More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_3725 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013421  Pecwa_3725  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
276 aa  570  1.0000000000000001e-162  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.355951  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3264  DeoR family transcriptional regulator  47.45 
 
 
269 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3397  DeoR family transcriptional regulator  47.45 
 
 
269 aa  226  4e-58  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  34.59 
 
 
258 aa  163  3e-39  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1446  L-fucose operon activator  35.22 
 
 
250 aa  154  1e-36  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000392431  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  34.48 
 
 
254 aa  140  1.9999999999999998e-32  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  34.59 
 
 
254 aa  140  3e-32  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2030  DeoR family transcriptional regulator  32.8 
 
 
258 aa  136  3.0000000000000003e-31  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  31.05 
 
 
250 aa  135  9.999999999999999e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3204  DNA-binding transcriptional activator FucR  34.87 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.25899  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3141  DNA-binding transcriptional activator FucR  34.87 
 
 
236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3124  DNA-binding transcriptional activator FucR  34.87 
 
 
239 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0169368  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3304  DNA-binding transcriptional activator FucR  34.87 
 
 
236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3189  DNA-binding transcriptional activator FucR  34.87 
 
 
236 aa  131  1.0000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  30.92 
 
 
274 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02656  DNA-binding transcriptional activator  33.89 
 
 
243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0883  transcriptional regulator, DeoR family  33.89 
 
 
243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0907  DNA-binding transcriptional activator FucR  33.89 
 
 
243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3111  DNA-binding transcriptional activator FucR  33.89 
 
 
243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00000000158566  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2949  DNA-binding transcriptional activator FucR  33.89 
 
 
243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000000516509  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02617  hypothetical protein  33.89 
 
 
243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2946  DNA-binding transcriptional activator FucR  33.89 
 
 
243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  hitchhiker  0.000344425  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4069  DNA-binding transcriptional activator FucR  33.89 
 
 
243 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00240232  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2486  transcriptional regulator, DeoR family  33.72 
 
 
287 aa  127  2.0000000000000002e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.382458  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  33.21 
 
 
253 aa  126  3e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3405  DNA-binding transcriptional activator FucR  34.45 
 
 
238 aa  126  3e-28  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 
260 aa  126  3e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1187  DeoR family transcriptional regulator  32.79 
 
 
257 aa  126  5e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0889  DeoR family transcriptional regulator  31.84 
 
 
348 aa  123  3e-27  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  35.85 
 
 
258 aa  123  4e-27  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2563  transcriptional regulator, DeoR family  31.03 
 
 
254 aa  122  6e-27  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.488958  normal  0.0207401 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0770  DeoR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0577  DeoR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.799332  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0689  DeoR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.150594  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2090  DeoR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1995  DeoR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1642  DeoR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
252 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
266 aa  120  1.9999999999999998e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2850  transcriptional regulator, DeoR family  30.89 
 
 
262 aa  120  1.9999999999999998e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.115087  normal  0.605366 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2797  regulatory protein DeoR  32.65 
 
 
254 aa  120  1.9999999999999998e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3818  transcriptional regulator, DeoR family  32.79 
 
 
250 aa  120  3e-26  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00596962  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45150  putative transcriptional regulator  29.78 
 
 
258 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4635  DeoR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
266 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  33.06 
 
 
254 aa  119  3.9999999999999996e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5164  DeoR family transcriptional regulator  29.81 
 
 
252 aa  119  3.9999999999999996e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.133552 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0505  DeoR family transcriptional regulator  30.45 
 
 
407 aa  119  6e-26  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1796  lactose phosphotransferase system repressor  33.88 
 
 
251 aa  118  9e-26  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3746  DeoR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
250 aa  118  9e-26  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.193634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
254 aa  118  9e-26  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01739  predicted DNA-binding transcriptional regulator  31.3 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3464  DeoR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.060448  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3728  transcriptional regulator, DeoR family  31.98 
 
