More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_5910 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  100 
 
 
254 aa  495  1e-139  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  54.18 
 
 
252 aa  235  6e-61  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2435  transcriptional regulator, DeoR family  53.36 
 
 
253 aa  234  8e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0079946  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  49.61 
 
 
258 aa  223  3e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  50.78 
 
 
256 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  47.01 
 
 
278 aa  204  9e-52  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  46.54 
 
 
261 aa  203  2e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  47.88 
 
 
261 aa  199  3e-50  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6212  transcriptional regulator, DeoR family  46.33 
 
 
261 aa  198  7e-50  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  0.761019 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2162  transcriptional regulator, DeoR family  45.04 
 
 
261 aa  186  3e-46  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  45.04 
 
 
261 aa  184  1.0000000000000001e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  44.27 
 
 
261 aa  181  7e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  40.89 
 
 
257 aa  169  5e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1357  transcriptional regulator, DeoR family  41.44 
 
 
263 aa  167  1e-40  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403585 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  39.44 
 
 
267 aa  166  2.9999999999999998e-40  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01920  transcriptional regulator of sugar metabolism  40.15 
 
 
261 aa  163  2.0000000000000002e-39  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16690  transcriptional regulator, DeoR family  44.4 
 
 
261 aa  162  5.0000000000000005e-39  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  40.25 
 
 
254 aa  157  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  40.23 
 
 
267 aa  155  4e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  40.24 
 
 
256 aa  155  5.0000000000000005e-37  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  37.25 
 
 
257 aa  155  8e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  42.4 
 
 
258 aa  153  2.9999999999999998e-36  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  36.71 
 
 
274 aa  152  4e-36  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  34.9 
 
 
257 aa  151  1e-35  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  40.57 
 
 
256 aa  151  1e-35  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2392  transcriptional regulator, DeoR family  35.37 
 
 
253 aa  149  4e-35  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  36.65 
 
 
258 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  36.65 
 
 
258 aa  149  5e-35  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  36.65 
 
 
258 aa  149  5e-35  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  37.01 
 
 
257 aa  149  6e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  36.47 
 
 
284 aa  148  9e-35  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  37.61 
 
 
251 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  37.55 
 
 
250 aa  146  2.0000000000000003e-34  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2323  transcriptional regulator, DeoR family  39.22 
 
 
266 aa  147  2.0000000000000003e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4850  transcriptional regulator, DeoR family  38.82 
 
 
255 aa  146  4.0000000000000006e-34  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.786631  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0890  transcriptional regulator, DeoR family  43.4 
 
 
260 aa  145  7.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.390832  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
258 aa  144  2e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  40 
 
 
264 aa  144  2e-33  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
261 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
261 aa  142  5e-33  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4905  transcriptional regulator, DeoR family  40.96 
 
 
289 aa  142  6e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.23552  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  33.86 
 
 
254 aa  142  7e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  36.22 
 
 
258 aa  141  9e-33  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  34.66 
 
 
261 aa  140  9.999999999999999e-33  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2660  transcriptional regulator, DeoR family  39.47 
 
 
254 aa  139  3e-32  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.360297  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  41.15 
 
 
266 aa  139  3.9999999999999997e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  36.86 
 
 
260 aa  138  7e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  36.03 
 
 
256 aa  137  1e-31  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24390  transcriptional regulator of sugar metabolism  38.61 
 
 
284 aa  137  1e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0280165  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0750  DeoR family transcriptional regulator  37.7 
 
 
259 aa  137  1e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.6006 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  34.68 
 
 
254 aa  136  3.0000000000000003e-31  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  35.06 
 
 
260 aa  135  5e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  35.38 
 
 
257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  36.25 
 
 
253 aa  133  1.9999999999999998e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0082  DeoR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0376166  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0091  DeoR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.316718  normal  0.0391482 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0072  DeoR family transcriptional regulator  37.25 
 
 
255 aa  134  1.9999999999999998e-30  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.314417  normal  0.278782 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  38.28 
 
 
264 aa  133  3e-30  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_14330  transcriptional regulator, DeoR family  38.15 
 
 
282 aa  133  3e-30  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  35 
 
 
257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  35 
 
 
257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  35 
 
 
257 aa  132  3.9999999999999996e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  35 
 
 
257 aa  132  5e-30  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0842  transcriptional regulator, DeoR family  33.87 
 
 
254 aa  132  6e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000306507  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  36.76 
 
 
264 aa  132  6e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1535  transcriptional regulator, DeoR family  40.76 
 
 
253 aa  132  6.999999999999999e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.556819  hitchhiker  0.00734434 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  37.07 
 
 
253 aa  131  7.999999999999999e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0478  DeoR family transcriptional regulator  35.54 
 
 
254 aa  130  2.0000000000000002e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  34.26 
 
 
256 aa  130  2.0000000000000002e-29  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3191  transcriptional regulator, DeoR family  35.86 
 
 
252 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.932095  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02920  transcriptional regulator of sugar metabolism  37.94 
 
 
276 aa  129  5.0000000000000004e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3574  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.2 
 
 
257 aa  128  7.000000000000001e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.333034 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3731  regulatory protein, DeoR  35.69 
 
 
254 aa  128  7.000000000000001e-29  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  34 
 
 
288 aa  128  8.000000000000001e-29  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.99 
 
 
269 aa  128  8.000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  33.46 
 
 
255 aa  128  9.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2691  DeoR family transcriptional regulator  37.87 
 
 
254 aa  128  1.0000000000000001e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.134445  hitchhiker  0.00149692 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3724  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.81 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3831  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.81 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.852277 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3893  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.81 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.256044  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3790  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.81 
 
 
252 aa  127  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  32.13 
 
 
266 aa  127  2.0000000000000002e-28  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  36.99 
 
 
253 aa  127  2.0000000000000002e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3057  regulatory protein, DeoR  35.34 
 
 
278 aa  126  3e-28  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.111728  normal  0.668147 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  32.26 
 
 
252 aa  126  3e-28  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.47 
 
 
269 aa  126  3e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4756  transcriptional regulator, DeoR family  35.94 
 
 
264 aa  125  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.275318  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0096  DeoR family transcriptional regulator  38.3 
 
 
259 aa  125  5e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.12978 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3347  DeoR family transcriptional regulator  34.6 
 
 
252 aa  125  5e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3715  DNA-binding transcriptional repressor GlpR  32.02 
 
 
252 aa  125  6e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2386  DeoR family transcriptional regulator  36.59 
 
 
268 aa  125  6e-28  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.216225  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  33.47 
 
 
269 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  33.47 
 
 
269 aa  125  7e-28  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 
269 aa  125  7e-28  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.47 
 
 
269 aa  125  7e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0618  transcriptional regulator, DeoR family  40.25 
 
 
266 aa  125  7e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.47 
 
 
269 aa  125  7e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.47 
 
 
269 aa  125  7e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.47 
 
 
269 aa  125  7e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3957  DNA-bindng transcriptional repressor SrlR  33.47 
 
 
257 aa  125  9e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>