48  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  47.66 
 
 
253 aa  190  2e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  46.15 
 
 
253 aa  179  4.999999999999999e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  44.92 
 
 
253 aa  177  2e-43  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22300  transcriptional regulator of sugar metabolism  42.91 
 
 
253 aa  155  5.0000000000000005e-37  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  39.92 
 
 
267 aa  153  2e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  40.43 
 
 
260 aa  153  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  39.92 
 
 
254 aa  152  4e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
274 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  38.72 
 
 
250 aa  149  5e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  38.13 
 
 
264 aa  148  9e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.94 
 
 
257 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.94 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.94 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.94 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.94 
 
 
257 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  37.71 
 
 
256 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  35.94 
 
 
257 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  35.94 
 
 
257 aa  146  3e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.94 
 
 
257 aa  146  3e-34  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  35.94 
 
 
257 aa  146  3e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.94 
 
 
257 aa  146  3e-34  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  33.73 
 
 
254 aa  146  3e-34  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.94 
 
 
257 aa  146  3e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.94 
 
 
257 aa  146  3e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 
258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.94 
 
 
257 aa  145  6e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  41.7 
 
 
256 aa  144  1e-33  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  38.04 
 
 
257 aa  143  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  39.83 
 
 
253 aa  143  3e-33  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.98 
 
 
257 aa  142  4e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.55 
 
 
257 aa  142  5e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  34.4 
 
 
258 aa  141  8e-33  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 
266 aa  137  2e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  30.71 
 
 
248 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  34.5 
 
 
253 aa  136  4e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  30.71 
 
 
248 aa  135  4e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  37.65 
 
 
259 aa  135  6.0000000000000005e-31  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  37.98 
 
 
266 aa  135  8e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  35.43 
 
 
251 aa  133  1.9999999999999998e-30  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  41.84 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  35.59 
 
 
250 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  37.21 
 
 
258 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  31.51 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  39.36 
 
 
289 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  37.08 
 
 
233 aa  133  3e-30  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5588  DeoR family transcriptional regulator  39.74 
 
 
252 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  37.94 
 
 
253 aa  133  3e-30  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
252 aa  133  3e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  30.47 
 
 
255 aa  132  3.9999999999999996e-30  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
258 aa  133  3.9999999999999996e-30  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  36.19 
 
 
282 aa  132  3.9999999999999996e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  36.33 
 
 
261 aa  132  6e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  36.45 
 
 
251 aa  131  7.999999999999999e-30  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0889  DeoR family transcriptional regulator  36.72 
 
 
348 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  35.29 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  30.47 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  32.28 
 
 
248 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  32.34 
 
 
266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3222  DeoR family transcriptional regulator  38.49 
 
 
257 aa  129  4.0000000000000003e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  32.54 
 
 
256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3258  DeoR family transcriptional regulator  31.12 
 
 
251 aa  129  6e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000943791  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  34.73 
 
 
254 aa  128  8.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 
248 aa  128  9.000000000000001e-29  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5369  transcriptional regulator, DeoR family  38.34 
 
 
268 aa  127  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  36.21 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  36.21 
 
 
259 aa  127  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3530  transcriptional regulator, DeoR family  34.62 
 
 
263 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127721  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1728  lactose transport regulator  35.15 
 
 
252 aa  127  2.0000000000000002e-28  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  36.96 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  32.08 
 
 
251 aa  127  2.0000000000000002e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  31.91 
 
 
254 aa  126  3e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  32.81 
 
 
249 aa  126  3e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  34.65 
 
 
253 aa  127  3e-28  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1427  DeoR family transcriptional regulator  32.28 
 
 
253 aa  126  3e-28  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.847076  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.42 
 
 
257 aa  126  3e-28  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  36.36 
 
 
257 aa  126  4.0000000000000003e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
252 aa  125  5e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.46 
 
 
258 aa  125  5e-28  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  36.33 
 
 
251 aa  125  5e-28  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170195 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>