 
250 aa  117  9.999999999999999e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.0938200000000001e-23 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1854  DeoR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0330559  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1862  DeoR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.553225  hitchhiker  0.0000200167 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01727  hypothetical protein  31.3 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2494  transcriptional regulator, DeoR family  31.3 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3446  DeoR family transcriptional regulator  29.32 
 
 
252 aa  118  9.999999999999999e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1872  transcriptional regulator, DeoR family  31.3 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0191084  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1421  DeoR family transcriptional regulator  30.89 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1994  DeoR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
252 aa  117  1.9999999999999998e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1484  transcriptional regulator, DeoR family  31.98 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.502368  normal  0.0131376 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3484  DeoR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
250 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2129  transcriptional regulator, DeoR family  31.71 
 
 
255 aa  117  1.9999999999999998e-25  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0932716  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2396  DeoR family transcriptional regulator  32.53 
 
 
249 aa  117  1.9999999999999998e-25  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.71278  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  30.19 
 
 
253 aa  117  1.9999999999999998e-25  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3478  DeoR family transcriptional regulator  31.98 
 
 
250 aa  117  3e-25  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0418325  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  32.46 
 
 
257 aa  116  3e-25  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3769  transcriptional regulator, DeoR family  31.98 
 
 
250 aa  116  5e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000230388  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1348  lactose phosphotransferase system repressor  30.28 
 
 
247 aa  116  5e-25  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0375  DeoR family transcriptional regulator  29.43 
 
 
252 aa  116  5e-25  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.432501  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03230  transcriptional regulator, DeoR family  30.8 
 
 
257 aa  115  6e-25  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  7.65196e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2151  DeoR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
261 aa  115  6e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.760268  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4993  DeoR family transcriptional regulator  29.43 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.640953  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3092  DeoR family transcriptional regulator  29.43 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.872302  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5275  DeoR family transcriptional regulator  29.43 
 
 
252 aa  115  6.9999999999999995e-25  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3215  transcriptional regulator, DeoR family  28.41 
 
 
252 aa  115  8.999999999999998e-25  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1936  lactose phosphotransferase system repressor  32.51 
 
 
258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.673749  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  34.5 
 
 
258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  34.5 
 
 
258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  34.5 
 
 
258 aa  115  1.0000000000000001e-24  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3377  transcriptional regulator, DeoR family  31.15 
 
 
257 aa  114  2.0000000000000002e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1877  DeoR family transcriptional regulator  29.66 
 
 
251 aa  114  2.0000000000000002e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.170195 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  32.02 
 
 
267 aa  113  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3565  DeoR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
250 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3848  DeoR family transcriptional regulator  31.58 
 
 
250 aa  112  6e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.002362  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1687  DeoR family transcriptional regulator  29.92 
 
 
269 aa  112  6e-24  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00757243  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  31.8 
 
 
253 aa  112  8.000000000000001e-24  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2761  transcriptional regulator, DeoR family  30.92 
 
 
257 aa  112  1.0000000000000001e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  31.73 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2055  DeoR family transcriptional regulator  30.61 
 
 
252 aa  111  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0500413 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2651  transcriptional regulator, DeoR family  30.95 
 
 
250 aa  111  1.0000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32060  transcriptional regulator of sugar metabolism  32.8 
 
 
262 aa  111  2.0000000000000002e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.134085  normal  0.228776 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4954  transcriptional regulator, DeoR family  30.15 
 
 
283 aa  110  2.0000000000000002e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.461137  normal  0.587881 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  31.23 
 
 
264 aa  110  2.0000000000000002e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  27.76 
 
 
257 aa  110  3e-23  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3258  DeoR family transcriptional regulator  29.5 
 
 
251 aa  110  3e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000943791  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  31.3 
 
 
254 aa  109  4.0000000000000004e-23  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  32.17 
 
 
256 aa  109  6e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  30.12 
 
 
254 aa  108  9.000000000000001e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>