More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Acid345_0656 on replicon NC_008009
Organism: Candidatus Koribacter versatilis Ellin345



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008009  Acid345_0656  DeoR family transcriptional regulator  100 
 
 		 284 aa  585  1e-166  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.936277  normal  0.637392 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2460  transcriptional regulator, DeoR family  50.76 
 
 		 264 aa  243  1.9999999999999999e-63  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.18963  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1167  transcriptional regulator, DeoR family  39.06 
 
 		 256 aa  164  1.0000000000000001e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0659  DeoR family transcriptional regulator  39.53 
 
 		 288 aa  155  6e-37  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0255217  normal  0.62024 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0893  transcriptional regulator, DeoR family  37.16 
 
 		 261 aa  154  2e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.151374  normal  0.226851 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2362  transcriptional regulator, DeoR family  38.35 
 
 		 261 aa  152  7e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.12916  normal  0.172343 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0608  GntR family transcriptional regulator  37.97 
 
 		 254 aa  152  8e-36  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2390  transcriptional regulator, DeoR family  38.74 
 
 		 258 aa  150  2e-35  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.248992  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3128  transcriptional regulator, DeoR family  37.45 
 
 		 255 aa  149  5e-35  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5910  transcriptional regulator, DeoR family  36.47 
 
 		 254 aa  148  1.0000000000000001e-34  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.874866 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0289  DeoR family transcriptional regulator  38.08 
 
 		 261 aa  147  1.0000000000000001e-34  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.228369 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0248  DeoR family transcriptional regulator  37.31 
 
 		 261 aa  148  1.0000000000000001e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.974288  normal  0.128196 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1716  transcriptional regulator, DeoR family  35.43 
 
 		 252 aa  147  2.0000000000000003e-34  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.467325  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3818  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  37.94 
 
 		 258 aa  146  4.0000000000000006e-34  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.892973  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6212  transcriptional regulator, DeoR family  36.02 
 
 		 261 aa  144  1e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.464717  normal  0.761019 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3908  DeoR family transcriptional regulator  36.4 
 
 		 267 aa  144  2e-33  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  hitchhiker  0.00814425  normal  0.0123745 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0568  regulatory protein DeoR  34 
 
 		 254 aa  142  4e-33  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.250668  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0408  transcriptional regulator, DeoR family  32.67 
 
 		 257 aa  142  5e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.237553  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0995  DeoR family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.775359  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0943  transcriptional repressor AgaR  35.38 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3377  DeoR-family regulatory protein  35.38 
 
 		 258 aa  142  7e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.365901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2724  DeoR family transcriptional regulator  37.1 
 
 		 260 aa  141  9.999999999999999e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1880  transcriptional regulator, DeoR family  35.46 
 
 		 254 aa  141  9.999999999999999e-33  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3571  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.42 
 
 		 269 aa  141  9.999999999999999e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.557659 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7844  transcriptional regulator, DeoR family  37.18 
 
 		 255 aa  140  1.9999999999999998e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0958205  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3053  transcriptional regulator, DeoR family  36.32 
 
 		 257 aa  140  1.9999999999999998e-32  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.538096  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5798  transcriptional regulator, DeoR family  38.4 
 
 		 252 aa  140  3e-32  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.159529 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2807  DeoR family transcriptional regulator  37.7 
 
 		 260 aa  140  3e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.807975  normal  0.355136 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2385  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  34.83 
 
 		 269 aa  137  1e-31  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02996  DNA-binding transcriptional dual regulator  33.33 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0574  transcriptional regulator, DeoR family  33.33 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4445  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.33 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3428  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.33 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02947  hypothetical protein  33.33 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3321  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.33 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0569  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  33.33 
 
 		 269 aa  137  2e-31  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2435  transcriptional regulator, DeoR family  35.94 
 
 		 253 aa  137  3.0000000000000003e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  decreased coverage  0.0079946  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3611  DNA-binding transcriptional regulator AgaR  32.73 
 
 		 269 aa  136  4e-31  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0312  DeoR family transcriptional regulator  36.33 
 
 		 264 aa  136  4e-31  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.812153  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0146  transcriptional regulator, DeoR family  36.71 
 
 		 250 aa  136  5e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000230525  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3849  DeoR family transcriptional regulator  34.66 
 
 		 257 aa  135  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.697136 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3457  DeoR family transcriptional regulator  35.89 
 
 		 265 aa  135  7.000000000000001e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0252866 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1714  transcriptional regulator, DeoR family  38.98 
 
 		 256 aa  135  7.000000000000001e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  decreased coverage  0.0085463  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5087  transcriptional regulator, DeoR family  34.88 
 
 		 254 aa  135  7.000000000000001e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1059  transcriptional regulator, DeoR family  35.8 
 
 		 253 aa  135  7.000000000000001e-31  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0063  transcriptional regulator, DeoR family  34 
 
 		 253 aa  134  9.999999999999999e-31  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.366513  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1193  GlpR family transcriptional regulator  36.26 
 
 		 260 aa  135  9.999999999999999e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.604361 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_16690  transcriptional regulator, DeoR family  36.26 
 
 		 261 aa  135  9.999999999999999e-31  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3309  transcriptional regulator, DeoR family  35.92 
 
 		 260 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.006875  hitchhiker  0.00121126 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2162  transcriptional regulator, DeoR family  33.59 
 
