More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aaci_2323 on replicon NC_013205
Organism: Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
266 aa  542  1e-153  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  42.69 
 
 
266 aa  196  4.0000000000000005e-49  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  42.01 
 
 
282 aa  191  1e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  43.8 
 
 
290 aa  181  9.000000000000001e-45  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  42.47 
 
 
266 aa  181  1e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2107  transcriptional regulator, DeoR family  39.31 
 
 
263 aa  167  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  40.47 
 
 
289 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
267 aa  162  4.0000000000000004e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  35.5 
 
 
253 aa  162  4.0000000000000004e-39  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2488  transcriptional regulator, DeoR family  45.29 
 
 
265 aa  162  8.000000000000001e-39  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  39.45 
 
 
257 aa  161  1e-38  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  36.61 
 
 
254 aa  160  2e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0895  transcriptional regulator, DeoR family  38.85 
 
 
260 aa  160  2e-38  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0542275 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3971  transcriptional regulator, DeoR family  44.06 
 
 
262 aa  160  3e-38  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.229273  normal  0.573727 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  40.23 
 
 
267 aa  159  5e-38  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3172  transcriptional regulator, DeoR family  39.34 
 
 
267 aa  158  7e-38  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.465579 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3382  DeoR family transcriptional regulator  37.76 
 
 
263 aa  157  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  36 
 
 
256 aa  157  1e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.65 
 
 
258 aa  155  5.0000000000000005e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  36.64 
 
 
274 aa  155  9e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  36.75 
 
 
250 aa  154  1e-36  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  39.34 
 
 
269 aa  154  1e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0995  transcriptional regulator, DeoR family  40.75 
 
 
264 aa  154  2e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.103879  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  40.77 
 
 
267 aa  152  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  38.58 
 
 
254 aa  150  2e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2701  transcriptional regulator  36.09 
 
 
270 aa  150  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  38.16 
 
 
254 aa  150  2e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  37.02 
 
 
258 aa  149  3e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
255 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
255 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  39.22 
 
 
255 aa  149  5e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  37.25 
 
 
254 aa  149  7e-35  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1439  transcriptional regulator, DeoR family  33.77 
 
 
275 aa  149  7e-35  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0159016  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  37.5 
 
 
251 aa  148  8e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2958  transcriptional regulator, DeoR family  44.87 
 
 
262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00162277  decreased coverage  0.000126005 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  40.34 
 
 
264 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  37.66 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  34.5 
 
 
257 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  37.98 
 
 
260 aa  146  3e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  40.78 
 
 
256 aa  144  1e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  34.48 
 
 
256 aa  145  1e-33  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  39.32 
 
 
255 aa  144  1e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  37.65 
 
 
259 aa  144  1e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  34.11 
 
 
254 aa  144  2e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
258 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  38.96 
 
 
253 aa  143  3e-33  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
255 aa  142  4e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  38.06 
 
 
268 aa  143  4e-33  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  36.76 
 
 
255 aa  142  4e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
255 aa  142  5e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 
255 aa  142  5e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0977  DeoR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
255 aa  142  5e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.96922  normal  0.682272 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  37.5 
 
 
256 aa  142  5e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.59 
 
 
257 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  37.65 
 
 
253 aa  141  9e-33  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02585  predicted DNA-binding transcriptional regulator  36.36 
 
 
265 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  36.36 
 
 
255 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02550  hypothetical protein  36.36 
 
 
265 aa  140  9.999999999999999e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  37.55 
 
 
262 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  36.55 
 
 
252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  36.51 
 
 
248 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  38.43 
 
 
259 aa  140  3e-32  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  36.63 
 
 
256 aa  139  3.9999999999999997e-32  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  35.6 
 
 
253 aa  139  4.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3731  regulatory protein, DeoR  33.19 
 
 
254 aa  139  6e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  37.13 
 
 
250 aa  139  6e-32  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.6 
 
 
252 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.6 
 
 
252 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.6 
 
 
252 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.6 
 
 
252 aa  138  8.999999999999999e-32  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.41 
 
 
257 aa  137  1e-31  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  35.86 
 
 
254 aa  138  1e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  37.5 
 
 
253 aa  137  2e-31  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.2 
 
 
252 aa  137  2e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 
266 aa  136  4e-31  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 
252 aa  135  8e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.91 
 
 
257 aa  135  8e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.91 
 
 
257 aa  135  8e-31  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  31.91 
 
 
257 aa  135  9e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  31.91 
 
 
257 aa  135  9e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  31.91 
 
 
257 aa  135  9e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.91 
 
 
257 aa  135  9e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.91 
 
 
257 aa  135  9e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03274  DNA-binding transcriptional repressor  31.6 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.324101  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03226  hypothetical protein  31.6 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.347967  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3620  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.6 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32750  transcriptional regulator, DeoR family  37.13 
 
 
261 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.19583  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0291  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.6 
 
 
252 aa  134  9.999999999999999e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3530  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 
257 aa  134  9.999999999999999e-31  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  32.94 
 
 
278 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  37.93 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  32.89 
 
 
254 aa  134  1.9999999999999998e-30  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3702  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.6 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.141419 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  31.91 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  30.86 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3898  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.6 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3326  transcriptional regulator, DeoR family  33.59 
 
 
257 aa  133  1.9999999999999998e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.0000140435  normal  0.233005 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  36.21 
 
 
253 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3804  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  31.6 
 
 
252 aa  134  1.9999999999999998e-30  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>