More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Spro_2691 on replicon NC_009832
Organism: Serratia proteamaculans 568



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 254 aa  514  1.0000000000000001e-145  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2220  DeoR family transcriptional regulator  37.4 
 
 		 277 aa  152  5.9999999999999996e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0244246 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1681  DeoR family transcriptional regulator  39.06 
 
 		 309 aa  151  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.109023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  35.46 
 
 		 253 aa  150  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  42.04 
 
 		 258 aa  146  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0268  DeoR family transcriptional regulator  33.88 
 
 		 263 aa  146  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4218  DeoR family transcriptional regulator  36.03 
 
 		 284 aa  144  1e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.271905 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4606  DeoR family regulatory protein  38.7 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.337997  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3673  DeoR family transcriptional regulator  35.58 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.373167 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4407  DeoR family regulatory protein  38.7 
 
 		 252 aa  143  2e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.144995 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4660  DeoR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 260 aa  144  2e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4532  DeoR family regulatory protein  38.7 
 
 		 252 aa  142  4e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.194057  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0903  DeoR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 251 aa  142  6e-33  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.910889 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4043  DeoR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_5984  transcriptional regulator, DeoR family  33.74 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0462  DeoR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0801  DeoR family transcriptional regulator  35.78 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0941  DeoR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 251 aa  140  1.9999999999999998e-32  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011371  Rleg2_6471  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 257 aa  140  3e-32  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.845321  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4951  transcriptional regulator, DeoR family  34.22 
 
 		 251 aa  139  6e-32  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.43451  normal  0.034179 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  34.06 
 
 		 253 aa  138  7e-32  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4070  DeoR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 266 aa  138  1e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1449  DeoR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0098  DeoR family transcriptional regulator  35.83 
 
 		 256 aa  137  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.267831  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  37.55 
 
 		 274 aa  137  2e-31  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4896  transcriptional regulator, DeoR family  35.51 
 
 		 265 aa  137  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.302168  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3729  transcriptional regulator, DeoR family  36.4 
 
 		 267 aa  136  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.923555  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0631  glycerol-3-phosphate regulon repressor  35.27 
 
 		 257 aa  136  3.0000000000000003e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.405946  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0609  DeoR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 252 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000143813 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  37.72 
 
 		 253 aa  135  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1360  DeoR family transcriptional regulator  35.51 
 
 		 274 aa  135  7.000000000000001e-31  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.019749  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 258 aa  135  7.000000000000001e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  34.3 
 
 		 256 aa  135  7.000000000000001e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 268 aa  135  7.000000000000001e-31  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 254 aa  133  1.9999999999999998e-30  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  37.87 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3270  DeoR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 253 aa  132  3.9999999999999996e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7919  transcriptional regulator, DeoR family  35.47 
 
 		 267 aa  132  3.9999999999999996e-30  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  34.78 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  34.65 
 
 		 248 aa  132  5e-30  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  34.65 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  34.22 
 
 		 278 aa  132  6e-30  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0092  transcriptional regulator DeoR family  34.67 
 
 		 256 aa  132  6e-30  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2902  DeoR family transcriptional regulator  34.07 
 
 		 254 aa  131  9e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  36.13 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  33.77 
 
 		 252 aa  130  2.0000000000000002e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2109  DeoR family transcriptional regulator  30.7 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2377  DeoR family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.167661 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 		 253 aa  130  2.0000000000000002e-29  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_004310  BR0199  glycerol-3-phosphate transcriptional regulator  32.44 
 
 		 263 aa  130  3e-29  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.464707  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0457  glycerol-3-phosphate regulon repressor  30.7 
 
 		 259 aa  130  3e-29  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0191  glycerol-3-phosphate regulon repressor  32.44 
 
 		 314 aa  129  4.0000000000000003e-29  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.276628  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0682  regulatory protein DeoR  32.75 
 
 		 247 aa  129  5.0000000000000004e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.922623  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  34.05 
 
 		 266 aa  128  8.000000000000001e-29  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2219  regulatory protein DeoR  34.73 
 
 		 256 aa  128  8.000000000000001e-29  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  hitchhiker  0.0075585  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7075  DeoR family transcriptional regulator  33.04 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  34.6 
 
 		 258 aa  128  1.0000000000000001e-28  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  37.87 
 
 		 254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2205  DeoR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  34.35 
 
 		 260 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4414  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.43 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4258  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.43 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4303  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.43 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.922526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4236  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.43 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.627699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4349  glycerol-3-phosphate regulon repressor  31.43 
 
 		 267 aa  126  3e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_1919  transcriptional regulator, DeoR family  32.77 
 
 		 252 aa  125  6e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  unclonable  0.00000000000354716  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  35 
 
 		 264 aa  125  6e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0785  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 251 aa  125  7e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.162222 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 266 aa  125  8.000000000000001e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03769  predicted DNA-binding transcriptional regulator  30.49 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.723341  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4102  transcriptional regulator, DeoR family  30.49 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03718  hypothetical protein  30.49 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.658927  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4269  DeoR family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 261 aa  124  1e-27  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5331  transcriptional regulator, DeoR/GntR family  30.49 
 
 		 269 aa  124  1e-27  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.464213 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3264  DeoR family transcriptional regulator  33.19 
 
 		 251 aa  124  2e-27  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.50505  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5369  transcriptional regulator, DeoR family  36.6 
 
 		 268 aa  124  2e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3108  DeoR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 254 aa  123  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4407  DeoR family transcriptional regulator  30.08 
 
 		 261 aa  123  3e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3032  DeoR family transcriptional regulator  32.92 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3069  transcriptional regulator, DeoR family  32.64 
 
 		 254 aa  122  5e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1590  DeoR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3139  transcriptional regulator, DeoR family  32.92 
 
 		 255 aa  122  5e-27  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0488  DeoR family transcriptional regulator  35.19 
 
 		 256 aa  122  5e-27  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.627164 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0953  transcriptional regulator, DeoR family  32.67 
 
 		 255 aa  122  6e-27  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  33.04 
 
 		 252 aa  122  6e-27  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3124  DeoR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 254 aa  122  6e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.0605743 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 254 aa  122  7e-27  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5209  transcriptional regulator, DeoR family  32.44 
 
 		 261 aa  122  7e-27  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.422684 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3228  DeoR family transcriptional regulator  32.64 
 
 		 254 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3040  transcriptional regulator, DeoR family  32.64 
 
 		 254 aa  122  8e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  32.07 
 
 		 289 aa  121  9.999999999999999e-27  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 260 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 		 253 aa  121  9.999999999999999e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  33.62 
 
 		 257 aa  121  9.999999999999999e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5344  transcriptional regulator, DeoR family  31.3 
 
 		 290 aa  121  9.999999999999999e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0184  transcriptional regulator, DeoR family  30.95 
 
 		 256 aa  121  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2873  DeoR family transcriptional regulator  32.5 
 
 		 255 aa  120  1.9999999999999998e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  33.91 
 
 		 253 aa  120  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0566  DeoR family transcriptional regulator  35.5 
 
 		 248 aa  120  1.9999999999999998e-26  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2259  DeoR family transcriptional regulator  34.7 
 
 		 251 aa  120  1.9999999999999998e-26  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.378185  hitchhiker  0.000108312 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>