More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2190 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 253 aa  506  9.999999999999999e-143  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  77.6 
 
 		 251 aa  354  7.999999999999999e-97  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  67.6 
 
 		 251 aa  318  3.9999999999999996e-86  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  64.8 
 
 		 251 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  64.8 
 
 		 251 aa  318  7.999999999999999e-86  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  64.4 
 
 		 251 aa  317  1e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  64.8 
 
 		 251 aa  317  1e-85  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  64.4 
 
 		 251 aa  316  2e-85  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  59.6 
 
 		 251 aa  306  2.0000000000000002e-82  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  60.8 
 
 		 267 aa  306  3e-82  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  60.8 
 
 		 251 aa  302  4.0000000000000003e-81  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  55.2 
 
 		 254 aa  264  8.999999999999999e-70  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  50.85 
 
 		 251 aa  228  5e-59  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  52.4 
 
 		 251 aa  223  2e-57  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  47.2 
 
 		 252 aa  223  2e-57  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  46.99 
 
 		 252 aa  221  9e-57  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  46.8 
 
 		 251 aa  210  2e-53  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  46.18 
 
 		 250 aa  206  3e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  41.94 
 
 		 261 aa  181  7e-45  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  39.2 
 
 		 249 aa  181  9.000000000000001e-45  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 254 aa  174  9.999999999999999e-43  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  36.55 
 
 		 248 aa  173  2.9999999999999996e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  36.95 
 
 		 248 aa  162  4.0000000000000004e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  38.31 
 
 		 261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  38.55 
 
 		 258 aa  161  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  35.08 
 
 		 261 aa  158  8e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1182  DeoR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 286 aa  158  1e-37  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.330735  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  37.8 
 
 		 253 aa  157  2e-37  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  37.55 
 
 		 259 aa  155  4e-37  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  36.6 
 
 		 247 aa  152  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  36.96 
 
 		 248 aa  152  7e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  34.55 
 
 		 249 aa  151  1e-35  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  36.48 
 
 		 248 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  38.78 
 
 		 253 aa  149  4e-35  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  35.78 
 
 		 248 aa  149  4e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 256 aa  149  4e-35  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  36.55 
 
 		 265 aa  149  5e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1069  DeoR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0227  DeoR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 315 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0585887  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0358  DeoR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 260 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1646  DeoR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.288824  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1228  DeoR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 274 aa  147  1.0000000000000001e-34  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0813024  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  36.11 
 
 		 253 aa  147  2.0000000000000003e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  34.02 
 
 		 259 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0061  DeoR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 376 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5895  DeoR family transcriptional regulator  34.84 
 
 		 260 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1734  transcriptional regulators of sugar metabolism  37.12 
 
 		 260 aa  146  4.0000000000000006e-34  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  32.53 
 
 		 270 aa  145  4.0000000000000006e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  34.39 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  33.47 
 
 		 253 aa  144  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  37.2 
 
 		 258 aa  143  2e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  32.8 
 
 		 253 aa  142  4e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  37.28 
 
 		 270 aa  142  6e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  33.07 
 
 		 257 aa  141  8e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 260 aa  141  8e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  34.05 
 
 		 249 aa  141  9.999999999999999e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 257 aa  141  9.999999999999999e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  34.13 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 255 aa  139  3.9999999999999997e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  37.92 
 
 		 258 aa  139  4.999999999999999e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  34.7 
 
 		 249 aa  137  1e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  35.32 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  29.39 
 
 		 257 aa  137  2e-31  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 231 aa  136  3.0000000000000003e-31  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  32.94 
 
 		 253 aa  135  4e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 260 aa  136  4e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  34.94 
 
 		 260 aa  135  5e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  32.9 
 
 		 249 aa  135  8e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  31.69 
 
 		 247 aa  135  9e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  32.94 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  33.98 
 
 		 284 aa  133  3e-30  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  34.65 
 
 		 254 aa  132  3.9999999999999996e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 253 aa  132  6e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  34.08 
 
 		 268 aa  130  2.0000000000000002e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 288 aa  129  3e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 255 aa  129  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  29.29 
 
 		 258 aa  129  5.0000000000000004e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 253 aa  127  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  33.86 
 
 		 255 aa  127  2.0000000000000002e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  36.91 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  34.65 
 
 		 256 aa  127  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3687  regulatory protein, DeoR  35.6 
 
 		 259 aa  126  3e-28  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.300297  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  30.52 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  32.68 
 
 		 255 aa  125  7e-28  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  33.86 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 267 aa  123  3e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  38.72 
 
 		 282 aa  122  4e-27  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  32.66 
 
 		 277 aa  122  5e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  36.67 
 
 		 266 aa  122  6e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  35.06 
 
 		 248 aa  121  9e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  29.02 
 
 		 274 aa  121  9e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5960  DeoR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 268 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  31.47 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  33.86 
 
 		 264 aa  120  1.9999999999999998e-26  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0130  regulatory protein, DeoR  32.23 
 
 		 281 aa  120  1.9999999999999998e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.565465  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  32.33 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>