More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene LACR_1031 on replicon NC_008527
Organism: Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  100 
 
 		 233 aa  470  1e-132  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  47.64 
 
 		 250 aa  197  1.0000000000000001e-49  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0444  transcriptional repressor  47.62 
 
 		 248 aa  193  2e-48  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000146734  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  45.26 
 
 		 250 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  44.78 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  42.61 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  41.13 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  41.56 
 
 		 250 aa  176  2e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 249 aa  176  3e-43  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 250 aa  175  4e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 250 aa  175  4e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  42.17 
 
 		 248 aa  176  4e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  41.13 
 
 		 250 aa  175  4e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 250 aa  175  5e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  40.69 
 
 		 250 aa  175  6e-43  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  41.13 
 
 		 250 aa  174  8e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  40.69 
 
 		 250 aa  174  9.999999999999999e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 		 252 aa  168  5e-41  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  39.47 
 
 		 260 aa  154  2e-36  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3760  transcriptional regulator, DeoR family  37.93 
 
 		 245 aa  151  7e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0851  fructose operon transcriptional regulator  38.63 
 
 		 232 aa  150  2e-35  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.151566  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1728  lactose transport regulator  40.95 
 
 		 252 aa  149  3e-35  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  39.52 
 
 		 253 aa  148  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  39.52 
 
 		 253 aa  148  6e-35  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 255 aa  147  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  38.46 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  39.13 
 
 		 250 aa  144  1e-33  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  36.96 
 
 		 247 aa  143  2e-33  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  36.29 
 
 		 255 aa  142  4e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  37.93 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  37.18 
 
 		 253 aa  140  9.999999999999999e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 259 aa  140  1.9999999999999998e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0108  transcriptional regulator, DeoR family  39.22 
 
 		 236 aa  139  3e-32  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl179  fru repressor  39.83 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5588  DeoR family transcriptional regulator  35.65 
 
 		 252 aa  136  3.0000000000000003e-31  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  36.24 
 
 		 264 aa  135  4e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  36.96 
 
 		 253 aa  135  6.0000000000000005e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  36.24 
 
 		 267 aa  133  1.9999999999999998e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 259 aa  133  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  37.08 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  34.19 
 
 		 252 aa  132  3.9999999999999996e-30  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  34.89 
 
 		 255 aa  132  5e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  35.74 
 
 		 269 aa  131  7.999999999999999e-30  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0381  transcriptional regulator, DeoR family  36.64 
 
 		 229 aa  131  7.999999999999999e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.000667936  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  39.13 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  34.62 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  34.75 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  35.37 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  34.48 
 
 		 253 aa  129  3e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  36.6 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  32.48 
 
 		 253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0277  transcriptional regulator, DeoR family  36.21 
 
 		 245 aa  127  1.0000000000000001e-28  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  36.52 
 
 		 253 aa  126  3e-28  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  35.59 
 
 		 274 aa  126  4.0000000000000003e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 		 253 aa  125  5e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  32.75 
 
 		 257 aa  125  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1796  lactose phosphotransferase system repressor  38.05 
 
 		 251 aa  124  9e-28  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  34.4 
 
 		 251 aa  124  9e-28  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  33.76 
 
 		 254 aa  124  2e-27  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 252 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D07  lactose transport regulator  37.13 
 
 		 255 aa  123  3e-27  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  35.15 
 
 		 256 aa  123  3e-27  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  36.44 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0491  lactose transport regulator  36.17 
 
 		 254 aa  121  9.999999999999999e-27  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0073  transcriptional regulator, DeoR family  36.02 
 
 		 249 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0617  DeoR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 244 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0340612  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  34.93 
 
 		 257 aa  120  1.9999999999999998e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1542  transcriptional regulator, DeoR family  34.87 
 
 		 256 aa  119  3e-26  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.420943  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  33.06 
 
 		 268 aa  119  3e-26  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3028  transcriptional regulator, DeoR family  33.75 
 
 		 252 aa  120  3e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0708  DeoR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3260  transcriptional regulator, DeoR family  32.89 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0117274  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0183  DeoR-family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 255 aa  118  6e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.341023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  33.65 
 
 		 248 aa  118  7e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  34.62 
 
 		 253 aa  118  7.999999999999999e-26  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  32.31 
 
 		 252 aa  118  7.999999999999999e-26  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0180  DeoR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.214924  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0179  DeoR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3701  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 		 269 aa  118  9.999999999999999e-26  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.898271  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  34.38 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0718  DeoR family transcriptional regulator  32.33 
 
 		 254 aa  117  9.999999999999999e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000222584  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0196  DeoR-family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.841984  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0188  DeoR family transcriptional regulator  34.32 
 
 		 255 aa  117  9.999999999999999e-26  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.333156  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0739  transcriptional regulator, DeoR family  34 
 
 		 250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0650  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 		 276 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3534  transcriptional regulator, DeoR family  33.48 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2920  transcriptional regulator, DeoR family  34.45 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5367  transcriptional regulator, DeoR family  32.75 
 
 		 264 aa  116  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.35499 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 		 256 aa  116  3e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2266  lactose phosphotransferase system repressor  35.94 
 
 		 263 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2227  DeoR family transcriptional regulator  35.94 
 
 		 263 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1101  transcriptional regulator, DeoR family  33.64 
 
 		 257 aa  115  6e-25  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  30.87 
 
 		 251 aa  115  6.9999999999999995e-25  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  34.32 
 
 		 256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  34.04 
 
 		 258 aa  114  2.0000000000000002e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03314  transcriptional regulator  29.69 
 
 		 263 aa  114  2.0000000000000002e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>