More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Athe_0842 on replicon NC_012034
Organism: Anaerocellum thermophilum DSM 6725



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 		 254 aa  508  1e-143  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  44.4 
 
 		 258 aa  205  6e-52  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3215  transcriptional regulator, DeoR family  42.58 
 
 		 252 aa  189  2.9999999999999997e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  45.06 
 
 		 257 aa  188  7e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  40.94 
 
 		 258 aa  182  5.0000000000000004e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  41.04 
 
 		 253 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  40.78 
 
 		 252 aa  179  4e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  40.16 
 
 		 252 aa  178  8e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  40.39 
 
 		 252 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  40.39 
 
 		 252 aa  176  2e-43  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  40.39 
 
 		 252 aa  176  2e-43  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 252 aa  177  2e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  40.39 
 
 		 252 aa  176  2e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  40 
 
 		 252 aa  176  3e-43  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  40.77 
 
 		 274 aa  173  2.9999999999999996e-42  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  36.9 
 
 		 257 aa  172  3.9999999999999995e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2055  DeoR family transcriptional regulator  39.22 
 
 		 252 aa  171  2e-41  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0500413 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  39.68 
 
 		 254 aa  166  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 257 aa  167  2e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  36.97 
 
 		 264 aa  166  2e-40  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  38.3 
 
 		 267 aa  167  2e-40  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  37.55 
 
 		 255 aa  162  6e-39  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  38.72 
 
 		 256 aa  161  9e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 258 aa  161  1e-38  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  40.08 
 
 		 250 aa  161  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  35.86 
 
 		 260 aa  160  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5444  transcriptional regulator, DeoR family  35.46 
 
 		 248 aa  155  5.0000000000000005e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  35.71 
 
 		 267 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  35.63 
 
 		 258 aa  152  4e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  33.73 
 
 		 256 aa  152  5e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  35.69 
 
 		 257 aa  152  5.9999999999999996e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 254 aa  151  8.999999999999999e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  34.82 
 
 		 250 aa  150  2e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  35.08 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  35.34 
 
 		 260 aa  149  5e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  31.37 
 
 		 257 aa  149  6e-35  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  34.82 
 
 		 252 aa  147  1.0000000000000001e-34  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2802  DeoR family transcriptional regulator  35.04 
 
 		 262 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.364979  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3725  transcriptional regulator, DeoR family  34.59 
 
 		 276 aa  146  2.0000000000000003e-34  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5399  DeoR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 242 aa  146  3e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.054992  normal  0.41602 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2701  transcriptional regulator  37.83 
 
 		 270 aa  145  4.0000000000000006e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.166109  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  32.05 
 
 		 254 aa  145  5e-34  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  31.89 
 
 		 253 aa  145  6e-34  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3114  DeoR family transcriptional regulator  35.22 
 
 		 258 aa  145  6e-34  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0283003  hitchhiker  0.000123192 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  31.35 
 
 		 254 aa  144  1e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  30.4 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  30.4 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.4 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.4 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3170  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.06 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  30.4 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2991  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.06 
 
 		 257 aa  143  2e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.4 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.4 
 
 		 269 aa  144  2e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02557  DNA-bindng transcriptional repressor  33.06 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.632125  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.13 
 
 		 258 aa  143  3e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0982  transcriptional regulator, DeoR family  33.06 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.015396  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1005  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.06 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0173868  hitchhiker  0.000000410448 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2988  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.47 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.192742  normal  0.0479774 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  35.08 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3146  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.47 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.435865  normal  0.0282064 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  30.4 
 
 		 269 aa  143  3e-33  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3039  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.47 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00817735 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3023  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.47 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.471381  hitchhiker  0.00000157031 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02522  hypothetical protein  33.06 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.810713  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2843  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.06 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  36.05 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.47 
 
 		 257 aa  143  3e-33  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.06 
 
 		 257 aa  142  4e-33  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  34.84 
 
 		 253 aa  142  5e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  31.2 
 
 		 269 aa  142  8e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  33.92 
 
 		 265 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  35.24 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 252 aa  140  1.9999999999999998e-32  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  33.87 
 
 		 254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1243  DeoR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 260 aa  140  1.9999999999999998e-32  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2830  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32.66 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000942539 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  30.86 
 
 		 282 aa  140  3e-32  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  37.93 
 
 		 251 aa  140  3e-32  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  34.89 
 
 		 264 aa  140  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  32.76 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28620  transcriptional regulator, DeoR family  36.32 
 
 		 253 aa  140  3e-32  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0973174  normal  0.0755211 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1417  transcriptional regulator, DeoR family  31.91 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.381342 
 
 
-
 
NC_005945  BAS1242  DeoR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1218  DeoR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.46178  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1220  DeoR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.373784  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1343  DeoR family transcriptional regulator  31.91 
 
 		 260 aa  139  3.9999999999999997e-32  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 288 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1442  DeoR family transcriptional regulator  32.17 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0258355  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1483  transcriptional regulator, DeoR family  32.17 
 
 		 260 aa  139  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3964  transcriptional regulator, DeoR family  32.3 
 
 		 260 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1380  transcriptional regulator, DeoR family  32.3 
 
 		 260 aa  138  8.999999999999999e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3773  DeoR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 268 aa  138  8.999999999999999e-32  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.933723  normal  0.169904 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  33.85 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  33.85 
 
 		 257 aa  137  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0718  DeoR family transcriptional regulator  36.78 
 
 		 254 aa  137  1e-31  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000222584  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  33.85 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  29.6 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  33.85 
 
 		 257 aa  138  1e-31  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 261 aa  137  2e-31  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>