More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5588 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_5588  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 252 aa  494  1e-139  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  93.63 
 
 		 252 aa  466  9.999999999999999e-131  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  55.56 
 
 		 253 aa  268  5e-71  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  47.98 
 
 		 253 aa  202  6e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  46.43 
 
 		 253 aa  192  5e-48  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  45.63 
 
 		 253 aa  192  6e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 253 aa  189  5e-47  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  45.93 
 
 		 253 aa  186  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  44.84 
 
 		 253 aa  185  6e-46  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  45.75 
 
 		 253 aa  179  2.9999999999999997e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  42.91 
 
 		 253 aa  172  5e-42  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  45.02 
 
 		 253 aa  171  7.999999999999999e-42  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  43.65 
 
 		 253 aa  171  1e-41  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  41.13 
 
 		 253 aa  166  2e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  43.78 
 
 		 255 aa  157  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  41.32 
 
 		 259 aa  150  2e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  43.9 
 
 		 253 aa  149  5e-35  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  40.56 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  42 
 
 		 259 aa  148  9e-35  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 274 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  37.86 
 
 		 260 aa  143  3e-33  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  32 
 
 		 256 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  34.71 
 
 		 250 aa  136  3.0000000000000003e-31  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  35.65 
 
 		 233 aa  136  3.0000000000000003e-31  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  37.35 
 
 		 258 aa  133  3e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  32.4 
 
 		 250 aa  133  3e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  39.74 
 
 		 256 aa  133  3e-30  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  36.15 
 
 		 268 aa  131  1.0000000000000001e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1510  transcriptional regulator, DeoR family  32.92 
 
 		 250 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000196548  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  32.37 
 
 		 250 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  32.37 
 
 		 250 aa  128  8.000000000000001e-29  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 250 aa  128  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  34.98 
 
 		 269 aa  127  1.0000000000000001e-28  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  32.37 
 
 		 250 aa  127  1.0000000000000001e-28  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  31.58 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  32.78 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 250 aa  125  4.0000000000000003e-28  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  33.61 
 
 		 249 aa  125  6e-28  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 250 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 250 aa  125  9e-28  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0722  DeoR family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0738  regulatory protein DeoR  30.99 
 
 		 253 aa  124  1e-27  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  32.37 
 
 		 250 aa  124  2e-27  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  36.82 
 
 		 257 aa  122  5e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 288 aa  122  8e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 251 aa  121  8e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3115  DeoR family transcriptional regulator  32.08 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.189997  hitchhiker  0.000781627 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  36.02 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  35 
 
 		 256 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  39.39 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3388  transcriptional regulator, DeoR family  29.15 
 
 		 248 aa  118  9e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000207946  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0039  transcriptional regulator, DeoR family  28.74 
 
 		 247 aa  118  9.999999999999999e-26  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000112771  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  38.22 
 
 		 254 aa  118  9.999999999999999e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  40.34 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.35 
 
 		 257 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  29.34 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  35.66 
 
 		 253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  33.9 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  33.9 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  33.9 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  33.9 
 
 		 257 aa  116  3e-25  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  33.9 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  33.9 
 
 		 259 aa  116  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.61 
 
 		 258 aa  115  6.9999999999999995e-25  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22300  transcriptional regulator of sugar metabolism  40.51 
 
 		 253 aa  115  6.9999999999999995e-25  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0552  transcription repressor of fructose operon fruR  30.9 
 
 		 248 aa  114  1.0000000000000001e-24  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0357  DeoR family transcriptional regulator  31.33 
 
 		 252 aa  114  2.0000000000000002e-24  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.912716  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  30.47 
 
 		 248 aa  113  3e-24  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2567  DeoR family transcriptional regulator  28.85 
 
 		 256 aa  113  3e-24  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0643687  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  31.3 
 
 		 267 aa  112  7.000000000000001e-24  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1144  DeoR family transcriptional regulator  37.12 
 
 		 277 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.524884  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0073  transcriptional regulator, DeoR family  28 
 
 		 249 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  33.61 
 
 		 267 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2534  DeoR family transcriptional regulator  29.25 
 
 		 256 aa  110  2.0000000000000002e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.0000015777  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 266 aa  109  3e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  31.42 
 
 		 256 aa  110  3e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  32.63 
 
 		 264 aa  109  4.0000000000000004e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0922  DeoR family transcriptional regulator  28.99 
 
 		 251 aa  109  4.0000000000000004e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.519346  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  36.4 
 
 		 290 aa  108  6e-23  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  31.64 
 
 		 256 aa  108  6e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3760  transcriptional regulator, DeoR family  30.14 
 
 		 245 aa  108  9.000000000000001e-23  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  32.08 
 
 		 258 aa  108  1e-22  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0590  transcriptional regulator, DeoR family  29.87 
 
 		 247 aa  108  1e-22  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 265 aa  107  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  28.34 
 
 		 258 aa  107  2e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  31.47 
 
 		 260 aa  107  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2772  transcriptional regulator, DeoR family  27.8 
 
 		 256 aa  107  2e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0124303 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 242 aa  106  3e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  36.17 
 
 		 266 aa  107  3e-22  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 260 aa  106  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2798  DeoR family transcriptional regulator  28.91 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0120141  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2578  DeoR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.00000422866  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2765  DeoR family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 256 aa  106  4e-22  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.595912  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2819  transcriptional regulator, DeoR family  28.19 
 
 		 256 aa  105  5e-22  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0209675  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  30.58 
 
 		 256 aa  105  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2517  transcriptional regulator, DeoR family  28.06 
 
 		 261 aa  105  6e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.0400027 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>