 		 261 aa  134  1.9999999999999998e-30  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2613  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 257 aa  134  1.9999999999999998e-30  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000333133  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1179  DeoR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 254 aa  133  3.9999999999999996e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.698203  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2190  transcriptional regulator, DeoR family  33.98 
 
 		 253 aa  133  3.9999999999999996e-30  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0642  DeoR family transcriptional regulator  36.71 
 
 		 256 aa  133  3.9999999999999996e-30  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  decreased coverage  0.000291189  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2536  DeoR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2603  DeoR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.252662  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2702  DeoR family transcriptional regulator  35.14 
 
 		 261 aa  132  5e-30  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0011  DeoR family transcriptional regulator  36.76 
 
 		 258 aa  132  6e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000425621  unclonable  0.00000000668451 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0698  DeoR family transcriptional regulator  32.56 
 
 		 266 aa  132  6.999999999999999e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00000315133  hitchhiker  0.0000015046 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3449  galactitol utilization operon repressor  33.6 
 
 		 257 aa  130  2.0000000000000002e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0997  transcriptional regulator, DeoR family  36.33 
 
 		 267 aa  130  2.0000000000000002e-29  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  0.566799 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1875  transcriptional regulator, DeoR family  30.45 
 
 		 259 aa  130  2.0000000000000002e-29  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_01920  transcriptional regulator of sugar metabolism  34.32 
 
 		 261 aa  130  3e-29  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3451  galactitol utilization operon repressor  33.6 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.717131  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3520  galactitol utilization operon repressor  33.6 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3557  galactitol utilization operon repressor  33.6 
 
 		 257 aa  130  3e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1079  DeoR family transcriptional regulator  35.29 
 
 		 251 aa  130  3e-29  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5273  transcriptional regulator, DeoR family  33.85 
 
 		 253 aa  130  3e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.408646  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1357  transcriptional regulator, DeoR family  35.38 
 
 		 263 aa  129  4.0000000000000003e-29  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000403585 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2500  transcriptional regulator, DeoR family  33.46 
 
 		 253 aa  129  4.0000000000000003e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.134213  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3617  galactitol utilization operon repressor  33.6 
 
 		 257 aa  130  4.0000000000000003e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3507  regulatory protein DeoR  32.27 
 
 		 254 aa  129  4.0000000000000003e-29  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0720  DeoR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 253 aa  129  7.000000000000001e-29  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.528248  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4225  transcriptional regulator, DeoR family  35.47 
 
 		 253 aa  128  1.0000000000000001e-28  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.320526  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1701  DeoR family transcriptional regulator  33.2 
 
 		 264 aa  127  2.0000000000000002e-28  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.596529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0712  transcriptional regulator, DeoR family  32.14 
 
 		 258 aa  127  2.0000000000000002e-28  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2577  DeoR family transcriptional regulator  32.27 
 
 		 256 aa  127  2.0000000000000002e-28  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2155  transcriptional regulator, DeoR family  32.46 
 
 		 278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1854  regulatory protein, DeoR  32.41 
 
 		 252 aa  126  5e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.0000517285  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2226  galactitol utilization operon repressor  33.6 
 
 		 257 aa  126  5e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2378  galactitol utilization operon repressor  33.6 
 
 		 257 aa  126  5e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1148  galactitol utilization operon repressor  33.6 
 
 		 257 aa  126  5e-28  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1557  DeoR family transcriptional regulator  33.6 
 
 		 257 aa  126  5e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.839673 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3069  galactitol utilization operon repressor  33.6 
 
 		 259 aa  125  6e-28  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.377342  hitchhiker  0.0000149488 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0974  galactitol utilization operon repressor  33.6 
 
 		 259 aa  125  6e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.430087 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5129  transcriptional regulator, DeoR family  33.6 
 
 		 254 aa  125  8.000000000000001e-28  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0575  DeoR family transcriptional regulator  32.67 
 
 		 274 aa  125  8.000000000000001e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000140104  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0729  transcriptional regulator, DeoR family  33.2 
 
 		 256 aa  125  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000103564 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0922  transcriptional regulator, DeoR family  31.1 
 
 		 248 aa  124  1e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.44653  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3738  DeoR family transcriptional regulator  32.55 
 
 		 266 aa  125  1e-27  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.387174  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4698  transcriptional regulator, DeoR family  36.9 
 
 		 258 aa  124  1e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00604276  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0907  transcriptional regulator of DeoR family protein  30.43 
 
 		 253 aa  125  1e-27  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  0.238467 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1861  transcriptional regulator, DeoR family  32.14 
 
 		 261 aa  124  2e-27  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7307  transcriptional regulator, DeoR family  35.8 
 
 		 266 aa  124  2e-27  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0131  DeoR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 253 aa  124  2e-27  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5369  transcriptional regulator, DeoR family  33.47 
 
 		 268 aa  123  4e-27  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.268088 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2425  DeoR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2470  DeoR family transcriptional regulator  32.81 
 
 		 258 aa  122  6e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.445406  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2464  DeoR family transcriptional regulator  34.17 
 
 		 258 aa  122  7e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.21816  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2177  transcriptional regulator, DeoR family  30.83 
 
 		 253 aa  122  9e-27  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0975605  hitchhiker  0.00125188 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>