More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_3861 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013061  Phep_3861  regulatory protein DeoR  100 
 
 		 249 aa  504  9.999999999999999e-143  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4658  transcriptional regulator, DeoR family  56.45 
 
 		 261 aa  294  9e-79  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0287988  normal  0.686311 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4860  DeoR family transcriptional regulator  51.41 
 
 		 270 aa  264  1e-69  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  44.58 
 
 		 248 aa  211  5.999999999999999e-54  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5351  transcriptional regulator, DeoR family  42.34 
 
 		 249 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.382698  normal  0.4107 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6809  transcriptional regulator, DeoR family  42.23 
 
 		 248 aa  177  1e-43  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.117739  hitchhiker  0.00016369 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2096  regulatory protein DeoR  41.08 
 
 		 249 aa  172  2.9999999999999996e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.02145 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  38.14 
 
 		 261 aa  172  3.9999999999999995e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  36.73 
 
 		 254 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  38.4 
 
 		 252 aa  171  1e-41  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3407  regulatory protein DeoR  41.49 
 
 		 249 aa  168  7e-41  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.161836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4813  DeoR family transcriptional regulator  37.45 
 
 		 231 aa  168  7e-41  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  37.76 
 
 		 247 aa  158  8e-38  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4132  regulatory protein DeoR  38.55 
 
 		 248 aa  157  1e-37  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.391954  normal  0.380185 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  34.14 
 
 		 251 aa  157  1e-37  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2404  transcriptional regulator, DeoR family  39.21 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4127  regulatory protein DeoR  38.55 
 
 		 248 aa  154  1e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.260029  normal  0.917732 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  34.91 
 
 		 254 aa  153  2e-36  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0012  transcriptional regulator, DeoR family  37.83 
 
 		 249 aa  152  4e-36  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000515995  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0841  transcriptional regulator, DeoR family  35.74 
 
 		 249 aa  152  5e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3432  transcriptional regulator, DeoR family  34.68 
 
 		 249 aa  152  5.9999999999999996e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4140  regulatory protein DeoR  38.31 
 
 		 248 aa  150  1e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.238976  normal  0.377533 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0678  regulatory protein DeoR  37.04 
 
 		 247 aa  150  2e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.275525  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 251 aa  150  2e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 251 aa  148  6e-35  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 251 aa  148  7e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 251 aa  148  9e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 255 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 251 aa  146  2.0000000000000003e-34  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0910  transcriptional regulator, DeoR family  36.14 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.965103 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2141  DeoR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 261 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  35.34 
 
 		 253 aa  143  2e-33  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  34.96 
 
 		 259 aa  143  2e-33  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 267 aa  143  3e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3833  transcriptional regulator, DeoR family  33.88 
 
 		 258 aa  142  6e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  34.05 
 
 		 253 aa  141  9.999999999999999e-33  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 251 aa  141  9.999999999999999e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01190  transcriptional regulator, DeoR family  31.6 
 
 		 252 aa  139  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  32.62 
 
 		 253 aa  137  1e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  31.23 
 
 		 259 aa  138  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  136  3.0000000000000003e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2919  DeoR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 257 aa  135  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.357868  normal  0.238188 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1790  transcriptional regulator, DeoR family  34.02 
 
 		 259 aa  134  9.999999999999999e-31  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.676123  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  31.25 
 
 		 259 aa  133  3e-30  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  32.77 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  33.04 
 
 		 251 aa  132  5e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2290  transcriptional regulator, DeoR family  34.2 
 
 		 251 aa  132  6.999999999999999e-30  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0890971  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  34.91 
 
 		 250 aa  131  1.0000000000000001e-29  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0673  DeoR family transcriptional regulator  32.23 
 
 		 258 aa  129  6e-29  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  30.68 
 
 		 253 aa  128  7.000000000000001e-29  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0901  transcriptional regulator, DeoR family  33.48 
 
 		 251 aa  128  8.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.780867  normal  0.622504 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 253 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3135  DeoR family transcriptional regulator  32.24 
 
 		 265 aa  127  2.0000000000000002e-28  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4161  transcriptional regulator, DeoR family  32.24 
 
 		 253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2702  transcriptional regulator, DeoR family  31.73 
 
 		 250 aa  127  2.0000000000000002e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  32.81 
 
 		 256 aa  126  3e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  32.13 
 
 		 257 aa  126  3e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1164  transcriptional regulator DeoR family  31.05 
 
 		 251 aa  125  6e-28  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  unclonable  0.000280656  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0997  DeoR family transcriptional regulator  30.54 
 
 		 270 aa  124  1e-27  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  33.8 
 
 		 251 aa  122  4e-27  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 252 aa  122  5e-27  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3182  DeoR family transcriptional regulator  29.64 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.457235  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3442  transcriptional regulator, DeoR family  32.52 
 
 		 249 aa  122  6e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.000000177835  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3792  DeoR family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 260 aa  122  6e-27  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.643818 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  30.95 
 
 		 252 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  33.99 
 
 		 258 aa  121  9.999999999999999e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0344  transcriptional regulator, DeoR family  29.03 
 
 		 252 aa  121  9.999999999999999e-27  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.273291  hitchhiker  0.00282371 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  32.07 
 
 		 257 aa  120  9.999999999999999e-27  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.65 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  31.65 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  31.65 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  31.65 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  33.19 
 
 		 254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  30.9 
 
 		 278 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3064  DeoR family transcriptional regulator  29.63 
 
 		 260 aa  120  1.9999999999999998e-26  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  decreased coverage  0.00624963  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  29.37 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  31.22 
 
 		 252 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  32.64 
 
 		 254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  30.43 
 
 		 255 aa  119  6e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  31.15 
 
 		 257 aa  119  6e-26  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  30.56 
 
 		 254 aa  118  7.999999999999999e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0011  sugar metabolism transcriptional regulator  30.17 
 
 		 252 aa  118  9e-26  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  30.9 
 
 		 252 aa  118  9.999999999999999e-26  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  31.98 
 
 		 267 aa  117  9.999999999999999e-26  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0512  transcriptional regulator, DeoR family  31.93 
 
 		 256 aa  117  9.999999999999999e-26  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.826881  normal  0.165905 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  30.45 
 
 		 258 aa  118  9.999999999999999e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  31.89 
 
 		 257 aa  117  9.999999999999999e-26  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4204  DeoR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 256 aa  117  1.9999999999999998e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1493  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 254 aa  117  1.9999999999999998e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 254 aa  116  3e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  30.9 
 
 		 253 aa  116  3e-25  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  31.03 
 
 		 255 aa  115  5e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  31.74 
 
 		 254 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  29.61 
 
 		 253 aa  113  3e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1120  DeoR family transcriptional regulator  29.67 
 
 		 266 aa  112  4.0000000000000004e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>