More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sare_4851 on replicon NC_009953
Organism: Salinispora arenicola CNS-205



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009953  Sare_4851  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 253 aa  495  1e-139  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00849976 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  70.75 
 
 		 253 aa  365  1e-100  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2141  transcriptional regulator, DeoR family  71.15 
 
 		 253 aa  343  1e-93  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.386533  normal  0.871763 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  69.17 
 
 		 253 aa  338  5.9999999999999996e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  68.4 
 
 		 253 aa  335  2.9999999999999997e-91  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  66.27 
 
 		 253 aa  330  9e-90  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  59.29 
 
 		 253 aa  278  6e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  56.13 
 
 		 253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  59.74 
 
 		 253 aa  272  4.0000000000000004e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  56.13 
 
 		 253 aa  268  7e-71  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  56.92 
 
 		 253 aa  266  2e-70  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  58.1 
 
 		 253 aa  249  2e-65  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 255 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 255 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  50.98 
 
 		 255 aa  232  5e-60  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  50.2 
 
 		 255 aa  225  5.0000000000000005e-58  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  50.19 
 
 		 255 aa  221  8e-57  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  47.06 
 
 		 259 aa  219  3e-56  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5310  transcriptional regulator, DeoR family  46.25 
 
 		 253 aa  219  3.9999999999999997e-56  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  48.24 
 
 		 259 aa  213  1.9999999999999998e-54  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1220  DeoR family transcriptional regulator  46.25 
 
 		 252 aa  203  3e-51  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5588  DeoR family transcriptional regulator  48.51 
 
 		 252 aa  202  5e-51  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.677206  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  44.92 
 
 		 256 aa  193  2e-48  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0527  transcriptional regulator, DeoR family  43.28 
 
 		 268 aa  181  8.000000000000001e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0301  DeoR family transcriptional regulator  43.07 
 
 		 269 aa  181  9.000000000000001e-45  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.596764  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  37.85 
 
 		 274 aa  174  9.999999999999999e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  45.73 
 
 		 256 aa  174  1.9999999999999998e-42  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  38.65 
 
 		 250 aa  174  1.9999999999999998e-42  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  43.04 
 
 		 260 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  34.4 
 
 		 253 aa  167  2e-40  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 256 aa  162  6e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  39.61 
 
 		 258 aa  158  8e-38  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  38.5 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 260 aa  153  2e-36  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3705  transcriptional regulator, DeoR family  28.46 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  39 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_22300  transcriptional regulator of sugar metabolism  41.96 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  35.43 
 
 		 257 aa  148  7e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  36.86 
 
 		 254 aa  147  1.0000000000000001e-34  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 		 267 aa  148  1.0000000000000001e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  41.3 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  37.05 
 
 		 264 aa  146  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  37.08 
 
 		 254 aa  145  9e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 258 aa  144  1e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  38.03 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  37.34 
 
 		 255 aa  143  3e-33  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 267 aa  142  7e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 267 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  37.55 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  34.52 
 
 		 253 aa  139  3.9999999999999997e-32  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  39.66 
 
 		 254 aa  139  4.999999999999999e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2043  transcriptional regulator, DeoR family  38.4 
 
 		 267 aa  138  7.999999999999999e-32  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000137049  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1031  lactose transport regulator  36.6 
 
 		 233 aa  138  7.999999999999999e-32  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.227139  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 264 aa  138  1e-31  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  39.83 
 
 		 282 aa  137  2e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 251 aa  137  2e-31  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0299  DeoR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 253 aa  137  2e-31  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.179752  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  35.8 
 
 		 251 aa  135  4e-31  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  39.75 
 
 		 266 aa  135  9e-31  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  29.67 
 
 		 254 aa  134  9.999999999999999e-31  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 288 aa  134  9.999999999999999e-31  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  36.19 
 
 		 251 aa  134  9.999999999999999e-31  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  35.04 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  33.07 
 
 		 254 aa  133  3e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  35.41 
 
 		 251 aa  132  3.9999999999999996e-30  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0603  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.26 
 
 		 278 aa  132  5e-30  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0386  glycerol-3-phosphate repressor protein  35.06 
 
 		 255 aa  132  6e-30  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  34.47 
 
 		 254 aa  132  6e-30  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0377  DeoR family transcriptional regulator  33.77 
 
 		 261 aa  130  1.0000000000000001e-29  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  38.34 
 
 		 252 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3906  regulatory protein, DeoR  34.76 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.543533  normal  0.872643 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0910  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.86 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4533  DeoR family transcriptional regulator  35.09 
 
 		 251 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.350133  normal  0.264738 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  30.77 
 
 		 254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  36.71 
 
 		 250 aa  130  2.0000000000000002e-29  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2702  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.86 
 
 		 278 aa  130  2.0000000000000002e-29  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  36.8 
 
 		 261 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4169  glycerol-3-phosphate regulon repressor  34.76 
 
 		 251 aa  130  3e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0244  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.86 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  32.8 
 
 		 266 aa  129  3e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2375  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.86 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0729  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.86 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0743  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.86 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2456  glycerol-3-phosphate regulon repressor  33.86 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0561581  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  35.46 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  39.84 
 
 		 266 aa  129  4.0000000000000003e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  35.27 
 
 		 264 aa  129  4.0000000000000003e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0423  DeoR family transcriptional regulator  33.47 
 
 		 259 aa  129  5.0000000000000004e-29  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.909669  normal  0.586164 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2619  DeoR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 256 aa  129  5.0000000000000004e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.694868 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  33.99 
 
 		 253 aa  129  5.0000000000000004e-29  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.39 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  35.39 
 
 		 259 aa  129  6e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  37.45 
 
 		 252 aa  128  7.000000000000001e-29  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2071  DeoR family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 254 aa  128  7.000000000000001e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.128442  normal  0.332572 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  35.89 
 
 		 258 aa  129  7.000000000000001e-29  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  35.69 
 
 		 258 aa  128  7.000000000000001e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  32.52 
 
 		 260 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1644  DeoR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 251 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000364234 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 254 aa  128  9.000000000000001e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>