More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5369 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5369  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
268 aa  515  1.0000000000000001e-145  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  35.16 
 
 
274 aa  163  3e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  42.19 
 
 
255 aa  159  5e-38  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  35.83 
 
 
288 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  36.47 
 
 
267 aa  152  7e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  31.89 
 
 
257 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  37.11 
 
 
264 aa  151  1e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
258 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  38.15 
 
 
260 aa  149  6e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  40.49 
 
 
253 aa  145  5e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  33.9 
 
 
250 aa  143  3e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  37.75 
 
 
253 aa  143  3e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  32.14 
 
 
253 aa  142  7e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  37.25 
 
 
258 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  36.18 
 
 
253 aa  139  6e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  38.91 
 
 
248 aa  139  6e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  32.93 
 
 
255 aa  138  7e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  37.75 
 
 
253 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32 
 
 
269 aa  135  5e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2425  DeoR family transcriptional regulator  37.75 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2470  DeoR family transcriptional regulator  37.75 
 
 
258 aa  135  7.000000000000001e-31  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.445406  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  34.14 
 
 
256 aa  135  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  30.74 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  30.74 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.74 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  30.74 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.74 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.74 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.2 
 
 
269 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.78 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.74 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  36.6 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.74 
 
 
257 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.2 
 
 
269 aa  133  3e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  31.2 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  31.2 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  31.2 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  37.4 
 
 
252 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.2 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.2 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
259 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  38.34 
 
 
256 aa  132  3.9999999999999996e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.2 
 
 
269 aa  132  3.9999999999999996e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 
256 aa  132  6e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 
284 aa  132  6e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.74 
 
 
257 aa  132  6.999999999999999e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  38.34 
 
 
256 aa  132  6.999999999999999e-30  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  36.48 
 
 
257 aa  132  6.999999999999999e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  36.64 
 
 
260 aa  132  6.999999999999999e-30  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3644  transcriptional regulator, DeoR family  33.21 
 
 
263 aa  132  7.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  30.12 
 
 
254 aa  132  7.999999999999999e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  33.46 
 
 
254 aa  131  9e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.74 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  31.23 
 
 
266 aa  131  1.0000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.74 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.74 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  37.05 
 
 
253 aa  131  1.0000000000000001e-29  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.74 
 
 
257 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  30.35 
 
 
257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.87 
 
 
258 aa  130  2.0000000000000002e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  39.92 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  38.74 
 
 
254 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.4 
 
 
269 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  28.46 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  28.85 
 
 
254 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  29.96 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  29.96 
 
 
253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3530  transcriptional regulator, DeoR family  32.44 
 
 
263 aa  129  7.000000000000001e-29  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.127721  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  32.94 
 
 
267 aa  128  1.0000000000000001e-28  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  31.5 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  33.59 
 
 
257 aa  127  1.0000000000000001e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2464  DeoR family transcriptional regulator  37.39 
 
 
258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21816  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  33.59 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2599  DeoR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
259 aa  126  3e-28  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.509382  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  30.77 
 
 
255 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2727  DeoR family transcriptional regulator  35.74 
 
 
290 aa  126  4.0000000000000003e-28  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.463345  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  29.69 
 
 
253 aa  126  4.0000000000000003e-28  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  28.11 
 
 
252 aa  126  4.0000000000000003e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  36.02 
 
 
254 aa  126  4.0000000000000003e-28  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  38.96 
 
 
253 aa  125  5e-28  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  35.09 
 
 
264 aa  125  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.94 
 
 
259 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  30.65 
 
 
254 aa  125  7e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.94 
 
 
259 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.94 
 
 
259 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.94 
 
 
259 aa  125  7e-28  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.94 
 
 
259 aa  125  7e-28  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.94 
 
 
278 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.94 
 
 
278 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2703  DeoR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
259 aa  125  8.000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.316152  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6002  DeoR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
259 aa  124  1e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.5658 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  36.14 
 
 
253 aa  125  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
269 aa  124  1e-27  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2674  DeoR family transcriptional regulator  34.94 
 
 
294 aa  124  1e-27  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  36.47 
 
 
254 aa  124  1e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  31.33 
 
 
257 aa  124  2e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2063  DeoR family transcriptional regulator  34.54 
 
 
294 aa  124  2e-27  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.253538  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  29.48 
 
 
254 aa  124  2e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  38.33 
 
 
242 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  38.67 
 
 
255 aa  123  3e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>